MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 16409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_021176	GCAA	2	8	3116428	3116435	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10503	NC_021176	GGC	2	6	3116483	3116488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10504	NC_021176	TCCAGC	2	12	3116522	3116533	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10505	NC_021176	CCG	2	6	3116549	3116554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10506	NC_021176	CCG	2	6	3116559	3116564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10507	NC_021176	GC	3	6	3116577	3116582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10508	NC_021176	GAC	2	6	3116677	3116682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_021176	GGTG	2	8	3116730	3116737	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_021176	GA	3	6	3116738	3116743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_021176	GGC	2	6	3116764	3116769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10512	NC_021176	GAGTA	2	10	3116809	3116818	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_021176	TGT	2	6	3116922	3116927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_021176	A	8	8	3116972	3116979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_021176	GAAA	2	8	3116981	3116988	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_021176	AAC	2	6	3117933	3117938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10517	NC_021176	GTG	2	6	3117942	3117947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_021176	GAA	2	6	3117974	3117979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_021176	CAC	2	6	3118096	3118101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10520	NC_021176	T	6	6	3118108	3118113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_021176	TGG	2	6	3118212	3118217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_021176	GCCT	2	8	3118884	3118891	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10523	NC_021176	ACA	2	6	3118917	3118922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10524	NC_021176	ACA	2	6	3118971	3118976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_021176	CA	3	6	3118990	3118995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10527	NC_021176	TGG	2	6	3119123	3119128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_021176	AT	3	6	3119198	3119203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_021176	TGG	2	6	3119210	3119215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_021176	TCC	2	6	3119255	3119260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10531	NC_021176	TGCCAC	2	12	3119265	3119276	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10532	NC_021176	CGG	2	6	3119372	3119377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10533	NC_021176	GTC	2	6	3119386	3119391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10538	NC_021176	AGGA	2	8	3119630	3119637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_021176	A	6	6	3119888	3119893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_021176	TAA	2	6	3119911	3119916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_021176	A	7	7	3119925	3119931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_021176	CAG	2	6	3119933	3119938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10545	NC_021176	ATTA	2	8	3120005	3120012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10549	NC_021176	AGTA	2	8	3120089	3120096	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_021176	TTA	2	6	3120112	3120117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10553	NC_021176	TTA	2	6	3120164	3120169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10556	NC_021176	GGA	2	6	3120932	3120937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_021176	TAAG	2	8	3120997	3121004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_021176	GTG	2	6	3121303	3121308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_021176	AACCGG	2	12	3121320	3121331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10562	NC_021176	TACG	2	8	3121476	3121483	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10563	NC_021176	A	7	7	3121670	3121676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_021176	AGAT	2	8	3121688	3121695	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_021176	GTT	2	6	3122208	3122213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10568	NC_021176	CAA	3	9	3122297	3122305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10569	NC_021176	CA	3	6	3122395	3122400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10570	NC_021176	CAT	2	6	3122412	3122417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10575	NC_021176	GTAT	2	8	3122773	3122780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_021176	TTTG	2	8	3122794	3122801	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10577	NC_021176	CATAG	2	10	3122811	3122820	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10578	NC_021176	TAA	2	6	3122859	3122864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10580	NC_021176	ATT	2	6	3122899	3122904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_021176	TGT	2	6	3122911	3122916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10582	NC_021176	TA	3	6	3122917	3122922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10583	NC_021176	AAT	2	6	3124031	3124036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10584	NC_021176	ATA	2	6	3124222	3124227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10585	NC_021176	ATT	2	6	3124275	3124280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10586	NC_021176	TAA	2	6	3124354	3124359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10587	NC_021176	TTC	2	6	3124392	3124397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10588	NC_021176	ATA	2	6	3124416	3124421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10589	NC_021176	CCTGC	2	10	3124718	3124727	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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10593	NC_021176	A	6	6	3124853	3124858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_021176	TTTA	2	8	3124943	3124950	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_021176	ACT	2	6	3124984	3124989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10598	NC_021176	TAA	2	6	3125233	3125238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_021176	ATT	2	6	3125245	3125250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_021176	T	6	6	3125249	3125254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_021176	ATTT	2	8	3125285	3125292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_021176	A	6	6	3125305	3125310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_021176	ATT	2	6	3125329	3125334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_021176	AT	3	6	3126168	3126173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10605	NC_021176	ACC	2	6	3126186	3126191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10606	NC_021176	TAT	2	6	3128273	3128278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_021176	ACA	2	6	3128280	3128285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10608	NC_021176	TTAT	2	8	3128311	3128318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10609	NC_021176	GGCA	2	8	3128319	3128326	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10610	NC_021176	TTGA	2	8	3128816	3128823	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_021176	TCA	2	6	3130168	3130173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10612	NC_021176	GAA	2	6	3130228	3130233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_021176	ATG	2	6	3131813	3131818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_021176	AGG	2	6	3131841	3131846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_021176	TCGC	2	8	3131869	3131876	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10616	NC_021176	T	7	7	3131881	3131887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_021176	GCCCG	2	10	3131909	3131918	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10618	NC_021176	TTCC	2	8	3131922	3131929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10619	NC_021176	TGCAA	2	10	3132976	3132985	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10620	NC_021176	CT	3	6	3133037	3133042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10623	NC_021176	TA	4	8	3133135	3133142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_021176	A	6	6	3133142	3133147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_021176	AAG	2	6	3133154	3133159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10627	NC_021176	A	8	8	3133191	3133198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10628	NC_021176	TAAA	2	8	3133253	3133260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10629	NC_021176	AAT	2	6	3133261	3133266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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