MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 16409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021176	ATA	2	6	1456897	1456902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_021176	AAT	2	6	1456911	1456916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021176	CGG	2	6	1456944	1456949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_021176	TTAT	2	8	1459679	1459686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021176	GT	3	6	1460406	1460411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_021176	GTT	2	6	1460453	1460458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_021176	CGCA	2	8	1461351	1461358	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_021176	CTC	2	6	1465288	1465293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_021176	A	6	6	1465307	1465312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_021176	GGC	2	6	1465378	1465383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_021176	TA	3	6	1467852	1467857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_021176	ATT	2	6	1467875	1467880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_021176	ATG	2	6	1467890	1467895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_021176	ATT	2	6	1467924	1467929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_021176	AGG	3	9	1467970	1467978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_021176	CGG	2	6	1467990	1467995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_021176	TGGC	2	8	1468023	1468030	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5018	NC_021176	GCT	2	6	1468039	1468044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_021176	CAC	2	6	1468090	1468095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_021176	CCG	2	6	1468153	1468158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_021176	TGA	2	6	1468171	1468176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_021176	GTT	2	6	1468180	1468185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_021176	CT	3	6	1468201	1468206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_021176	GCC	2	6	1468221	1468226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_021176	TCA	2	6	1468282	1468287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_021176	ATG	2	6	1468357	1468362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_021176	CCGCG	2	10	1469132	1469141	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5028	NC_021176	ACC	2	6	1470117	1470122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_021176	TGT	2	6	1470192	1470197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_021176	GTA	2	6	1470624	1470629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_021176	CG	3	6	1474394	1474399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_021176	GGC	2	6	1474405	1474410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_021176	CG	3	6	1474445	1474450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5034	NC_021176	AGC	2	6	1474485	1474490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_021176	TAT	2	6	1474505	1474510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_021176	GGC	2	6	1474526	1474531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_021176	CAG	2	6	1474535	1474540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_021176	AGC	2	6	1474554	1474559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_021176	CGG	2	6	1474590	1474595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_021176	GTG	2	6	1474613	1474618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_021176	CGT	2	6	1474621	1474626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_021176	GCG	2	6	1474631	1474636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_021176	GGC	2	6	1474672	1474677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_021176	GCCA	2	8	1474741	1474748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_021176	CTG	2	6	1474760	1474765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_021176	GCC	2	6	1474781	1474786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5047	NC_021176	TAT	2	6	1474825	1474830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_021176	CGT	2	6	1474847	1474852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_021176	ACA	2	6	1474893	1474898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_021176	AAC	2	6	1475058	1475063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_021176	CGG	2	6	1475082	1475087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_021176	AGA	2	6	1475122	1475127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_021176	TCAT	2	8	1475230	1475237	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5054	NC_021176	GAC	2	6	1475294	1475299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_021176	TCA	2	6	1475425	1475430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_021176	GATG	2	8	1475446	1475453	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_021176	GGC	2	6	1475564	1475569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_021176	GC	3	6	1475626	1475631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_021176	GAA	2	6	1475645	1475650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_021176	GCT	2	6	1475671	1475676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_021176	GGC	2	6	1475713	1475718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_021176	AAG	2	6	1475739	1475744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_021176	AGCG	2	8	1475776	1475783	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5064	NC_021176	T	8	8	1476169	1476176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_021176	TGT	2	6	1477850	1477855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_021176	GTT	2	6	1480016	1480021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_021176	AAC	2	6	1480033	1480038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_021176	TGA	2	6	1480064	1480069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_021176	GTG	2	6	1480147	1480152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_021176	TTA	2	6	1480170	1480175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_021176	A	6	6	1480198	1480203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_021176	TGG	2	6	1480220	1480225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_021176	TAT	2	6	1480226	1480231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_021176	AAT	2	6	1480235	1480240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_021176	CATAT	2	10	1480309	1480318	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5076	NC_021176	CAT	3	9	1480330	1480338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_021176	CTG	2	6	1480539	1480544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_021176	AT	3	6	1480556	1480561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021176	T	7	7	1480602	1480608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_021176	ATT	2	6	1480645	1480650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_021176	GTTC	2	8	1481216	1481223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5082	NC_021176	ATTT	2	8	1481240	1481247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_021176	ATT	2	6	1481268	1481273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_021176	CAA	2	6	1481286	1481291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_021176	A	6	6	1481366	1481371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_021176	ATT	2	6	1481380	1481385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_021176	TTA	2	6	1481591	1481596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_021176	GA	3	6	1481599	1481604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_021176	CG	3	6	1481981	1481986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5090	NC_021176	CGG	2	6	1482234	1482239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_021176	T	9	9	1482240	1482248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021176	GCA	2	6	1482288	1482293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_021176	T	6	6	1482455	1482460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_021176	A	6	6	1482461	1482466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_021176	TATT	2	8	1482518	1482525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_021176	CAG	2	6	1482595	1482600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_021176	AT	3	6	1482615	1482620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_021176	CCTG	2	8	1483863	1483870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5099	NC_021176	ATG	2	6	1483921	1483926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_021176	GT	3	6	1483980	1483985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_021176	AAAAG	2	10	1484009	1484018	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_021176	TAA	2	6	1484068	1484073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_021176	AAG	2	6	1485003	1485008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_021176	GCG	2	6	1485045	1485050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_021176	A	7	7	1485075	1485081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_021176	T	6	6	1485746	1485751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021176	TAAT	2	8	1486207	1486214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_021176	A	6	6	1486350	1486355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_021176	GC	3	6	1486381	1486386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_021176	GTC	2	6	1487121	1487126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_021176	ATT	2	6	1489370	1489375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_021176	ATG	2	6	1489403	1489408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_021176	GA	3	6	1489428	1489433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_021176	TGT	2	6	1490897	1490902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_021176	CGT	2	6	1492194	1492199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5117	NC_021176	AT	3	6	1492257	1492262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_021176	ACA	2	6	1492290	1492295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_021176	GTT	2	6	1492304	1492309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_021176	T	7	7	1492308	1492314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_021176	A	7	7	1492337	1492343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_021176	AAAGC	2	10	1493402	1493411	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5123	NC_021176	A	6	6	1494031	1494036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_021176	AGT	2	6	1494067	1494072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_021176	TTTG	2	8	1494091	1494098	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_021176	TTG	3	9	1494140	1494148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_021176	ACTT	2	8	1494156	1494163	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5128	NC_021176	TTA	2	6	1494170	1494175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_021176	CGAAG	2	10	1494260	1494269	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5130	NC_021176	AGT	2	6	1494282	1494287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5132	NC_021176	AAG	2	6	1494351	1494356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5251	NC_021176	TAT	2	6	1525052	1525057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_021176	TA	3	6	1525071	1525076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5259	NC_021176	A	6	6	1527443	1527448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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