MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus M1 plasmid pSK67-M1

Total Repeats: 293

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021060	TTA	2	6	813	818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021060	CTA	2	6	835	840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021060	A	7	7	842	848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021060	GTA	2	6	857	862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021060	T	6	6	1691	1696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021060	ATAA	2	8	1709	1716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021060	A	6	6	1794	1799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021060	TGT	2	6	1850	1855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021060	GAT	2	6	1894	1899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021060	ATA	2	6	1900	1905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021060	TC	3	6	1919	1924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021060	GTC	2	6	1926	1931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021060	AG	3	6	1943	1948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021060	CAT	2	6	1982	1987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021060	TCA	2	6	1996	2001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021060	GCTGT	2	10	2005	2014	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021060	TAT	2	6	2019	2024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021060	CAA	2	6	2045	2050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021060	TAAT	2	8	2052	2059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021060	A	6	6	2084	2089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021060	ACT	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021060	TAG	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021060	AT	3	6	2204	2209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021060	CTT	2	6	3206	3211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021060	TTG	2	6	3239	3244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021060	ATGAT	2	10	3272	3281	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021060	AG	3	6	3306	3311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021060	ATT	2	6	3343	3348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021060	TTA	2	6	3393	3398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021060	TTA	2	6	3749	3754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021060	TAGCT	2	10	3796	3805	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021060	TA	3	6	3810	3815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021060	CTA	2	6	3849	3854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021060	TAA	2	6	3884	3889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021060	TAA	2	6	3910	3915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021060	A	6	6	3914	3919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021060	AAATT	2	10	3927	3936	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021060	TCG	2	6	3947	3952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021060	A	6	6	3961	3966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021060	A	7	7	3972	3978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021060	GA	3	6	3979	3984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021060	CT	4	8	3994	4001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021060	TTA	3	9	4012	4020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021060	ATA	2	6	4028	4033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021060	AT	3	6	4044	4049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021060	TAAT	2	8	4719	4726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021060	CAA	2	6	4763	4768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021060	TCTT	2	8	4809	4816	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021060	CCT	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_021060	AT	4	8	5518	5525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021060	AG	3	6	5538	5543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021060	TAA	2	6	5582	5587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021060	TTA	2	6	5601	5606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021060	TAA	2	6	5619	5624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021060	TAT	2	6	5648	5653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021060	CTT	2	6	7809	7814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021060	TAA	2	6	7826	7831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021060	ATT	2	6	7861	7866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021060	ATA	2	6	8765	8770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021060	ATC	2	6	8780	8785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021060	TAT	2	6	8796	8801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021060	TAT	2	6	8845	8850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021060	ATTT	2	8	8858	8865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021060	TA	3	6	8898	8903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021060	A	6	6	8905	8910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021060	ATAA	2	8	8913	8920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021060	TCA	2	6	8947	8952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021060	T	6	6	8990	8995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021060	AAT	2	6	9012	9017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021060	AT	3	6	9022	9027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021060	ACAA	2	8	9039	9046	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021060	TG	3	6	9054	9059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021060	CTA	2	6	10905	10910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021060	TA	3	6	10926	10931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021060	AGT	2	6	10976	10981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021060	T	6	6	10989	10994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021060	ATTA	2	8	11019	11026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021060	TTG	2	6	11028	11033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021060	ACAGC	2	10	11064	11073	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_021060	TGA	2	6	11077	11082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021060	ATG	2	6	11091	11096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021060	CCT	2	6	11126	11131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_021060	CT	3	6	11130	11135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021060	TCG	2	6	11136	11141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021060	GA	3	6	11152	11157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021060	TAT	3	9	11168	11176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021060	GTC	2	6	11215	11220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021060	TA	3	6	11227	11232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021060	T	6	6	11239	11244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021060	AGA	2	6	11261	11266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021060	ATC	2	6	11280	11285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021060	A	6	6	11308	11313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021060	TAA	2	6	11319	11324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021060	AT	3	6	11402	11407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021060	T	6	6	11409	11414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021060	TC	3	6	11442	11447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021060	ATT	2	6	11458	11463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021060	ATC	2	6	11485	11490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021060	TAC	2	6	11512	11517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021060	A	9	9	11532	11540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021060	TCC	2	6	12206	12211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_021060	T	6	6	12229	12234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021060	