MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 8842

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021028	T	6	6	1466054	1466059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_021028	T	10	10	1466080	1466089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_021028	AGG	2	6	1466107	1466112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_021028	TAA	2	6	1467704	1467709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_021028	GGA	2	6	1467713	1467718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_021028	T	6	6	1468688	1468693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_021028	CA	3	6	1468699	1468704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6508	NC_021028	GAA	2	6	1468751	1468756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_021028	A	6	6	1468755	1468760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_021028	ATA	2	6	1469406	1469411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_021028	GAA	2	6	1469418	1469423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_021028	CAAG	2	8	1469426	1469433	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6513	NC_021028	ATG	2	6	1469440	1469445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_021028	ATT	2	6	1469625	1469630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_021028	TC	3	6	1469670	1469675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6516	NC_021028	ATGGTC	2	12	1469743	1469754	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6517	NC_021028	TGAG	2	8	1469759	1469766	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_021028	GATT	2	8	1469819	1469826	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_021028	AAGC	2	8	1469830	1469837	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6520	NC_021028	TAGC	2	8	1469927	1469934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6521	NC_021028	ATAA	2	8	1469944	1469951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_021028	AGC	2	6	1469977	1469982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_021028	TAA	2	6	1470057	1470062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_021028	CTG	2	6	1470088	1470093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_021028	ATG	2	6	1470094	1470099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_021028	CTTC	2	8	1470126	1470133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6527	NC_021028	ATC	2	6	1470137	1470142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6528	NC_021028	GCCTT	2	10	1470167	1470176	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6529	NC_021028	TTG	2	6	1470316	1470321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_021028	AGA	2	6	1470349	1470354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_021028	AGAGC	2	10	1470375	1470384	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6532	NC_021028	TCA	2	6	1470411	1470416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_021028	GAC	2	6	1470474	1470479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_021028	AGG	2	6	1470526	1470531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_021028	GCT	2	6	1470551	1470556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_021028	CCA	2	6	1470579	1470584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6537	NC_021028	AC	3	6	1470597	1470602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6538	NC_021028	CAAGA	2	10	1470616	1470625	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6539	NC_021028	CAC	2	6	1470670	1470675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6540	NC_021028	AAT	2	6	1470717	1470722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_021028	TAC	2	6	1470732	1470737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_021028	CTA	2	6	1470762	1470767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_021028	ATA	2	6	1470791	1470796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_021028	TAC	2	6	1470801	1470806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_021028	GCT	2	6	1470887	1470892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_021028	ACC	2	6	1470973	1470978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6547	NC_021028	GCTT	2	8	1471085	1471092	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6548	NC_021028	GCTTG	2	10	1471122	1471131	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6549	NC_021028	CT	4	8	1471153	1471160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6550	NC_021028	AGC	2	6	1471213	1471218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_021028	ACG	2	6	1471225	1471230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6552	NC_021028	CTT	2	6	1471299	1471304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_021028	T	6	6	1471303	1471308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_021028	TTC	2	6	1471381	1471386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_021028	TGA	2	6	1471393	1471398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6557	NC_021028	CTT	2	6	1471608	1471613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_021028	CTGA	2	8	1471686	1471693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6559	NC_021028	GTC	2	6	1471698	1471703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_021028	TTC	2	6	1471831	1471836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_021028	GTT	2	6	1471895	1471900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_021028	GTC	2	6	1471916	1471921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6563	NC_021028	CTA	2	6	1471950	1471955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6564	NC_021028	CAT	2	6	1471972	1471977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_021028	A	6	6	1471994	1471999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_021028	ACCC	2	8	1472768	1472775	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6567	NC_021028	CAAA	2	8	1472781	1472788	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6571	NC_021028	TTA	2	6	1472972	1472977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_021028	TCT	2	6	1473009	1473014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6573	NC_021028	AAAAT	2	10	1473017	1473026	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_021028	CTG	2	6	1473043	1473048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_021028	T	6	6	1473091	1473096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6577	NC_021028	T	6	6	1473188	1473193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_021028	TGCCA	2	10	1473323	1473332	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6579	NC_021028	TAG	2	6	1473334	1473339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6583	NC_021028	TTA	2	6	1473471	1473476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_021028	GCC	2	6	1473494	1473499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6589	NC_021028	TC	3	6	1473940	1473945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6592	NC_021028	AACC	3	12	1474082	1474093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6593	NC_021028	GA	3	6	1474111	1474116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6597	NC_021028	AAT	2	6	1474225	1474230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_021028	AGG	2	6	1474271	1474276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_021028	AATA	2	8	1474350	1474357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_021028	GAA	2	6	1474370	1474375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_021028	CTC	2	6	1474379	1474384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6602	NC_021028	CTT	2	6	1474396	1474401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_021028	T	6	6	1474413	1474418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_021028	ATC	2	6	1474424	1474429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6608	NC_021028	CCTT	2	8	1474887	1474894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6609	NC_021028	ATC	2	6	1474916	1474921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6610	NC_021028	AAG	2	6	1474972	1474977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_021028	TCG	2	6	1474978	1474983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6612	NC_021028	GCTG	2	8	1475047	1475054	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6613	NC_021028	TGC	2	6	1475121	1475126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6614	NC_021028	TC	3	6	1475154	1475159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6615	NC_021028	A	6	6	1475187	1475192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_021028	CCAGA	2	10	1475249	1475258	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6617	NC_021028	T	6	6	1475262	1475267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_021028	CTT	3	9	1475343	1475351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_021028	T	6	6	1475407	1475412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_021028	ATC	2	6	1476448	1476453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6622	NC_021028	TCT	2	6	1476576	1476581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6625	NC_021028	AGA	2	6	1476632	1476637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_021028	ATA	2	6	1476645	1476650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_021028	T	6	6	1476674	1476679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_021028	T	6	6	1477097	1477102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_021028	T	7	7	1477104	1477110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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