MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 13098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_021151	TTA	2	6	3569173	3569178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9502	NC_021151	TCC	2	6	3569191	3569196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9503	NC_021151	CTT	2	6	3569226	3569231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9504	NC_021151	CTG	2	6	3569285	3569290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9505	NC_021151	TCG	2	6	3569360	3569365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9506	NC_021151	CAA	2	6	3569388	3569393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9507	NC_021151	AGT	2	6	3569485	3569490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9508	NC_021151	AGC	2	6	3569551	3569556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9509	NC_021151	GCT	2	6	3569559	3569564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9510	NC_021151	GCC	2	6	3569599	3569604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9511	NC_021151	CA	3	6	3569753	3569758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9512	NC_021151	T	6	6	3570033	3570038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9513	NC_021151	ATG	2	6	3570100	3570105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9514	NC_021151	GCA	2	6	3572851	3572856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9515	NC_021151	TCCC	2	8	3574441	3574448	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9516	NC_021151	TAA	2	6	3574528	3574533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9517	NC_021151	TTTTA	2	10	3576077	3576086	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9518	NC_021151	TTTA	2	8	3578817	3578824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9519	NC_021151	ATTT	2	8	3578835	3578842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9520	NC_021151	CCG	2	6	3579581	3579586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9521	NC_021151	ATT	2	6	3580435	3580440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9522	NC_021151	AGG	2	6	3580458	3580463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9523	NC_021151	A	7	7	3580468	3580474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9524	NC_021151	CCG	2	6	3580476	3580481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9525	NC_021151	T	6	6	3580489	3580494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9526	NC_021151	TAC	2	6	3580499	3580504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9527	NC_021151	CT	3	6	3581928	3581933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9528	NC_021151	TTTC	2	8	3582568	3582575	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9529	NC_021151	CTA	2	6	3583373	3583378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9530	NC_021151	GTAC	2	8	3583387	3583394	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9531	NC_021151	TGGC	2	8	3583454	3583461	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9532	NC_021151	A	6	6	3583504	3583509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9533	NC_021151	TAC	2	6	3588333	3588338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9534	NC_021151	ACT	3	9	3589063	3589071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9535	NC_021151	A	7	7	3589094	3589100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9536	NC_021151	A	6	6	3589151	3589156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9537	NC_021151	TCC	2	6	3591129	3591134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9538	NC_021151	CTC	2	6	3592263	3592268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9539	NC_021151	ATT	2	6	3594177	3594182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9540	NC_021151	CTC	2	6	3594202	3594207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9541	NC_021151	TCTTT	2	10	3594442	3594451	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9542	NC_021151	CGT	2	6	3594479	3594484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9543	NC_021151	TGTCGC	2	12	3594485	3594496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9544	NC_021151	CT	3	6	3595503	3595508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9545	NC_021151	A	8	8	3595537	3595544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9546	NC_021151	GA	3	6	3597153	3597158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9547	NC_021151	AGTTA	2	10	3599334	3599343	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9548	NC_021151	A	8	8	3601585	3601592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9549	NC_021151	ATT	2	6	3601637	3601642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9550	NC_021151	GAT	2	6	3601649	3601654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9551	NC_021151	CAAAT	2	10	3601782	3601791	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9552	NC_021151	AT	3	6	3601803	3601808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9553	NC_021151	A	8	8	3601820	3601827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9554	NC_021151	CCG	2	6	3601828	3601833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9555	NC_021151	GCG	2	6	3601843	3601848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9556	NC_021151	AAG	2	6	3602724	3602729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9557	NC_021151	TAT	2	6	3602775	3602780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9558	NC_021151	CTT	2	6	3602783	3602788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9559	NC_021151	CCG	2	6	3602866	3602871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9560	NC_021151	ACA	2	6	3602878	3602883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9561	NC_021151	A	7	7	3603121	3603127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9562	NC_021151	T	7	7	3603143	3603149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9563	NC_021151	GAT	2	6	3603156	3603161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9564	NC_021151	ATA	2	6	3603176	3603181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9565	NC_021151	GAC	2	