MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 13098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_021151	AAT	2	6	3411504	3411509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_021151	GAAA	2	8	3411550	3411557	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_021151	TCA	2	6	3411613	3411618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_021151	AAT	2	6	3411627	3411632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_021151	CAC	2	6	3411640	3411645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9006	NC_021151	AATT	2	8	3411653	3411660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_021151	TCT	2	6	3411681	3411686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_021151	CCG	2	6	3411726	3411731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9009	NC_021151	CTTT	2	8	3411772	3411779	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9010	NC_021151	CGT	2	6	3411789	3411794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9011	NC_021151	TCAT	2	8	3411801	3411808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9012	NC_021151	CTTT	2	8	3411888	3411895	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9013	NC_021151	CGT	2	6	3411905	3411910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_021151	TCAT	2	8	3411917	3411924	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9015	NC_021151	GCC	2	6	3411928	3411933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9016	NC_021151	CTTT	2	8	3412004	3412011	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9017	NC_021151	CGT	2	6	3412021	3412026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_021151	TCAT	2	8	3412033	3412040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9019	NC_021151	GCC	2	6	3412044	3412049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9020	NC_021151	CTTT	2	8	3412120	3412127	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9021	NC_021151	CGT	2	6	3412137	3412142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9022	NC_021151	TCAT	2	8	3412149	3412156	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9023	NC_021151	GCC	2	6	3412160	3412165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9024	NC_021151	GAT	2	6	3412214	3412219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_021151	CTTT	2	8	3412236	3412243	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9026	NC_021151	CGT	2	6	3412253	3412258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9027	NC_021151	TCAT	2	8	3412265	3412272	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9028	NC_021151	GCC	2	6	3412276	3412281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9029	NC_021151	CCG	2	6	3412298	3412303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9030	NC_021151	CTTT	2	8	3412344	3412351	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9031	NC_021151	CGT	2	6	3412361	3412366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9032	NC_021151	TCAT	2	8	3412373	3412380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9033	NC_021151	GCC	2	6	3412384	3412389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9034	NC_021151	CCG	2	6	3412406	3412411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9035	NC_021151	GAA	2	6	3412425	3412430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_021151	TCAT	2	8	3412469	3412476	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9037	NC_021151	AGC	2	6	3412504	3412509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_021151	CG	3	6	3412599	3412604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9039	NC_021151	CGG	2	6	3412659	3412664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9040	NC_021151	CT	3	6	3412669	3412674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9041	NC_021151	C	7	7	3412695	3412701	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9042	NC_021151	TCC	2	6	3412741	3412746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9043	NC_021151	GAC	3	9	3412769	3412777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9044	NC_021151	GCG	2	6	3412781	3412786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9045	NC_021151	GC	3	6	3412805	3412810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9046	NC_021151	CG	3	6	3412824	3412829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9047	NC_021151	TC	3	6	3414975	3414980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9048	NC_021151	GCC	2	6	3415808	3415813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9049	NC_021151	TAT	3	9	3415938	3415946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_021151	ATT	2	6	3416046	3416051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_021151	CA	3	6	3416097	3416102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9052	NC_021151	A	6	6	3416126	3416131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_021151	TAACCA	2	12	3416236	3416247	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9054	NC_021151	ATC	2	6	3416268	3416273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9055	NC_021151	CCA	2	6	3417970	3417975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9056	NC_021151	ATTCAA	2	12	3417983	3417994	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9057	NC_021151	GCA	2	6	3418048	3418053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9058	NC_021151	T	7	7	3419907	3419913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_021151	TCG	2	6	3419919	3419924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_021151	CAC	2	6	3419985	3419990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9061	NC_021151	ACAAA	2	10	3420065	3420074	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9062	NC_021151	TTTC	2	8	3420091	3420098	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9063	NC_021151	TGA	2	6	3420128	3420133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_021151	TG	3	6	3420143	3420148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_021151	TTATTT	2	12	3420182	3420193	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_021151	TCC	2	6	3424269	3424274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9067	NC_021151	CGG	2	6	3424285	3424290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9068	NC_021151	AC	3	6	3424328	3424333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9069	NC_021151	ACA	2	6	3424392	3424397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9070	NC_021151	GAA	3	9	3424422	3424430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9071	NC_021151	ATA	2	6	3426216	3426221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9072	NC_021151	