MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 13098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021151	TGC	2	6	1887773	1887778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_021151	CTT	2	6	1887835	1887840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_021151	CAGA	2	8	1887866	1887873	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5004	NC_021151	AGG	2	6	1887928	1887933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021151	CTTT	2	8	1887950	1887957	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5006	NC_021151	TTA	2	6	1890142	1890147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_021151	GCC	2	6	1890156	1890161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_021151	GGC	2	6	1890210	1890215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_021151	TCG	2	6	1890231	1890236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_021151	TCA	2	6	1890290	1890295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_021151	GCG	2	6	1890353	1890358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_021151	CTT	2	6	1893369	1893374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_021151	CGC	2	6	1893381	1893386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_021151	T	6	6	1895584	1895589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_021151	GAC	2	6	1895605	1895610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_021151	GCC	2	6	1895631	1895636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_021151	AGA	2	6	1895637	1895642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_021151	CTTA	2	8	1896158	1896165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_021151	T	6	6	1896191	1896196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_021151	TCTT	2	8	1897049	1897056	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5021	NC_021151	ATT	2	6	1897066	1897071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_021151	GCT	2	6	1897111	1897116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_021151	GA	4	8	1897154	1897161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021151	CGG	2	6	1897976	1897981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_021151	CCG	2	6	1897996	1898001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_021151	TA	3	6	1899002	1899007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_021151	AT	3	6	1899028	1899033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_021151	TTA	2	6	1899034	1899039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_021151	T	6	6	1899058	1899063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_021151	ATTT	2	8	1899128	1899135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_021151	CTC	2	6	1903708	1903713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_021151	TCCC	2	8	1906219	1906226	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5033	NC_021151	GGAG	2	8	1906291	1906298	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021151	CGC	2	6	1906314	1906319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_021151	CGG	2	6	1906334	1906339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_021151	CACAA	2	10	1906397	1906406	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5037	NC_021151	TTC	2	6	1907749	1907754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_021151	GTT	2	6	1907880	1907885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_021151	AGA	2	6	1907906	1907911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_021151	CAT	2	6	1907957	1907962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_021151	CAA	2	6	1909183	1909188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_021151	A	6	6	1909197	1909202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_021151	TCC	2	6	1909234	1909239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_021151	GCT	2	6	1909259	1909264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_021151	CTTT	2	8	1909273	1909280	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5046	NC_021151	A	6	6	1909284	1909289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_021151	A	7	7	1909297	1909303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_021151	TTA	3	9	1909320	1909328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_021151	A	7	7	1911105	1911111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_021151	T	6	6	1911124	1911129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_021151	GCA	2	6	1911209	1911214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_021151	TAGCG	2	10	1912640	1912649	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5053	NC_021151	T	6	6	1914855	1914860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_021151	GCA	2	6	1914864	1914869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_021151	GGT	2	6	1916343	1916348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_021151	AGG	2	6	1916361	1916366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_021151	AGA	2	6	1920352	1920357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_021151	A	6	6	1920360	1920365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_021151	ACA	2	6	1920392	1920397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_021151	GGCA	2	8	1920497	1920504	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5061	NC_021151	TTG	2	6	1920507	1920512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_021151	AAG	2	6	1920558	1920563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_021151	GATA	2	8	1920632	1920639	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_021151	CTGT	2	8	1920673	1920680	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5065	NC_021151	T	6	6	1920680	1920685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_021151	GGC	2	6	1920848	1920853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_021151	A	6	6	1920940	1920945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_021151	TC	3	6	1924875	1924880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_021151	TCT	2	6	1924882	1924887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_021151	G	6	6	1924906	1924911	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_021151	CGA	2	6	1924944	1924949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_021151	GCA	2	6	1925072	1925077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_021151	AC	3	6	1929299	1929304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5074	NC_021151	ATA	2	6	1930229	1930234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_021151	ATG	2	6	1930242	1930247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_021151	GAATA	2	10	1930248	1930257	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_021151	GTC	2	6	1930286	1930291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_021151	AGA	2	6	1931189	1931194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021151	TTA	2	6	1932133	1932138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_021151	