MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 13098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_021151	TTA	2	6	4497127	4497132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12002	NC_021151	CAA	2	6	4497221	4497226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12003	NC_021151	AAT	2	6	4497235	4497240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_021151	TTG	2	6	4499174	4499179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12005	NC_021151	ATTCG	2	10	4499193	4499202	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12006	NC_021151	GTTT	2	8	4499778	4499785	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12007	NC_021151	GTCTTT	2	12	4499789	4499800	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12008	NC_021151	AGG	2	6	4499821	4499826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_021151	GTG	2	6	4499863	4499868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12010	NC_021151	TGTAAG	2	12	4499892	4499903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12011	NC_021151	CGA	2	6	4499904	4499909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12012	NC_021151	T	6	6	4499936	4499941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12013	NC_021151	TAGT	2	8	4499978	4499985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12014	NC_021151	TTG	2	6	4500733	4500738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12015	NC_021151	TGA	2	6	4500842	4500847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12016	NC_021151	T	8	8	4500867	4500874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12017	NC_021151	T	6	6	4500911	4500916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12018	NC_021151	GCG	2	6	4500917	4500922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12019	NC_021151	CGA	2	6	4500992	4500997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12020	NC_021151	ATA	2	6	4500998	4501003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12021	NC_021151	GCC	2	6	4504233	4504238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12022	NC_021151	ATT	2	6	4505154	4505159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12023	NC_021151	TAT	2	6	4505232	4505237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12024	NC_021151	TCC	2	6	4506352	4506357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12025	NC_021151	GGA	2	6	4506371	4506376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12026	NC_021151	CG	3	6	4508407	4508412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12027	NC_021151	TGAACT	2	12	4508427	4508438	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12028	NC_021151	TGC	2	6	4508440	4508445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12029	NC_021151	GCC	2	6	4508463	4508468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12030	NC_021151	T	6	6	4508500	4508505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12031	NC_021151	GA	3	6	4508526	4508531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12032	NC_021151	CGCGTT	2	12	4508563	4508574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12034	NC_021151	TAA	2	6	4510576	4510581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12035	NC_021151	TAA	2	6	4510612	4510617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12036	NC_021151	AGC	2	6	4510671	4510676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12038	NC_021151	T	6	6	4510744	4510749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12039	NC_021151	A	6	6	4510750	4510755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12040	NC_021151	AG	3	6	4510781	4510786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12041	NC_021151	TACA	2	8	4510825	4510832	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12042	NC_021151	ACA	2	6	4510850	4510855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12043	NC_021151	TAA	2	6	4510897	4510902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12044	NC_021151	A	6	6	4510937	4510942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12045	NC_021151	GC	3	6	4512498	4512503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12046	NC_021151	T	6	6	4517551	4517556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12047	NC_021151	T	6	6	4517558	4517563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12048	NC_021151	TG	3	6	4517577	4517582	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12049	NC_021151	A	7	7	4517589	4517595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12050	NC_021151	ATTA	2	8	4517619	4517626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12051	NC_021151	TAT	2	6	4517635	4517640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12052	NC_021151	A	6	6	4517657	4517662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12053	NC_021151	TCA	2	6	4517684	4517689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12054	NC_021151	TTA	2	6	4517709	4517714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12055	NC_021151	A	6	6	4517792	4517797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12056	NC_021151	GTAT	2	8	4517835	4517842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12057	NC_021151	CGG	2	6	4517857	4517862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12060	NC_021151	TTTA	2	8	4520060	4520067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12061	NC_021151	A	7	7	4520105	4520111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12062	NC_021151	GCC	2	6	4520213	4520218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12063	NC_021151	TTG	2	6	4520266	4520271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12064	NC_021151	TCA	2	6	4520275	4520280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12065	NC_021151	CGG	2	6	4520294	4520299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12067	NC_021151	GC	3	6	4520459	4520464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12068	NC_021151	TGA	2	6	4520468	4520473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12069	NC_021151	CG	3	6	4520527	4520532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12070	NC_021151	CGG	2	6	4520537	4520542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12071	NC_021151	AGT	2	6	4520618	4520623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12073	NC_021151	GTT	2	6	4520886	4520891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12074	NC_021151	AAG	2	6	4520980	4520985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12077	NC_021151	AG	3	6	4521138	4521143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12078	NC_021151	CGC	2	6	4521183	4521188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12079	NC_021151	GC	3	6	4521187	4521192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12080	NC_021151	GCAG	2	8	4521247	4521254	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12081	NC_021151	GC	3	6	4521338	4521343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12082	NC_021151	GTT	2	6	4521366	4521371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12084	NC_021151	CGC	2	6	4521531	4521536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12085	NC_021151	TTC	2	6	4521615	4521620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12086	NC_021151	AAT	2	6	4521672	4521677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12088	NC_021151	GC	3	6	4521747	4521752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12089	NC_021151	CCG	2	6	4521842	4521847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12090	NC_021151	ACCG	2	8	4521918	4521925	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12091	NC_021151	GCA	2	6	4521969	4521974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12092	NC_021151	GAG	2	6	4522051	4522056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12093	NC_021151	GCC	2	6	4522158	4522163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12094	NC_021151	TAA	2	6	4522220	4522225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12095	NC_021151	GTA	2	6	4522236	4522241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12096	NC_021151	TGGT	2	8	4522264	4522271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12097	NC_021151	GCC	2	6	4522282	4522287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12098	NC_021151	ACC	2	6	4522315	4522320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12099	NC_021151	GATT	2	8	4522322	4522329	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12100	NC_021151	GAC	2	6	4522362	4522367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12101	NC_021151	T	6	6	4522368	4522373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12102	NC_021151	T	6	6	4522445	4522450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12103	NC_021151	GAAA	2	8	4522533	4522540	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12104	NC_021151	TAT	2	6	4522556	4522561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12105	NC_021151	TCTGC	2	10	4522613	4522622	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12106	NC_021151	GGAT	2	8	4522641	4522648	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12107	NC_021151	GGCA	2	8	4522702	4522709	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12108	NC_021151	AAG	2	6	4523772	4523777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12109	NC_021151	TCC	2	6	4524336	4524341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12110	NC_021151	TCA	2	6	4524349	4524354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12111	NC_021151	ATT	2	6	4524395	4524400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12112	NC_021151	CGG	2	6	4524419	4524424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12113	NC_021151	T	6	6	4525549	4525554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12114	NC_021151	CAC	2	6	4525560	4525565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12115	NC_021151	AT	3	6	4525610	4525615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12116	NC_021151	GTAA	2	8	4525719	4525726	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12117	NC_021151	CTCC	2	8	4525764	4525771	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12118	NC_021151	TA	3	6	4525812	4525817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12119	NC_021151	TC	3	6	4527376	4527381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12120	NC_021151	CTC	2	6	4527393	4527398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12121	NC_021151	GGA	2	6	4527408	4527413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12122	NC_021151	TGG	2	6	4530980	4530985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12123	NC_021151	CGT	2	6	4532419	4532424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12124	NC_021151	TGC	2	6	4532478	4532483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12125	NC_021151	TAT	2	6	4532484	4532489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12126	NC_021151	GA	3	6	4533328	4533333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12127	NC_021151	TG	3	6	4533353	4533358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12128	NC_021151	AAT	2	6	4533392	4533397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12130	NC_021151	TAT	2	6	4533512	4533517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12258	NC_021151	TTG	2	6	4560216	4560221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12259	NC_021151	A	6	6	4560259	4560264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12497	NC_021151	AGGG	2	8	4656183	4656190	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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