MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 13098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_021151	AGG	2	6	3980156	3980161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_021151	AT	3	6	3980213	3980218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_021151	ATG	2	6	3980228	3980233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_021151	CGT	2	6	3980258	3980263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10505	NC_021151	GGC	2	6	3980315	3980320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_021151	TTTA	2	8	3980326	3980333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_021151	CGC	2	6	3980374	3980379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10508	NC_021151	TCAT	2	8	3980391	3980398	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10509	NC_021151	CAT	2	6	3980912	3980917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10510	NC_021151	TTA	2	6	3980965	3980970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_021151	A	6	6	3981028	3981033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_021151	CA	3	6	3981069	3981074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10513	NC_021151	GGCA	2	8	3982503	3982510	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10514	NC_021151	AGGTG	2	10	3982598	3982607	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_021151	A	8	8	3986060	3986067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_021151	GC	3	6	3986088	3986093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10517	NC_021151	TATT	2	8	3989593	3989600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_021151	TAG	2	6	3989650	3989655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_021151	AAC	2	6	3989706	3989711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10520	NC_021151	A	6	6	3992551	3992556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_021151	CCCG	2	8	3992558	3992565	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10522	NC_021151	CGG	2	6	3992574	3992579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10523	NC_021151	GT	4	8	3992592	3992599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_021151	CGA	2	6	3992622	3992627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_021151	CCA	3	9	3992628	3992636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10526	NC_021151	CACG	2	8	3992637	3992644	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10527	NC_021151	GTT	2	6	3992669	3992674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_021151	TGTT	2	8	3992720	3992727	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_021151	TGA	2	6	3992882	3992887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_021151	A	6	6	3992914	3992919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_021151	GGT	2	6	3992954	3992959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_021151	CAG	2	6	3992988	3992993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10533	NC_021151	TGA	2	6	3993039	3993044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_021151	GTG	2	6	3993185	3993190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_021151	ACG	2	6	3993534	3993539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10536	NC_021151	TTG	2	6	3994426	3994431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_021151	CTT	2	6	3994491	3994496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10538	NC_021151	GCA	2	6	3994537	3994542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10539	NC_021151	T	6	6	3994554	3994559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_021151	T	7	7	3994561	3994567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_021151	TAA	2	6	3996835	3996840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_021151	A	7	7	3997804	3997810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_021151	A	6	6	3997818	3997823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_021151	CAT	2	6	3997906	3997911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10545	NC_021151	ACTC	2	8	4000673	4000680	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10547	NC_021151	CGTT	2	8	4002010	4002017	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10548	NC_021151	GTT	2	6	4002035	4002040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_021151	GCA	2	6	4002064	4002069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10550	NC_021151	A	7	7	4002265	4002271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10551	NC_021151	TTC	2	6	4004088	4004093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10552	NC_021151	AT	3	6	4004144	4004149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_021151	A	7	7	4004230	4004236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_021151	GCAAG	2	10	4004257	4004266	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10555	NC_021151	AAG	2	6	4004719	4004724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_021151	CAT	2	6	4005266	4005271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10557	NC_021151	T	8	8	4005374	4005381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_021151	TCA	2	6	4005496	4005501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_021151	CAAC	2	8	4005514	4005521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10560	NC_021151	ATGA	2	8	4005524	4005531	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_021151	TCA	2	6	4007124	4007129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_021151	GCCAC	2	10	4007192	4007201	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10563	NC_021151	GTC	2	6	4012163	4012168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10565	NC_021151	ATTA	2	8	4014923	4014930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_021151	ATTTT	2	10	4014932	4014941	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_021151	T	7	7	4014938	4014944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_021151	CAT	2	6	4014978	4014983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10570	NC_021151	AAT	2	6	4015001	4015006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10573	NC_021151	CG	3	6	4019553	4019558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10579	NC_021151	CT	3	6	4028867	4028872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10585	NC_021151	A	7	7	4029042	4029048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10587	NC_021151	A	6	6	4029998	4030003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10588	NC_021151	GA	3	6	4030017	4030022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10589	NC_021151	TC	3	6	4030069	4030074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10592	NC_021151	GAG	2	6	4031520	4031525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10594	NC_021151	GCAG	2	8	4032743	4032750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10595	NC_021151	GT	4	8	4037293	4037300	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_021151	GC	3	6	4037324	4037329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10597	NC_021151	TTG	2	6	4039977	4039982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10599	NC_021151	TTC	2	6	4040176	4040181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10600	NC_021151	CG	3	6	4040251	4040256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10601	NC_021151	A	6	6	4040264	4040269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_021151	ATT	2	6	4040470	4040475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10604	NC_021151	GC	3	6	4043010	4043015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10605	NC_021151	T	7	7	4043079	4043085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10608	NC_021151	A	6	6	4044681	4044686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10609	NC_021151	AC	3	6	4044710	4044715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10610	NC_021151	AAT	2	6	4045970	4045975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_021151	T	7	7	4046226	4046232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10614	NC_021151	AAC	2	6	4048221	4048226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10618	NC_021151	TCCG	2	8	4048488	4048495	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10619	NC_021151	CTG	2	6	4048502	4048507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10621	NC_021151	GC	3	6	4048563	4048568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10622	NC_021151	CTGC	2	8	4048590	4048597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10623	NC_021151	CAA	2	6	4048608	4048613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10625	NC_021151	TA	3	6	4048783	4048788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10629	NC_021151	AGG	2	6	4053986	4053991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10631	NC_021151	T	7	7	4054048	4054054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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