MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 8842

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021028	CAG	2	6	118848	118853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_021028	CTT	2	6	118908	118913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_021028	AAG	2	6	118963	118968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021028	GCA	2	6	119022	119027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_021028	TTGA	2	8	119031	119038	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021028	TAA	2	6	119079	119084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021028	GTT	2	6	119154	119159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021028	ATAAA	2	10	119202	119211	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021028	TTTG	2	8	119228	119235	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021028	GTG	2	6	119239	119244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021028	T	6	6	119279	119284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021028	TAACC	2	10	119300	119309	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
513	NC_021028	TAA	2	6	119327	119332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021028	A	6	6	119354	119359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021028	GGA	2	6	119390	119395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021028	AGG	2	6	120332	120337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021028	TAAAAA	2	12	121324	121335	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021028	A	7	7	121331	121337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021028	ATTC	2	8	122847	122854	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
520	NC_021028	T	7	7	122912	122918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021028	AAAT	2	8	123005	123012	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021028	ATAA	2	8	123048	123055	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021028	A	6	6	123054	123059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021028	AGCT	2	8	124168	124175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
525	NC_021028	GCT	2	6	124180	124185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_021028	AT	3	6	124233	124238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021028	GTTT	2	8	124291	124298	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021028	TGTA	2	8	124327	124334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021028	T	6	6	125244	125249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021028	A	6	6	125257	125262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021028	CCT	2	6	126467	126472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_021028	TTAG	2	8	126475	126482	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021028	TAG	2	6	126498	126503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021028	CCT	2	6	128339	128344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_021028	TA	4	8	128365	128372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021028	ACAT	2	8	128383	128390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
537	NC_021028	AAAG	2	8	128401	128408	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021028	TA	4	8	128437	128444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021028	A	6	6	128444	128449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021028	ATA	2	6	129638	129643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021028	TAA	2	6	129661	129666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021028	AGG	2	6	130877	130882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021028	AAC	2	6	132772	132777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_021028	TAT	2	6	132795	132800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021028	TCCA	2	8	132928	132935	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_021028	AGC	2	6	133002	133007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_021028	TCT	2	6	133062	133067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_021028	TAT	2	6	135330	135335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_021028	GGCTT	2	10	135350	135359	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
550	NC_021028	A	6	6	135421	135426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021028	A	6	6	135445	135450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021028	AGAA	2	8	135519	135526	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021028	ATA	2	6	136144	136149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021028	A	6	6	137063	137068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021028	ATA	2	6	137077	137082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021028	A	6	6	137124	137129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021028	ATG	2	6	137180	137185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021028	AGT	2	6	137234	137239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021028	ATG	2	6	137298	137303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021028	AAAT	2	8	137316	137323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021028	AGG	2	6	137354	137359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021028	T	6	6	138005	138010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021028	TAC	2	6	138156	138161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_021028	GTT	2	6	138166	138171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021028	GTT	2	6	138221	138226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021028	A	6	6	138227	138232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021028	GAAG	2	8	138245	138252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021028	TTG	2	6	138276	138281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_021028	ATA	2	6	138319	138324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021028	AAAT	2	8	138329	138336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021028	TTC	2	6	138628	138633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_021028	GTTC	2	8	141424	141431	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
573	NC_021028	TGAC	2	8	141441	141448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
574	NC_021028	AG	3	6	141467	141472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021028	GTA	2	6	141509	141514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021028	AAAG	2	8	142521	142528	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021028	ATG	2	6	142532	142537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021028	AGACTT	2	12	142572	142583	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
579	NC_021028	TAT	2	6	142690	142695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021028	GCC	2	6	142727	142732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_021028	A	6	6	142744	142749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021028	AT	3	6	142941	142946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021028	A	7	7	142956	142962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021028	TAG	2	6	143043	143048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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586	NC_021028	CTTT	2	8	143189	143196	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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588	NC_021028	T	6	6	143224	143229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021028	TGA	2	6	143277	143282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021028	ATT	2	6	143284	143289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021028	TCTTT	2	10	143340	143349	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
592	NC_021028	GTG	2	6	143482	143487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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594	NC_021028	AGT	2	6	143613	143618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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596	NC_021028	TGA	2	6	143930	143935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_021028	AGTTGA	2	12	144089	144100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021028	TGA	2	6	144169	144174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_021028	TGA	2	6	144186	144191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_021028	CAT	2	6	144221	144226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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604	NC_021028	TAG	2	6	144274	144279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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606	NC_021028	TTC	2	6	144333	144338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_021028	GAT	2	6	144389	144394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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609	NC_021028	GAC	2	6	144416	144421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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612	NC_021028	T	7	7	144542	144548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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614	NC_021028	G	6	6	144579	144584	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021028	ATA	2	6	144615	144620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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617	NC_021028	CTT	2	6	144684	144689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_021028	T	6	6	144688	144693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021028	CAT	2	6	144762	144767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_021028	AGCC	2	8	144799	144806	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
621	NC_021028	TCC	2	6	144833	144838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_021028	TAGA	2	8	144886	144893	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021028	ATT	2	6	144984	144989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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625	NC_021028	TTA	2	6	145098	145103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021028	TTA	2	6	145113	145118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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628	NC_021028	A	6	6	145201	145206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021028	TAA	2	6	145231	145236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021028	GTAG	2	8	145247	145254	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_021028	A	7	7	145284	145290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021028	GTAT	2	8	145305	145312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
633	NC_021028	GTT	2	6	145380	145385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021028	AGGA	2	8	145638	145645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021028	TAA	2	6	145710	145715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_021028	A	6	6	145714	145719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_021028	AT	3	6	146394	146399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_021028	A	7	7	146409	146415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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