MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 13098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021151	GGC	2	6	4182096	4182101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_021151	CTC	2	6	4182108	4182113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11003	NC_021151	GAT	2	6	4182193	4182198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_021151	CAT	3	9	4182201	4182209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_021151	CCA	2	6	4182219	4182224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11006	NC_021151	AAGTG	2	10	4182257	4182266	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_021151	CTG	2	6	4182281	4182286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11008	NC_021151	A	6	6	4182341	4182346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_021151	CAG	2	6	4182668	4182673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_021151	GTG	2	6	4182674	4182679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_021151	A	6	6	4182854	4182859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_021151	CGGG	2	8	4182871	4182878	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11013	NC_021151	TTG	2	6	4182925	4182930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_021151	CGCTG	2	10	4182991	4183000	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11015	NC_021151	GT	3	6	4186447	4186452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_021151	A	7	7	4186463	4186469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_021151	AAAT	2	8	4186473	4186480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_021151	A	7	7	4186565	4186571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_021151	ATT	2	6	4190610	4190615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_021151	CCA	2	6	4190659	4190664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11021	NC_021151	AAC	2	6	4190674	4190679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_021151	CA	3	6	4190682	4190687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11023	NC_021151	GCC	2	6	4190689	4190694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11024	NC_021151	CGC	2	6	4190785	4190790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11025	NC_021151	AAGCG	2	10	4190798	4190807	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11026	NC_021151	TG	3	6	4190839	4190844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_021151	GGC	2	6	4190993	4190998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_021151	AGC	2	6	4191033	4191038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_021151	TGC	2	6	4191040	4191045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_021151	ACT	2	6	4191107	4191112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_021151	TTG	2	6	4191204	4191209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_021151	CGA	2	6	4191232	4191237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11033	NC_021151	GCA	2	6	4191306	4191311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11034	NC_021151	GAA	2	6	4191365	4191370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_021151	GGA	2	6	4191401	4191406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_021151	TAA	2	6	4191419	4191424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_021151	GCA	2	6	4191427	4191432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_021151	AGA	2	6	4191448	4191453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_021151	CAG	2	6	4191474	4191479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11040	NC_021151	G	6	6	4191621	4191626	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_021151	GGA	2	6	4191665	4191670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_021151	GGC	2	6	4191685	4191690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_021151	GAA	2	6	4191928	4191933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_021151	TGC	2	6	4192004	4192009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_021151	GTC	2	6	4192016	4192021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_021151	TTG	2	6	4192077	4192082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_021151	GGA	2	6	4192129	4192134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_021151	TCA	2	6	4192154	4192159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11049	NC_021151	AC	3	6	4192180	4192185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11050	NC_021151	CGT	2	6	4192248	4192253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11051	NC_021151	AC	3	6	4192349	4192354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11052	NC_021151	GTAG	2	8	4192390	4192397	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_021151	CCT	2	6	4192490	4192495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11054	NC_021151	CA	3	6	4192525	4192530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11055	NC_021151	TGA	2	6	4192538	4192543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_021151	GGT	2	6	4192581	4192586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_021151	GGT	2	6	4192616	4192621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_021151	AGG	2	6	4192795	4192800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_021151	CCA	2	6	4192825	4192830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11060	NC_021151	A	6	6	4192848	4192853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_021151	AAC	2	6	4192935	4192940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_021151	GTT	2	6	4192945	4192950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_021151	TC	3	6	4192957	4192962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11064	NC_021151	GAT	2	6	4192978	4192983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_021151	GCG	2	6	4193257	4193262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_021151	GAG	2	6	4193273	4193278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_021151	TG	3	6	4193298	4193303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_021151	GC	3	6	4193325	4193330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11069	NC_021151	G	6	6	4193418	4193423	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_021151	TCC	2	6	4193428	4193433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11071	NC_021151	CTGA	2	8	4193448	4193455	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11072	NC_021151	GTAC	2	8	4193532	4193539	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11073	NC_021151	TG	3	6	4193564	4193569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_021151	GGA	2	6	4193739	4193744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_021151	AC	3	6	4193957	4193962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11076	NC_021151	CGTC	2	8	4193975	4193982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11077	NC_021151	AAC	2	6	4193994	4193999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11078	NC_021151	AGC	2	6	4194084	4194089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_021151	CAT	2	6	4194090	4194095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11081	NC_021151	AGCGA	2	10	4194226	4194235	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11082	NC_021151	CGTT	2	8	4194275	4194282	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11083	NC_021151	GT	3	6	4194314	4194319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_021151	G	6	6	4194519	4194524	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_021151	GT	4	8	4194577	4194584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11088	NC_021151	GGT	2	6	4194719	4194724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_021151	GA	3	6	4194749	4194754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_021151	AGTC	2	8	4194845	4194852	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11091	NC_021151	GCTG	2	8	4194863	4194870	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11092	NC_021151	TTA	2	6	4194878	4194883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11095	NC_021151	ACC	2	6	4195273	4195278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11096	NC_021151	TGG	2	6	