6	3603293	3603298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9566	NC_021151	GAA	2	6	3603913	3603918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9567	NC_021151	A	7	7	3603968	3603974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9568	NC_021151	GTT	2	6	3606571	3606576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9569	NC_021151	TTC	2	6	3606595	3606600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9570	NC_021151	CCG	2	6	3606653	3606658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9571	NC_021151	GA	3	6	3606671	3606676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9572	NC_021151	GGC	2	6	3606697	3606702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9573	NC_021151	GTT	3	9	3606722	3606730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9574	NC_021151	GCG	2	6	3606754	3606759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9575	NC_021151	GC	3	6	3608819	3608824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9576	NC_021151	CAA	2	6	3608846	3608851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9577	NC_021151	GC	4	8	3609519	3609526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9578	NC_021151	CT	3	6	3609540	3609545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9579	NC_021151	GAC	2	6	3609576	3609581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9580	NC_021151	ATT	2	6	3610927	3610932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9581	NC_021151	CGC	2	6	3611901	3611906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9582	NC_021151	ACA	2	6	3612374	3612379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9583	NC_021151	AC	3	6	3612431	3612436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9584	NC_021151	TTTG	2	8	3613303	3613310	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9585	NC_021151	GACC	2	8	3615404	3615411	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9586	NC_021151	ACC	2	6	3616670	3616675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9587	NC_021151	A	6	6	3616722	3616727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9588	NC_021151	GGC	2	6	3617313	3617318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9591	NC_021151	AG	3	6	3618798	3618803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9592	NC_021151	GCCAG	2	10	3618846	3618855	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9593	NC_021151	ACG	2	6	3618897	3618902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9594	NC_021151	ATG	2	6	3618923	3618928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9595	NC_021151	A	6	6	3618945	3618950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9596	NC_021151	TAA	2	6	3618972	3618977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9597	NC_021151	C	6	6	3620284	3620289	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9598	NC_021151	TA	3	6	3620418	3620423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9599	NC_021151	AGAAA	2	10	3620484	3620493	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9600	NC_021151	T	6	6	3623400	3623405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9601	NC_021151	T	8	8	3623409	3623416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9602	NC_021151	CGG	2	6	3623456	3623461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9603	NC_021151	CAA	2	6	3623470	3623475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9604	NC_021151	GCTG	2	8	3623503	3623510	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9605	NC_021151	CAA	2	6	3623591	3623596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9606	NC_021151	ACT	2	6	3625870	3625875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9607	NC_021151	ATT	2	6	3625887	3625892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9608	NC_021151	AACT	2	8	3625915	3625922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9609	NC_021151	ATA	2	6	3625946	3625951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9610	NC_021151	ATTC	2	8	3625993	3626000	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9611	NC_021151	AATA	2	8	3626005	3626012	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9612	NC_021151	TGACC	2	10	3626033	3626042	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9613	NC_021151	ATAAA	2	10	3626056	3626065	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9614	NC_021151	TCT	2	6	3626083	3626088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9615	NC_021151	TCA	2	6	3626096	3626101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9616	NC_021151	CT	3	6	3626114	3626119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9617	NC_021151	ATTA	2	8	3626146	3626153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9618	NC_021151	TA	3	6	3632031	3632036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9619	NC_021151	TAA	2	6	3632041	3632046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9620	NC_021151	TCC	2	6	3632050	3632055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9621	NC_021151	CT	3	6	3632092	3632097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9622	NC_021151	TTG	2	6	3632630	3632635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9623	NC_021151	TAA	2	6	3632688	3632693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9624	NC_021151	TTA	3	9	3632765	3632773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9625	NC_021151	GAT	2	6	3632832	3632837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9626	NC_021151	TATT	2	8	3632877	3632884	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9627	NC_021151	CCA	2	6	3632885	3632890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9628	NC_021151	CAA	2	6	3632907	3632912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9629	NC_021151	A	7	7	3633115	3633121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9630	NC_021151	T	7	7	3633137	3633143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9631	NC_021151	ACTA	2	8	3636522	3636529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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