MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 8575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021026	CAC	2	6	1845596	1845601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8002	NC_021026	TTC	2	6	1845671	1845676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_021026	AG	3	6	1845910	1845915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_021026	TCC	2	6	1845935	1845940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8005	NC_021026	AT	3	6	1845941	1845946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_021026	CTA	2	6	1846018	1846023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_021026	GCT	2	6	1846124	1846129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_021026	TTC	2	6	1846198	1846203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_021026	ACA	2	6	1846208	1846213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_021026	CTT	2	6	1846234	1846239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_021026	CTG	2	6	1846293	1846298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_021026	TCG	2	6	1846368	1846373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_021026	CCA	2	6	1846392	1846397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8014	NC_021026	CAGG	2	8	1846519	1846526	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8015	NC_021026	AAGC	2	8	1846567	1846574	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8016	NC_021026	TCC	2	6	1846575	1846580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8017	NC_021026	CGC	2	6	1846610	1846615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8018	NC_021026	T	7	7	1846696	1846702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_021026	TAC	2	6	1846713	1846718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_021026	TGT	2	6	1846725	1846730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_021026	TC	3	6	1846787	1846792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8022	NC_021026	T	6	6	1846841	1846846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_021026	T	7	7	1846860	1846866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_021026	T	7	7	1846871	1846877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_021026	CCG	2	6	1846935	1846940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8026	NC_021026	GTT	2	6	1846981	1846986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_021026	TAT	2	6	1847002	1847007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_021026	ACT	2	6	1847030	1847035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_021026	T	7	7	1847044	1847050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_021026	T	8	8	1847053	1847060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_021026	TAT	2	6	1849019	1849024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_021026	TATAT	2	10	1849049	1849058	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_021026	AG	3	6	1849094	1849099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_021026	TCT	2	6	1849126	1849131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_021026	TTC	2	6	1850484	1850489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_021026	TCT	2	6	1850500	1850505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_021026	T	7	7	1850530	1850536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_021026	A	6	6	1850615	1850620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_021026	AGAA	2	8	1850625	1850632	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_021026	TATCA	2	10	1851375	1851384	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8041	NC_021026	T	8	8	1851410	1851417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_021026	T	6	6	1851434	1851439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_021026	CTT	2	6	1851472	1851477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_021026	CTC	2	6	1853251	1853256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8045	NC_021026	TTATA	2	10	1853258	1853267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_021026	TCC	2	6	1853338	1853343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8047	NC_021026	TCA	2	6	1853513	1853518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_021026	CTGGA	2	10	1853618	1853627	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8049	NC_021026	TTC	2	6	1853628	1853633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_021026	TCAG	2	8	1853640	1853647	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8051	NC_021026	GATT	2	8	1853652	1853659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_021026	GAA	2	6	1853666	1853671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_021026	GGTA	2	8	1853699	1853706	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_021026	CAT	2	6	1853790	1853795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_021026	A	7	7	1853805	1853811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_021026	A	6	6	1853838	1853843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_021026	A	6	6	1853906	1853911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_021026	ATC	2	6	1853947	1853952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_021026	ATC	2	6	1853958	1853963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_021026	A	6	6	1855727	1855732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_021026	TG	3	6	1855778	1855783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_021026	A	6	6	1855797	1855802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_021026	AAG	2	6	1855817	1855822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_021026	TC	3	6	1858403	1858408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8065	NC_021026	A	7	7	1858957	1858963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_021026	T	6	6	1858980	1858985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_021026	CTT	2	6	1858986	1858991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_021026	TAG	2	6	1859012	1859017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8070	NC_021026	CGT	2	6	1860852	1860857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_021026	CGT	2	6	1860976	1860981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_021026	CTT	2	6	1861043	1861048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_021026	CGT	2	6	1861051	1861056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_021026	ATA	2	6	1861102	1861107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_021026	TGAT	2	8	1861138	1861145	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_021026	ATTC	2	8	1861161	1861168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8077	NC_021026	GAT	2	6	1861187	1861192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8080	NC_021026	AT	3	6	1861347	1861352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_021026	AAC	2	6	1861426	1861431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_021026	T	6	6	1861551	1861556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_021026	GATT	2	8	1861562	1861569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_021026	ATCA	2	8	1861584	1861591	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8085	NC_021026	GAG	2	6	1861613	1861618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8087	NC_021026	ATA	2	6	1862227	1862232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_021026	AGC	2	6	1864297	1864302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_021026	T	7	7	1864320	1864326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_021026	GTA	2	6	1864393	1864398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8096	NC_021026	A	6	6	1868579	1868584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_021026	GAG	2	6	1868618	1868623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_021026	AAAG	2	8	1868669	1868676	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_021026	ATG	3	9	1868738	1868746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_021026	AGCT	2	8	1868784	1868791	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8101	NC_021026	TGA	2	6	1868794	1868799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_021026	CTTC	2	8	1868836	1868843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8103	NC_021026	GAC	2	6	1868874	1868879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_021026	ATC	2	6	1869038	1869043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_021026	GAG	2	6	1869053	1869058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_021026	GTT	2	6	1869589	1869594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_021026	CTAT	2	8	1869626	1869633	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8108	NC_021026	TCT	2	6	1869640	1869645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_021026	CCA	2	6	1869701	1869706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8110	NC_021026	ATA	2	6	1869747	1869752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_021026	AGAA	2	8	1869755	1869762	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_021026	AGG	2	6	1869771	1869776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_021026	A	6	6	1871738	1871743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_021026	T	6	6	1871753	1871758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_021026	TTTC	2	8	1871771	1871778	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8116	NC_021026	TCC	2	6	1874136	1874141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8117	NC_021026	T	6	6	1874180	1874185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_021026	CCT	2	6	1874900	1874905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8119	NC_021026	A	6	6	1874934	1874939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_021026	T	6	6	1874981	1874986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_021026	AAGC	2	8	1875018	1875025	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8122	NC_021026	GAAAA	2	10	1876052	1876061	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_021026	A	6	6	1876058	1876063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_021026	ATTG	2	8	1876074	1876081	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_021026	TAT	2	6	1878584	1878589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_021026	TTC	2	6	1878625	1878630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_021026	AAT	2	6	1878680	1878685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_021026	TAA	2	6	1880028	1880033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_021026	TCC	2	6	1882392	1882397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8130	NC_021026	ATT	2	6	1882403	1882408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_021026	CGTA	2	8	1883416	1883423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8133	NC_021026	TAC	2	6	1883726	1883731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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