MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 16409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_021176	CCG	2	6	2546692	2546697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8502	NC_021176	ATT	2	6	2547015	2547020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_021176	CAG	2	6	2547636	2547641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_021176	ATG	2	6	2547645	2547650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_021176	TGT	2	6	2547665	2547670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_021176	TCG	2	6	2547671	2547676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8507	NC_021176	ACG	2	6	2547741	2547746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8508	NC_021176	TTA	2	6	2547766	2547771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_021176	TCG	2	6	2547774	2547779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8510	NC_021176	AGC	2	6	2547843	2547848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_021176	ATTGT	2	10	2547891	2547900	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_021176	ATCAT	2	10	2548825	2548834	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8513	NC_021176	ATA	2	6	2548861	2548866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_021176	TCA	2	6	2549458	2549463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8515	NC_021176	AC	3	6	2549522	2549527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8516	NC_021176	GGAG	2	8	2551523	2551530	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_021176	TA	3	6	2551960	2551965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_021176	ACC	2	6	2551990	2551995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8519	NC_021176	TTAC	2	8	2552010	2552017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8520	NC_021176	AT	3	6	2552026	2552031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_021176	ATTG	2	8	2552037	2552044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_021176	AGA	2	6	2552100	2552105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_021176	TTA	2	6	2552127	2552132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_021176	AGA	2	6	2552171	2552176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_021176	AAC	2	6	2552222	2552227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8526	NC_021176	TGT	2	6	2552230	2552235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_021176	TTA	2	6	2552520	2552525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_021176	GAA	2	6	2552550	2552555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_021176	GAA	2	6	2552596	2552601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_021176	AAT	2	6	2552611	2552616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_021176	CGC	2	6	2552626	2552631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8532	NC_021176	ATA	2	6	2552664	2552669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_021176	A	6	6	2552677	2552682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_021176	AAT	2	6	2552684	2552689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_021176	TTTAA	2	10	2552755	2552764	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_021176	TTAGC	2	10	2554038	2554047	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8537	NC_021176	TGG	2	6	2554063	2554068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_021176	TCA	2	6	2554114	2554119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8539	NC_021176	TA	3	6	2554141	2554146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_021176	CAA	2	6	2556321	2556326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8541	NC_021176	GCGA	2	8	2556350	2556357	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8542	NC_021176	ATC	2	6	2556548	2556553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8543	NC_021176	GC	3	6	2556881	2556886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8544	NC_021176	CTT	2	6	2559258	2559263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8545	NC_021176	GCT	2	6	2559276	2559281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8546	NC_021176	CGG	2	6	2559286	2559291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8547	NC_021176	CGA	2	6	2559379	2559384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8548	NC_021176	CAG	2	6	2559395	2559400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8549	NC_021176	CCG	2	6	2559469	2559474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8550	NC_021176	T	6	6	2559480	2559485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_021176	T	6	6	2559493	2559498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_021176	GCC	2	6	2559520	2559525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8553	NC_021176	GTA	2	6	2559528	2559533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_021176	ACC	2	6	2559546	2559551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8555	NC_021176	GTC	2	6	2560735	2560740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8556	NC_021176	AAT	2	6	2561416	2561421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_021176	GA	3	6	2561476	2561481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_021176	CTC	2	6	2564383	2564388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8559	NC_021176	AGG	2	6	2564450	2564455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_021176	GCG	2	6	2564461	2564466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8561	NC_021176	ATT	2	6	2564485	2564490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_021176	TAA	2	6	2564532	2564537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_021176	A	7	7	2564590	2564596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_021176	AAT	2	6	2564647	2564652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_021176	AAC	2	6	2564697	2564702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8566	NC_021176	TA	3	6	2564756	2564761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_021176	AAG	2	6	2564763	2564768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_021176	GCC	3	9	2564780	2564788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8569	NC_021176	CTGC	2	8	2564831	2564838	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8570	NC_021176	GCG	2	6	2565873	2565878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_021176	GCC	2	6	2565883	2565888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8572	NC_021176	CTG	2	6	2567879	2567884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8574	NC_021176	CCGTA	2	10	2570597	2570606	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8575	NC_021176	GGC	2	6	2570644	2570649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8576	NC_021176	CAAAG	2	10	2571604	2571613	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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8578	NC_021176	A	6	6	2571792	2571797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8582	NC_021176	CAT	2	6	2573889	2573894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8587	NC_021176	ATT	2	6	2576892	2576897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_021176	A	6	6	2576955	2576960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_021176	GCG	2	6	2576989	2576994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8592	NC_021176	GA	3	6	2578200	2578205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8593	NC_021176	TCCC	2	8	2580774	2580781	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8594	NC_021176	TA	3	6	2580785	2580790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_021176	GAAAC	2	10	2580830	2580839	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8596	NC_021176	T	8	8	2580892	2580899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8599	NC_021176	GTA	2	6	2580970	2580975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8601	NC_021176	A	7	7	2581056	2581062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_021176	ACGGG	2	10	2581158	2581167	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8603	NC_021176	CGCT	2	8	2581194	2581201	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8604	NC_021176	GCG	2	6	2581204	2581209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8606	NC_021176	CCG	2	6	2581307	2581312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8607	NC_021176	GC	3	6	2581313	2581318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8608	NC_021176	GCA	2	6	2581358	2581363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8611	NC_021176	GTA	2	6	2581492	2581497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_021176	C	6	6	2581501	2581506	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8613	NC_021176	CGG	2	6	2581620	2581625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8614	NC_021176	AG	3	6	2581634	2581639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_021176	CT	3	6	2581701	2581706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8616	NC_021176	TGCCG	2	10	2581711	2581720	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8617	NC_021176	GCA	2	6	2581874	2581879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8620	NC_021176	TGGCT	2	10	2582056	2582065	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8621	NC_021176	TA	3	6	2582073	2582078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8622	NC_021176	GCA	2	6	2582093	2582098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8625	NC_021176	CGG	2	6	2582155	2582160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8626	NC_021176	GTT	2	6	2582186	2582191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8627	NC_021176	T	6	6	2582373	2582378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8628	NC_021176	ATC	2	6	2582379	2582384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8631	NC_021176	TCA	2	6	2582542	2582547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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