A	7	7	1933376	1933382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_021151	T	6	6	1933407	1933412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_021151	GCCC	2	8	1934384	1934391	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5083	NC_021151	TGT	2	6	1934398	1934403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_021151	CAA	2	6	1934703	1934708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_021151	AT	3	6	1934741	1934746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_021151	CGC	2	6	1934774	1934779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_021151	CAA	2	6	1938261	1938266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_021151	AAG	2	6	1938326	1938331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_021151	AAT	2	6	1938456	1938461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_021151	TCA	2	6	1938502	1938507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_021151	T	6	6	1941311	1941316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021151	CTG	2	6	1941437	1941442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_021151	CAGT	2	8	1941507	1941514	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5094	NC_021151	CAG	2	6	1941525	1941530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_021151	ATCC	2	8	1941576	1941583	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5096	NC_021151	CTT	2	6	1941630	1941635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_021151	TGAA	2	8	1941672	1941679	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_021151	TAA	2	6	1941688	1941693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_021151	TTA	2	6	1941803	1941808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_021151	AGG	2	6	1941843	1941848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_021151	ATA	2	6	1941872	1941877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_021151	TCA	2	6	1941913	1941918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_021151	GAATT	2	10	1941956	1941965	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_021151	CTAT	2	8	1942082	1942089	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5105	NC_021151	GAA	2	6	1942106	1942111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_021151	A	7	7	1943205	1943211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021151	AT	3	6	1943222	1943227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_021151	TA	4	8	1943229	1943236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_021151	AGC	2	6	1943238	1943243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_021151	AT	3	6	1943260	1943265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_021151	A	6	6	1943349	1943354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_021151	TTAAT	2	10	1943360	1943369	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_021151	ATT	2	6	1943541	1943546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_021151	GCAAGG	9	54	1943598	1943651	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5115	NC_021151	ATA	2	6	1943772	1943777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_021151	TGGC	2	8	1943794	1943801	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5117	NC_021151	GTT	2	6	1943844	1943849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_021151	TAA	2	6	1943944	1943949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_021151	ACT	2	6	1944032	1944037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_021151	TTG	2	6	1944058	1944063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_021151	TGA	2	6	1944064	1944069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_021151	TA	3	6	1944076	1944081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_021151	AGG	2	6	1944125	1944130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_021151	TTC	2	6	1944260	1944265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_021151	TAG	2	6	1944485	1944490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_021151	ATG	2	6	1944493	1944498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_021151	ACG	2	6	1944755	1944760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_021151	GACT	2	8	1944811	1944818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5129	NC_021151	TGC	2	6	1944829	1944834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_021151	TCA	2	6	1944963	1944968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_021151	GCTT	2	8	1945036	1945043	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5132	NC_021151	GTC	2	6	1945052	1945057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5134	NC_021151	CAT	2	6	1945120	1945125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5155	NC_021151	TCTGT	2	10	1953552	1953561	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5265	NC_021151	T	8	8	1999156	1999163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5266	NC_021151	TAT	2	6	1999181	1999186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5267	NC_021151	TAAA	2	8	1999194	1999201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5268	NC_021151	ATTA	2	8	1999202	1999209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5269	NC_021151	CAC	2	6	1999327	1999332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5271	NC_021151	AAAT	2	8	1999417	1999424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5272	NC_021151	ATCAA	2	10	1999456	1999465	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5273	NC_021151	GTT	2	6	1999491	1999496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5279	NC_021151	CAG	2	6	2000820	2000825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5280	NC_021151	T	7	7	2000867	2000873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5281	NC_021151	TC	3	6	2000875	2000880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5282	NC_021151	A	6	6	2002219	2002224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5283	NC_021151	GTT	2	6	2003583	2003588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5287	NC_021151	CCTAA	2	10	2005730	2005739	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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5310	NC_021151	T	6	6	2022665	2022670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5389	NC_021151	CCTG	2	8	2053889	2053896	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5391	NC_021151	CATG	2	8	2054082	2054089	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5392	NC_021151	GCA	2	6	2054095	2054100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5393	NC_021151	CATA	2	8	2054101	2054108	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5394	NC_021151	T	6	6	2054115	2054120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5395	NC_021151	CAG	2	6	2054144	2054149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5396	NC_021151	ACA	2	6	2054182	2054187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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