MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 8842

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021028	A	6	6	342715	342720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_021028	ATT	2	6	342784	342789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_021028	AAT	2	6	342792	342797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_021028	AAG	2	6	342803	342808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_021028	T	6	6	344420	344425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_021028	GGA	2	6	344463	344468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_021028	T	6	6	344494	344499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_021028	AGA	2	6	344570	344575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_021028	AAG	2	6	344584	344589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021028	TGCTT	2	10	344622	344631	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1511	NC_021028	GCT	2	6	344635	344640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_021028	TCA	2	6	344674	344679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_021028	CTAT	2	8	344709	344716	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_021028	ATA	2	6	344732	344737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_021028	CAA	2	6	344787	344792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_021028	GGA	2	6	344868	344873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_021028	ATA	3	9	344949	344957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_021028	A	6	6	345008	345013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_021028	CATT	2	8	345061	345068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_021028	TCT	2	6	345102	345107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_021028	CTT	2	6	345124	345129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_021028	CTA	2	6	345393	345398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_021028	CAG	2	6	345492	345497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_021028	TTG	2	6	345499	345504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_021028	GCT	2	6	345712	345717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_021028	ATC	2	6	345778	345783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1528	NC_021028	A	6	6	345844	345849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_021028	TGA	2	6	345956	345961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1531	NC_021028	TGG	2	6	346032	346037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_021028	AAT	2	6	346039	346044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_021028	ACTTC	2	10	346148	346157	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1534	NC_021028	ATTG	2	8	346167	346174	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021028	TGGA	2	8	346181	346188	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_021028	CAA	2	6	346339	346344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1538	NC_021028	CAAA	2	8	346435	346442	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_021028	GGAT	2	8	346538	346545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_021028	CTTC	2	8	346546	346553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_021028	GAT	2	6	346594	346599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_021028	AGT	2	6	346600	346605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_021028	AGC	2	6	346620	346625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_021028	TGA	2	6	346637	346642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_021028	TCG	2	6	346780	346785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1547	NC_021028	A	6	6	346812	346817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_021028	TTA	2	6	346830	346835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_021028	AAG	2	6	346854	346859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_021028	GAT	2	6	346865	346870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_021028	ATACT	2	10	346897	346906	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1552	NC_021028	A	7	7	346929	346935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_021028	TTGA	2	8	346969	346976	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_021028	GCAT	2	8	346982	346989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_021028	ATG	2	6	347072	347077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_021028	TGAT	2	8	347111	347118	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_021028	AGAT	2	8	347135	347142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_021028	AG	3	6	347198	347203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_021028	T	6	6	347211	347216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_021028	AT	3	6	347277	347282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_021028	A	6	6	347323	347328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021028	AATT	2	8	347375	347382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_021028	GA	3	6	348087	348092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_021028	A	6	6	348118	348123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_021028	AAG	2	6	348136	348141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_021028	AGA	2	6	348144	348149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1568	NC_021028	ACT	2	6	348244	348249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1570	NC_021028	A	6	6	348353	348358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021028	ATTT	2	8	348431	348438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_021028	T	6	6	348515	348520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021028	TGG	2	6	348544	348549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1586	NC_021028	TAA	2	6	349624	349629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_021028	TTGA	2	8	354647	354654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_021028	TTCTT	2	10	354699	354708	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1601	NC_021028	GTCT	2	8	354804	354811	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1603	NC_021028	ATG	2	6	354924	354929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_021028	TCA	2	6	354943	354948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_021028	GAT	2	6	354968	354973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1607	NC_021028	A	6	6	355103	355108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_021028	CT	3	6	355124	355129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_021028	T	6	6	356164	356169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_021028	AAAG	2	8	356178	356185	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_021028	TTA	2	6	356281	356286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_021028	ATT	2	6	356307	356312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_021028	T	6	6	356311	356316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_021028	AGGA	2	8	356347	356354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_021028	T	6	6	356358	356363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1617	NC_021028	TAT	2	6	364666	364671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_021028	T	7	7	365254	365260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_021028	ATA	3	9	365263	365271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1622	NC_021028	AG	4	8	365848	365855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_021028	GTA	2	6	365926	365931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_021028	GAT	2	6	365970	365975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_021028	GAAG	2	8	365980	365987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_021028	T	6	6	366069	366074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_021028	TTCT	2	8	368692	368699	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1628	NC_021028	ATAAA	2	10	368717	368726	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_021028	GCAGTT	2	12	370882	370893	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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1631	NC_021028	GAG	2	6	370910	370915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_021028	TA	3	6	370920	370925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_021028	TAC	2	6	370946	370951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_021028	AGG	2	6	370961	370966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_021028	AT	3	6	370967	370972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_021028	GGA	2	6	372003	372008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1913	NC_021028	TTC	2	6	435684	435689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1914	NC_021028	CTGAC	2	10	435703	435712	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1916	NC_021028	TCCAG	2	10	435728	435737	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1921	NC_021028	GAT	2	6	436132	436137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1933	NC_021028	TAT	2	6	439056	439061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1937	NC_021028	T	6	6	439097	439102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1945	NC_021028	ATA	2	6	441714	441719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1964	NC_021028	CAA	2	6	443634	443639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1974	NC_021028	AG	3	6	444109	444114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1975	NC_021028	GTC	2	6	444136	444141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2000	NC_021028	TAG	2	6	451951	451956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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