MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 8842

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021028	TA	3	6	187401	187406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021028	TAA	2	6	187417	187422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021028	CAAA	2	8	187436	187443	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_021028	TAT	2	6	187463	187468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021028	GA	4	8	188360	188367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021028	AGA	2	6	188406	188411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_021028	AG	3	6	188432	188437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021028	T	6	6	192179	192184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_021028	TGG	2	6	192209	192214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021028	ATT	2	6	195889	195894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021028	AGG	2	6	195895	195900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_021028	A	6	6	196450	196455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021028	GTT	2	6	196481	196486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021028	T	6	6	196485	196490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021028	GGT	2	6	197117	197122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021028	GTT	2	6	197127	197132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021028	T	6	6	197139	197144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021028	A	6	6	197170	197175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021028	TGAAA	2	10	197246	197255	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021028	AAT	2	6	198572	198577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021028	A	6	6	198602	198607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021028	A	6	6	198634	198639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021028	ATTTC	2	10	198772	198781	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1024	NC_021028	GCA	2	6	198795	198800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_021028	TTTC	2	8	198822	198829	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_021028	TTA	2	6	198840	198845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021028	TC	3	6	199755	199760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_021028	CTT	2	6	199788	199793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_021028	TTA	2	6	199802	199807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021028	CGT	2	6	199841	199846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_021028	GTT	2	6	199861	199866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021028	TGG	2	6	200019	200024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021028	TTCT	2	8	200035	200042	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_021028	TAAT	2	8	200063	200070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021028	A	6	6	202061	202066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021028	A	7	7	205805	205811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021028	ACT	2	6	205829	205834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_021028	TCT	2	6	205931	205936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_021028	ACC	2	6	206002	206007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_021028	CCCTG	2	10	206022	206031	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1041	NC_021028	GAT	2	6	206052	206057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021028	CTC	2	6	206138	206143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_021028	AG	3	6	206181	206186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021028	TGA	2	6	208137	208142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021028	TAA	2	6	208152	208157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021028	A	6	6	208165	208170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021028	TCC	2	6	209230	209235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_021028	AGA	2	6	209294	209299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021028	AGCT	2	8	209382	209389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_021028	A	6	6	209427	209432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021028	CTC	2	6	210167	210172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_021028	T	6	6	211145	211150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021028	TAT	2	6	211161	211166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021028	T	7	7	211203	211209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021028	AAT	2	6	211225	211230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021028	AGAA	2	8	211236	211243	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021028	A	6	6	215147	215152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_021028	A	6	6	215167	215172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021028	A	8	8	215176	215183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021028	T	6	6	215209	215214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021028	GGTA	2	8	215257	215264	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021028	AGAA	2	8	215715	215722	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021028	AAAT	2	8	216307	216314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021028	GA	3	6	217453	217458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021028	TAG	2	6	217586	217591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021028	TTA	2	6	217596	217601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_021028	TTA	2	6	217645	217650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_021028	ATTG	2	8	217673	217680	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021028	TTTTAC	2	12	219505	219516	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1070	NC_021028	AAT	2	6	219523	219528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021028	AGG	2	6	219604	219609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_021028	AGAA	2	8	221201	221208	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021028	AGG	2	6	221211	221216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021028	CTAA	2	8	221227	221234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_021028	GAA	2	6	221236	221241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021028	ATGAT	2	10	221246	221255	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021028	A	6	6	221317	221322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021028	AGAA	2	8	223032	223039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_021028	GCAT	2	8	223054	223061	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_021028	AGA	2	6	227178	227183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_021028	AGA	2	6	227189	227194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021028	GAA	2	6	227211	227216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021028	A	7	7	227241	227247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021028	A	6	6	227250	227255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021028	TAT	2	6	227297	227302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_021028	TAT	2	6	227402	227407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021028	A	6	6	227901	227906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_021028	A	6	6	227930	227935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_021028	AGG	2	6	229534	229539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_021028	AAGGA	2	10	233488	233497	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021028	AGG	2	6	234052	234057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_021028	GAA	2	6	234386	234391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021028	CA	3	6	234422	234427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_021028	A	7	7	234484	234490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_021028	ACAA	2	8	235079	235086	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_021028	GTTCA	2	10	235122	235131	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1100	NC_021028	ATC	2	6	235760	235765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_021028	ACC	2	6	235767	235772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_021028	AGG	2	6	236188	236193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021028	ATG	2	6	236950	236955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021028	AAAAT	2	10	238929	238938	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021028	TTG	2	6	239654	239659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021028	ATCGA	2	10	239677	239686	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1107	NC_021028	TCG	2	6	240001	240006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_021028	ACAA	2	8	240048	240055	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_021028	AGG	2	6	240454	240459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021028	AGG	2	6	241830	241835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021028	ATC	2	6	242229	242234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_021028	TTG	2	6	242239	242244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021028	ATG	3	9	242251	242259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021028	TCA	2	6	242322	242327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_021028	TAG	2	6	242338	242343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021028	T	6	6	242363	242368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021028	AAC	2	6	242375	242380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_021028	AAG	2	6	242470	242475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_021028	TAAA	2	8	244161	244168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021028	CCT	2	6	244171	244176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_021028	ATT	2	6	244180	244185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021028	TTTA	2	8	244235	244242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021028	ATA	2	6	244263	244268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021028	TTTTA	2	10	244300	244309	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021028	TCAT	2	8	244310	244317	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_021028	ATA	2	6	244321	244326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021028	GGA	2	6	244336	244341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021028	CTTG	2	8	245051	245058	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_021028	A	6	6	245096	245101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_021028	AGT	2	6	246620	246625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021028	AAAG	2	8	246636	246643	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021028	AAGA	2	8	246735	246742	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021028	GAA	2	6	246744	246749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021028	AGG	2	6	246752	246757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021028	TGA	2	6	247947	247952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_021028	CATAAT	2	12	247953	247964	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1138	NC_021028	TAG	2	6	248040	248045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1272	NC_021028	ACAA	2	8	279282	279289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1273	NC_021028	AAT	2	6	279306	279311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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