MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 16409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021176	TTCG	2	8	3388952	3388959	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11502	NC_021176	T	6	6	3388999	3389004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_021176	AGA	2	6	3389018	3389023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_021176	CA	3	6	3389028	3389033	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11505	NC_021176	T	6	6	3391059	3391064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_021176	CAT	2	6	3391087	3391092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_021176	TTC	2	6	3391107	3391112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_021176	CA	3	6	3393744	3393749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11509	NC_021176	CAT	2	6	3393779	3393784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_021176	TCA	2	6	3393790	3393795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_021176	AATG	2	8	3393796	3393803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_021176	CTT	2	6	3393814	3393819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_021176	GCT	2	6	3393844	3393849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_021176	GTT	2	6	3393922	3393927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_021176	GCA	2	6	3393930	3393935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_021176	CATT	2	8	3394085	3394092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11517	NC_021176	A	7	7	3394110	3394116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_021176	ATT	2	6	3394121	3394126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_021176	GAA	2	6	3394148	3394153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_021176	AG	3	6	3394156	3394161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_021176	CCG	2	6	3394193	3394198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11522	NC_021176	AATA	2	8	3394201	3394208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_021176	ATTT	2	8	3394234	3394241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_021176	ACA	2	6	3394271	3394276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11525	NC_021176	A	6	6	3394312	3394317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_021176	CGC	2	6	3394329	3394334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11527	NC_021176	TGGC	2	8	3394416	3394423	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11528	NC_021176	T	6	6	3395710	3395715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_021176	ATT	2	6	3396895	3396900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_021176	AAG	2	6	3396961	3396966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_021176	T	6	6	3399044	3399049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_021176	TGA	2	6	3399090	3399095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_021176	TGGC	2	8	3399096	3399103	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11534	NC_021176	AAT	2	6	3399112	3399117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_021176	GCC	2	6	3399151	3399156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11536	NC_021176	CTG	2	6	3399285	3399290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_021176	AAAT	2	8	3399358	3399365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_021176	AAG	2	6	3399393	3399398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_021176	CAG	3	9	3399401	3399409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11540	NC_021176	CAG	3	9	3399430	3399438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_021176	GAC	2	6	3399488	3399493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_021176	CTGG	2	8	3399592	3399599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11543	NC_021176	TAAA	2	8	3399612	3399619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_021176	TCA	2	6	3399642	3399647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_021176	CAG	2	6	3399716	3399721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_021176	ATC	2	6	3399734	3399739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_021176	GTC	2	6	3399809	3399814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_021176	CG	3	6	3399829	3399834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11549	NC_021176	GC	3	6	3399869	3399874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11550	NC_021176	ACCGCA	2	12	3399938	3399949	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11551	NC_021176	TTC	2	6	3399980	3399985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_021176	GGT	2	6	3400000	3400005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_021176	ATT	2	6	3400076	3400081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_021176	CGC	2	6	3400183	3400188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11555	NC_021176	GCT	2	6	3400243	3400248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_021176	ATG	2	6	3400292	3400297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_021176	AG	3	6	3400316	3400321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_021176	T	6	6	3400406	3400411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_021176	GGC	2	6	3400412	3400417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_021176	GCT	2	6	3400519	3400524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_021176	CTG	2	6	3400536	3400541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_021176	A	7	7	3400553	3400559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_021176	CTT	2	6	3400564	3400569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_021176	TATC	2	8	3400660	3400667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11565	NC_021176	CCT	2	6	3400713	3400718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11566	NC_021176	GAA	2	6	3400727	3400732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_021176	TAC	2	6	3400820	3400825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11568	NC_021176	AAT	2	6	3400829	3400834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_021176	GCTTTA	2	12	3400872	3400883	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11570	NC_021176	GAA	2	6	3400949	3400954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_021176	TGAT	2	8	3401082	3401089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_021176	GGA	2	6	3401093	3401098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_021176	ATG	2	6	3401106	3401111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_021176	GGC	2	6	3401294	3401299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_021176	ATCG	2	8	3401318	3401325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11576	NC_021176	A	6	6	3401336	3401341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_021176	TGC	2	6	3401373	3401378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11578	NC_021176	CAA	2	6	3401389	3401394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11581	NC_021176	TTG	2	6	3401866	3401871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_021176	AAG	2	6	3401896	3401901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_021176	GATT	2	8	3401908	3401915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_021176	GTTA	2	8	3401996	3402003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_021176	G	6	6	3402056	3402061	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_021176	TTA	2	6	3402078	3402083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_021176	TCT	2	6	3402088	3402093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11588	NC_021176	TTC	2	6	3402105	3402110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11589	NC_021176	GTT	2	6	3402111	3402116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_021176	CAT	2	6	3402138	3402143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11591	NC_021176	C	6	6	3402209	3402214	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11592	NC_021176	GAT	2	6	3402266	3402271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_021176	T	6	6	3402287	3402292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_021176	TGG	2	6	3402296	3402301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_021176	TAA	2	6	3402640	3402645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_021176	CT	3	6	3402717	3402722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11597	NC_021176	TATT	2	8	3402747	3402754	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_021176	ATT	2	6	3402859	3402864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_021176	ACAG	2	8	3402865	3402872	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11600	NC_021176	AAATA	2	10	3402942	3402951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_021176	TTA	2	6	3402997	3403002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_021176	GTAA	2	8	3403008	3403015	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_021176	AT	3	6	3403068	3403073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_021176	TA	3	6	3403125	3403130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_021176	AAT	2	6	3403136	3403141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_021176	GGC	2	6	3403156	3403161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11607	NC_021176	GAGT	2	8	3403166	3403173	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_021176	AG	3	6	3403378	3403383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_021176	ACC	2	6	3403528	3403533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11610	NC_021176	GCC	2	6	3403542	3403547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11611	NC_021176	GTG	2	6	3403589	3403594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_021176	CT	3	6	3403761	3403766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11613	NC_021176	AGT	2	6	3403771	3403776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_021176	ACC	2	6	3403909	3403914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11615	NC_021176	GCC	2	6	3403923	3403928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11616	NC_021176	TC	3	6	3404002	3404007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11617	NC_021176	AC	3	6	3404089	3404094	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11618	NC_021176	CGT	3	9	3404107	3404115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11620	NC_021176	C	6	6	3404293	3404298	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11621	NC_021176	ACG	2	6	3404342	3404347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11622	NC_021176	TGA	2	6	3404422	3404427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_021176	CCG	2	6	3404450	3404455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11624	NC_021176	ACC	2	6	3404537	3404542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11625	NC_021176	CCT	2	6	3404619	3404624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11626	NC_021176	CTC	2	6	3404656	3404661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11627	NC_021176	AGG	2	6	3404673	3404678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11629	NC_021176	GGT	2	6	3404760	3404765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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