MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 8575

< Previous12...6789101112131415161718Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_021026	AGG	2	6	1997746	1997751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_021026	AAAG	2	8	1997814	1997821	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_021026	CTA	2	6	1997959	1997964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_021026	TA	3	6	1998078	1998083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_021026	CCA	2	6	1998137	1998142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8506	NC_021026	ATC	2	6	1998278	1998283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8507	NC_021026	TCC	2	6	1998299	1998304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8508	NC_021026	ATT	2	6	1998309	1998314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_021026	T	6	6	1998313	1998318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_021026	GATA	2	8	1998348	1998355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_021026	TTA	2	6	1998415	1998420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_021026	ATT	2	6	1998438	1998443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_021026	A	6	6	1998499	1998504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_021026	T	6	6	1999587	1999592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_021026	CCT	2	6	1999622	1999627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8516	NC_021026	T	7	7	2000448	2000454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_021026	CTT	2	6	2000458	2000463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8518	NC_021026	TCA	2	6	2000507	2000512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8519	NC_021026	TAT	2	6	2000521	2000526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_021026	CTT	2	6	2001847	2001852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8521	NC_021026	A	7	7	2001875	2001881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_021026	TAA	2	6	2001886	2001891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_021026	CTT	2	6	2007120	2007125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8524	NC_021026	TAT	2	6	2007135	2007140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_021026	CCT	2	6	2009687	2009692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8526	NC_021026	TA	3	6	2009693	2009698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_021026	TAT	2	6	2009707	2009712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_021026	TC	4	8	2009784	2009791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8529	NC_021026	TCTT	2	8	2012853	2012860	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8530	NC_021026	TATC	2	8	2012886	2012893	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8531	NC_021026	TAAA	2	8	2012931	2012938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_021026	A	6	6	2012936	2012941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_021026	TTC	2	6	2012949	2012954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_021026	T	7	7	2014051	2014057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_021026	AAAT	2	8	2014081	2014088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_021026	TAG	2	6	2014181	2014186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_021026	AATA	2	8	2014187	2014194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_021026	T	7	7	2018480	2018486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_021026	TCT	2	6	2018489	2018494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8540	NC_021026	TTG	2	6	2018569	2018574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_021026	TTGT	2	8	2018582	2018589	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_021026	GTA	2	6	2018693	2018698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_021026	A	6	6	2018716	2018721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_021026	GAT	2	6	2018787	2018792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_021026	AATA	2	8	2018796	2018803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_021026	TCTCA	2	10	2018805	2018814	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8547	NC_021026	CTC	2	6	2018843	2018848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8548	NC_021026	ATTT	2	8	2018886	2018893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_021026	TTA	2	6	2019238	2019243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_021026	ACTG	2	8	2019278	2019285	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8551	NC_021026	TGA	2	6	2020035	2020040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_021026	AAT	2	6	2020092	2020097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_021026	GTT	2	6	2020102	2020107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_021026	T	8	8	2020106	2020113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_021026	T	6	6	2020148	2020153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_021026	ATA	2	6	2020178	2020183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_021026	A	6	6	2020195	2020200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_021026	A	6	6	2020216	2020221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_021026	AGG	2	6	2020256	2020261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_021026	TCTA	2	8	2020838	2020845	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8561	NC_021026	CAT	2	6	2020875	2020880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8562	NC_021026	CTA	2	6	2020897	2020902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8563	NC_021026	CCG	2	6	2020956	2020961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8564	NC_021026	T	7	7	2023290	2023296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_021026	TC	3	6	2023355	2023360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8566	NC_021026	T	7	7	2023369	2023375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_021026	T	6	6	2023390	2023395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_021026	A	6	6	2023399	2023404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_021026	TAT	2	6	2023428	2023433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_021026	CAG	2	6	2023442	2023447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_021026	ATT	2	6	2023517	2023522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_021026	T	6	6	2024057	2024062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8573	NC_021026	A	6	6	2024082	2024087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_021026	AAAG	2	8	2025410	2025417	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_021026	T	7	7	2026226	2026232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...6789101112131415161718Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.