ATCA	2	8	3429964	3429971	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9073	NC_021151	GTC	2	6	3430893	3430898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9074	NC_021151	A	7	7	3430930	3430936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_021151	ATC	2	6	3434598	3434603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9078	NC_021151	GGA	2	6	3435367	3435372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9079	NC_021151	GGC	2	6	3437740	3437745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9080	NC_021151	CAA	2	6	3437752	3437757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9081	NC_021151	ATT	2	6	3437779	3437784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_021151	GCA	2	6	3437829	3437834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9083	NC_021151	GAG	2	6	3438895	3438900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9084	NC_021151	GGC	2	6	3439788	3439793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9085	NC_021151	AGCGC	2	10	3439841	3439850	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9086	NC_021151	AAC	2	6	3439897	3439902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9087	NC_021151	TA	3	6	3441697	3441702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_021151	TATGA	2	10	3441709	3441718	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9089	NC_021151	TTA	2	6	3441801	3441806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9090	NC_021151	ATC	2	6	3441816	3441821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9091	NC_021151	CT	4	8	3443662	3443669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9092	NC_021151	TC	3	6	3443692	3443697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9093	NC_021151	A	7	7	3443738	3443744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9094	NC_021151	TTTAC	2	10	3443775	3443784	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9095	NC_021151	GTA	2	6	3445701	3445706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_021151	GGC	2	6	3445726	3445731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9097	NC_021151	TCA	2	6	3445745	3445750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9098	NC_021151	AAC	3	9	3445812	3445820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9099	NC_021151	TGAA	2	8	3446787	3446794	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_021151	CAA	2	6	3446815	3446820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9101	NC_021151	CCAG	2	8	3446826	3446833	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9102	NC_021151	ATA	2	6	3449010	3449015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_021151	ATA	2	6	3449037	3449042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_021151	CGT	2	6	3449048	3449053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9105	NC_021151	TCT	2	6	3449064	3449069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9106	NC_021151	AACCCT	2	12	3449092	3449103	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
9107	NC_021151	CG	3	6	3449129	3449134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9108	NC_021151	TCAT	2	8	3449153	3449160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9109	NC_021151	CAA	2	6	3449163	3449168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9110	NC_021151	TGC	2	6	3449189	3449194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9111	NC_021151	CTG	2	6	3449198	3449203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9112	NC_021151	A	6	6	3449205	3449210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_021151	CGC	2	6	3449584	3449589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9114	NC_021151	AAT	2	6	3449601	3449606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_021151	GCG	2	6	3449621	3449626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9116	NC_021151	CT	3	6	3449644	3449649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9117	NC_021151	A	6	6	3451039	3451044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_021151	ATC	2	6	3451109	3451114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9119	NC_021151	CAA	2	6	3451134	3451139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9120	NC_021151	GGC	2	6	3451140	3451145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9121	NC_021151	GAGC	2	8	3451191	3451198	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9122	NC_021151	GAC	2	6	3451225	3451230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9123	NC_021151	TTCC	2	8	3453919	3453926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9124	NC_021151	A	7	7	3455939	3455945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9125	NC_021151	A	6	6	3455981	3455986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_021151	CGG	2	6	3456032	3456037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9127	NC_021151	T	7	7	3456060	3456066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_021151	CGA	2	6	3456153	3456158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9129	NC_021151	CGA	2	6	3456176	3456181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9130	NC_021151	GCT	2	6	3456190	3456195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9131	NC_021151	CTG	2	6	3456253	3456258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9249	NC_021151	TTCA	2	8	3513016	3513023	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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9251	NC_021151	GATGT	2	10	3514439	3514448	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9252	NC_021151	TGC	3	9	3514466	3514474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9253	NC_021151	T	6	6	3514482	3514487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9254	NC_021151	ACG	2	6	3514489	3514494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9255	NC_021151	ACG	2	6	3515575	3515580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9256	NC_021151	CGT	2	6	3515594	3515599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9257	NC_021151	CGA	2	6	3515601	3515606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9258	NC_021151	CTC	2	6	3517665	3517670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9259	NC_021151	TCA	2	6	3517686	3517691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9260	NC_021151	GCGCG	2	10	3517755	3517764	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9261	NC_021151	CAG	2	6	3517798	3517803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9263	NC_021151	GCTG	2	8	3517950	3517957	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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