4195333	4195338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_021151	TCC	2	6	4195359	4195364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11098	NC_021151	GGA	2	6	4195376	4195381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_021151	AGG	2	6	4195414	4195419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_021151	GGT	2	6	4195496	4195501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_021151	CGG	2	6	4195583	4195588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_021151	TCA	2	6	4195611	4195616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_021151	CGT	2	6	4195691	4195696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_021151	G	6	6	4195740	4195745	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_021151	GAC	3	9	4195922	4195930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_021151	GT	3	6	4195944	4195949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_021151	AAG	3	9	4196031	4196039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_021151	AAT	2	6	4196071	4196076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_021151	GCA	2	6	4196081	4196086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11110	NC_021151	GGC	2	6	4196091	4196096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_021151	AAGGA	2	10	4196102	4196111	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_021151	TGAC	2	8	4196131	4196138	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11113	NC_021151	CGC	2	6	4196156	4196161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11114	NC_021151	GGC	2	6	4196205	4196210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11115	NC_021151	GGT	2	6	4196219	4196224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_021151	GCA	2	6	4196395	4196400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_021151	CGCC	2	8	4196426	4196433	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11118	NC_021151	TTAGT	2	10	4196449	4196458	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_021151	GAA	2	6	4196459	4196464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_021151	GACG	2	8	4196474	4196481	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11121	NC_021151	T	6	6	4196485	4196490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_021151	AGCGC	2	10	4196526	4196535	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11123	NC_021151	GGC	2	6	4196561	4196566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11124	NC_021151	GCG	2	6	4198028	4198033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11125	NC_021151	GTA	2	6	4198072	4198077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_021151	GAT	2	6	4198085	4198090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_021151	GA	3	6	4199084	4199089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_021151	ATT	2	6	4200647	4200652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11129	NC_021151	ATG	2	6	4200720	4200725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11130	NC_021151	AAC	2	6	4200752	4200757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11131	NC_021151	AAC	2	6	4200810	4200815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11132	NC_021151	AAT	2	6	4200824	4200829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11133	NC_021151	ATT	2	6	4200835	4200840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11134	NC_021151	AC	3	6	4200888	4200893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11135	NC_021151	GCGA	2	8	4200916	4200923	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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11139	NC_021151	A	8	8	4203907	4203914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11140	NC_021151	A	6	6	4203942	4203947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11143	NC_021151	T	6	6	4204067	4204072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11144	NC_021151	GCG	2	6	4204124	4204129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11146	NC_021151	GTCA	2	8	4204796	4204803	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11147	NC_021151	GTAA	2	8	4204866	4204873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11148	NC_021151	A	7	7	4204992	4204998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11152	NC_021151	TGCT	2	8	4205299	4205306	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11164	NC_021151	A	6	6	4210312	4210317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11244	NC_021151	GATC	2	8	4241929	4241936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11245	NC_021151	GCG	2	6	4242006	4242011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11247	NC_021151	TGGT	2	8	4242060	4242067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11248	NC_021151	GC	3	6	4242157	4242162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11249	NC_021151	GGT	2	6	4242224	4242229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11250	NC_021151	CTTC	2	8	4242289	4242296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11251	NC_021151	CTT	2	6	4242322	4242327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11252	NC_021151	TTG	2	6	4242338	4242343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11253	NC_021151	GC	3	6	4242361	4242366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11254	NC_021151	GGC	2	6	4242385	4242390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11255	NC_021151	CCA	2	6	4242409	4242414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11256	NC_021151	GC	3	6	4242436	4242441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11257	NC_021151	GAT	2	6	4242454	4242459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11258	NC_021151	GCA	2	6	4242583	4242588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11259	NC_021151	GCC	3	9	4242639	4242647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11260	NC_021151	GTG	2	6	4242648	4242653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11261	NC_021151	CTG	2	6	4242693	4242698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11262	NC_021151	GTT	2	6	4242775	4242780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11263	NC_021151	TCC	2	6	4242829	4242834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11264	NC_021151	GAG	2	6	4242841	4242846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11265	NC_021151	GT	5	10	4242871	4242880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11266	NC_021151	AT	4	8	4243764	4243771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11267	NC_021151	CT	3	6	4243789	4243794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11268	NC_021151	CGAA	2	8	4243905	4243912	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11269	NC_021151	A	6	6	4243911	4243916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11272	NC_021151	A	6	6	4245118	4245123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11273	NC_021151	TATCAA	2	12	4245155	4245166	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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11275	NC_021151	TTC	2	6	4246421	4246426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11378	NC_021151	CTAA	2	8	4288102	4288109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11379	NC_021151	GC	3	6	4289154	4289159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11383	NC_021151	ATT	2	6	4291641	4291646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11384	NC_021151	GAG	2	6	4291654	4291659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11387	NC_021151	AG	3	6	4291804	4291809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11388	NC_021151	TGAAT	2	10	4291810	4291819	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11389	NC_021151	TGAA	2	8	4291857	4291864	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11390	NC_021151	GATG	2	8	4291876	4291883	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11391	NC_021151	TGC	2	6	4291889	4291894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11395	NC_021151	ACTT	2	8	4292335	4292342	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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