MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 16409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_021176	GAC	2	6	2084788	2084793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_021176	CT	3	6	2086891	2086896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7003	NC_021176	GCT	2	6	2088275	2088280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7004	NC_021176	ATC	2	6	2088323	2088328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_021176	GCC	2	6	2088368	2088373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7006	NC_021176	TCC	2	6	2088394	2088399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7007	NC_021176	A	7	7	2089097	2089103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_021176	ACC	2	6	2091172	2091177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7009	NC_021176	AC	3	6	2091196	2091201	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7010	NC_021176	CAC	2	6	2091206	2091211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7011	NC_021176	TAA	2	6	2091216	2091221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_021176	TAA	2	6	2091232	2091237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_021176	ACG	2	6	2091245	2091250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_021176	CTTC	2	8	2091309	2091316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7015	NC_021176	T	7	7	2091324	2091330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_021176	TCA	2	6	2091381	2091386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_021176	CCT	2	6	2093161	2093166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7018	NC_021176	GCG	2	6	2093233	2093238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_021176	T	6	6	2093662	2093667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_021176	CCT	2	6	2093668	2093673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7021	NC_021176	T	6	6	2093709	2093714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_021176	GCC	2	6	2093794	2093799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7023	NC_021176	TGA	2	6	2093805	2093810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_021176	CCCTG	2	10	2093848	2093857	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7025	NC_021176	CG	4	8	2097170	2097177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7026	NC_021176	CCTG	2	8	2098755	2098762	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7027	NC_021176	CA	3	6	2101617	2101622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7028	NC_021176	TTG	2	6	2101645	2101650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_021176	ATTC	2	8	2101657	2101664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7030	NC_021176	ATA	2	6	2101758	2101763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_021176	AGC	2	6	2103898	2103903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_021176	CAT	2	6	2103908	2103913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_021176	TGT	2	6	2103946	2103951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_021176	AG	3	6	2104047	2104052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_021176	TAA	2	6	2108323	2108328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_021176	ATTT	2	8	2108349	2108356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_021176	CCT	2	6	2108439	2108444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7038	NC_021176	CGAA	2	8	2108522	2108529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7039	NC_021176	A	6	6	2111541	2111546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_021176	TTA	2	6	2111562	2111567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_021176	A	7	7	2111628	2111634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_021176	CTA	2	6	2111714	2111719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_021176	CTGC	2	8	2112675	2112682	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7044	NC_021176	A	6	6	2114372	2114377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_021176	TGTA	2	8	2114422	2114429	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_021176	AGG	2	6	2114469	2114474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_021176	CGG	2	6	2114611	2114616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_021176	CGC	2	6	2114624	2114629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7049	NC_021176	T	8	8	2114672	2114679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_021176	CGG	2	6	2114717	2114722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_021176	CTT	2	6	2114728	2114733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_021176	TCT	2	6	2114748	2114753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_021176	T	6	6	2114799	2114804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_021176	CAGG	2	8	2114814	2114821	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7055	NC_021176	AATA	2	8	2116469	2116476	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_021176	TCC	2	6	2116477	2116482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7057	NC_021176	CT	3	6	2116519	2116524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7058	NC_021176	TTG	2	6	2117057	2117062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_021176	TAA	2	6	2117115	2117120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_021176	A	8	8	2117180	2117187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_021176	TTTTCA	2	12	2117207	2117218	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7062	NC_021176	ACC	2	6	2117745	2117750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7063	NC_021176	AAGT	2	8	2117764	2117771	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_021176	AT	3	6	2117784	2117789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_021176	CAT	2	6	2117885	2117890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_021176	AAT	2	6	2117910	2117915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_021176	ATT	2	6	2117944	2117949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_021176	T	9	9	2118008	2118016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_021176	T	6	6	2118079	2118084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_021176	ATG	2	6	2118999	2119004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_021176	TAT	2	6	2119044	2119049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_021176	T	6	6	2119068	2119073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_021176	T	6	6	2119080	2119085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_021176	T	6	6	2119090	2119095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_021176	ATT	2	6	2119110	2119115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_021176	ACA	2	6	2119125	2119130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7077	NC_021176	AAAT	2	8	2119160	2119167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_021176	A	6	6	2119208	2119213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_021176	ATCT	2	8	2119792	2119799	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7080	NC_021176	TA	3	6	2119909	2119914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_021176	CCTG	2	8	2119930	2119937	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7082	NC_021176	ATT	2	6	2119998	2120003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_021176	TAA	2	6	2120006	2120011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_021176	CA	3	6	2120018	2120023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7085	NC_021176	TTAA	2	8	2120028	2120035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_021176	AAC	2	6	2120046	2120051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7087	NC_021176	GCA	2	6	2120123	2120128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7088	NC_021176	T	6	6	2120207	2120212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_021176	CCTGC	2	10	2122551	2122560	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7090	NC_021176	CAT	2	6	2122572	2122577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7091	NC_021176	CATTT	2	10	2122588	2122597	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7092	NC_021176	TCCC	2	8	2122598	2122605	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7093	NC_021176	GGA	2	6	2122648	2122653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_021176	GTC	2	6	2124909	2124914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7095	NC_021176	GCTTT	2	10	2124942	2124951	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7096	NC_021176	T	6	6	2124969	2124974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7098	NC_021176	GGT	2	6	2125018	2125023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_021176	CGC	2	6	2125031	2125036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7100	NC_021176	CGT	2	6	2125047	2125052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7101	NC_021176	CGG	2	6	2125069	2125074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_021176	T	7	7	2125097	2125103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_021176	CGC	2	6	2125118	2125123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7104	NC_021176	CTG	2	6	2125140	2125145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_021176	CAT	2	6	2125166	2125171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7106	NC_021176	GCG	2	6	2125191	2125196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7107	NC_021176	CGCT	2	8	2125201	2125208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7108	NC_021176	CG	3	6	2125212	2125217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7109	NC_021176	GCG	3	9	2125222	2125230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7110	NC_021176	AAT	2	6	2125284	2125289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_021176	GCC	2	6	2125303	2125308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7112	NC_021176	GC	3	6	2125373	2125378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7113	NC_021176	GCCA	2	8	2125418	2125425	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7114	NC_021176	TGT	2	6	2125503	2125508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_021176	GAT	2	6	2125529	2125534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_021176	GT	3	6	2125593	2125598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_021176	CAA	2	6	2125617	2125622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7118	NC_021176	CGG	2	6	2125679	2125684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_021176	GATAA	2	10	2125692	2125701	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_021176	GCG	2	6	2125733	2125738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7121	NC_021176	AGC	2	6	2125812	2125817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7123	NC_021176	CTCG	2	8	2125874	2125881	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7124	NC_021176	CT	3	6	2125891	2125896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7125	NC_021176	CG	3	6	2125932	2125937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7126	NC_021176	T	6	6	2125944	2125949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_021176	ATC	2	6	2126293	2126298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7129	NC_021176	AAT	2	6	2126409	2126414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_021176	A	6	6	2126482	2126487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_021176	TCA	2	6	2126497	2126502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7133	NC_021176	TGT	2	6	2126850	2126855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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