ATT	2	6	12235	12240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021060	TA	3	6	12247	12252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021060	A	7	7	12770	12776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021060	TC	3	6	12781	12786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021060	CCA	2	6	12855	12860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_021060	GTG	2	6	12887	12892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021060	A	7	7	12923	12929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021060	T	6	6	12940	12945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021060	TACA	2	8	12979	12986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021060	TA	3	6	13011	13016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021060	CAT	2	6	13037	13042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021060	T	7	7	13052	13058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021060	AT	4	8	13078	13085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021060	T	9	9	13085	13093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021060	A	7	7	13152	13158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021060	A	6	6	13243	13248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021060	CGT	2	6	13251	13256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021060	ACCT	2	8	13306	13313	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021060	A	6	6	13316	13321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021060	ATTTTA	2	12	13337	13348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021060	T	6	6	13349	13354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021060	T	6	6	13362	13367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021060	A	6	6	13468	13473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021060	TTTG	2	8	13498	13505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021060	AT	3	6	13516	13521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021060	T	6	6	13663	13668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021060	GAA	2	6	13886	13891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021060	TA	3	6	14041	14046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021060	CAT	2	6	14102	14107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021060	GCTA	2	8	14108	14115	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021060	TTAGA	2	10	14319	14328	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021060	T	7	7	14351	14357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021060	ATTTT	2	10	14365	14374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021060	TA	3	6	14446	14451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021060	CAAGA	2	10	14456	14465	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_021060	TAT	2	6	15492	15497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021060	AAT	2	6	15512	15517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021060	CTT	2	6	15646	15651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021060	CGT	2	6	15685	15690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_021060	T	6	6	16048	16053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021060	A	6	6	16054	16059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021060	AT	3	6	16190	16195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021060	TAAA	2	8	16218	16225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021060	T	7	7	16237	16243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021060	T	6	6	16330	16335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021060	ATTTTT	2	12	16349	16360	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021060	CAA	2	6	16454	16459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_021060	TACA	2	8	16510	16517	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_021060	T	6	6	16545	16550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021060	A	7	7	16553	16559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021060	A	7	7	16564	16570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021060	TCA	2	6	16579	16584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_021060	T	7	7	16991	16997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021060	CGT	2	6	16998	17003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_021060	GAT	2	6	17021	17026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021060	TAA	2	6	18054	18059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021060	AT	4	8	18110	18117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021060	A	6	6	18130	18135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_021060	TA	3	6	18137	18142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021060	TTA	2	6	18164	18169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021060	TA	3	6	18244	18249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021060	GTA	2	6	18376	18381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_021060	A	6	6	18402	18407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_021060	GGT	2	6	18417	18422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021060	TAAT	2	8	19236	19243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021060	TA	3	6	19278	19283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_021060	ATC	2	6	19784	19789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_021060	A	7	7	19813	19819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_021060	TGA	2	6	20046	20051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021060	T	6	6	20060	20065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_021060	T	7	7	20071	20077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021060	A	6	6	20080	20085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_021060	TGTA	2	8	20113	20120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021060	AT	3	6	20146	20151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_021060	A	6	6	20320	20325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_021060	TTTG	2	8	20439	20446	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
179	NC_021060	AT	3	6	20457	20462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_021060	TA	3	6	20494	20499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_021060	A	6	6	20512	20517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_021060	TAA	2	6	20583	20588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_021060	T	6	6	20598	20603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_021060	GA	3	6	20611	20616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
185	NC_021060	TAA	2	6	20682	20687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_021060	TTC	2	6	20700	20705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_021060	A	7	7	20707	20713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_021060	ATT	2	6	20722	20727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_021060	AGG	2	6	20741	20746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
190	NC_021060	ATT	2	6	20747	20752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_021060	T	6	6	21448	21453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_021060	TCT	2	6	21473	21478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
193	NC_021060	TA	3	6	21490	21495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_021060	TAT	2	6	21508	21513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_021060	TAA	2	6	21588	21593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_021060	TTA	2	6	21639	21644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_021060	CTT	2	6	21741	21746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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203	NC_021060	TAT	2	6	21843	21848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
204	NC_021060	T	6	6	21965	21970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_021060	ATTT	2	8	27332	27339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_021060	T	6	6	27365	27370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_021060	CAGC	2	8	27394	27401	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.