MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 8575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_021026	AGA	2	6	1640197	1640202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_021026	AGG	2	6	1640228	1640233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_021026	A	6	6	1641254	1641259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_021026	CCT	2	6	1642690	1642695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7005	NC_021026	TCATT	2	10	1642697	1642706	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7006	NC_021026	CTTAT	2	10	1642733	1642742	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7007	NC_021026	TA	3	6	1642743	1642748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_021026	AT	3	6	1642813	1642818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_021026	CTCTT	2	10	1642836	1642845	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
7010	NC_021026	ATA	2	6	1642867	1642872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_021026	T	6	6	1642920	1642925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_021026	TCATTA	2	12	1643859	1643870	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7013	NC_021026	AAAG	2	8	1643884	1643891	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_021026	T	6	6	1644529	1644534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_021026	CAA	3	9	1644542	1644550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_021026	CCG	2	6	1644559	1644564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7017	NC_021026	AGT	2	6	1645590	1645595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_021026	TCTT	2	8	1645674	1645681	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7019	NC_021026	A	6	6	1645716	1645721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_021026	TCT	2	6	1648084	1648089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_021026	TTA	2	6	1648108	1648113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_021026	AGC	2	6	1648281	1648286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_021026	TAG	2	6	1648483	1648488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_021026	CAA	2	6	1648508	1648513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_021026	CGT	2	6	1648545	1648550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_021026	CCA	2	6	1648567	1648572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7027	NC_021026	TGA	2	6	1648582	1648587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_021026	AAG	2	6	1648672	1648677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_021026	CTT	2	6	1648688	1648693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_021026	CGTC	2	8	1648765	1648772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7031	NC_021026	TTG	2	6	1648812	1648817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7033	NC_021026	AATAA	2	10	1649302	1649311	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7035	NC_021026	CAC	2	6	1649377	1649382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7036	NC_021026	AACT	2	8	1649396	1649403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7037	NC_021026	TCC	2	6	1649431	1649436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7038	NC_021026	ATTT	2	8	1649505	1649512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_021026	TCT	2	6	1649587	1649592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_021026	CAAT	2	8	1649624	1649631	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7041	NC_021026	TCACT	2	10	1649818	1649827	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7042	NC_021026	ACT	2	6	1649853	1649858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_021026	TAC	2	6	1649891	1649896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7045	NC_021026	ACC	2	6	1650253	1650258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7046	NC_021026	CTT	2	6	1651343	1651348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_021026	ATTT	2	8	1651501	1651508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_021026	CAAA	2	8	1651510	1651517	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7049	NC_021026	A	6	6	1651515	1651520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_021026	GTT	2	6	1651536	1651541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_021026	TCT	2	6	1651584	1651589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_021026	AT	3	6	1651598	1651603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_021026	GTTG	2	8	1651605	1651612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_021026	GCT	2	6	1651634	1651639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_021026	AATT	2	8	1651654	1651661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_021026	GTT	2	6	1651678	1651683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_021026	A	6	6	1651726	1651731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_021026	AAG	2	6	1652467	1652472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7060	NC_021026	A	6	6	1652505	1652510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_021026	CTG	2	6	1652539	1652544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_021026	A	6	6	1652560	1652565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_021026	TTG	2	6	1652578	1652583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_021026	CCAG	2	8	1652601	1652608	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7065	NC_021026	GCTA	2	8	1652655	1652662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7066	NC_021026	ATT	2	6	1652676	1652681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_021026	CT	3	6	1652740	1652745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7068	NC_021026	TTG	2	6	1652748	1652753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_021026	TATT	2	8	1652754	1652761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_021026	AAT	2	6	1652795	1652800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7074	NC_021026	T	7	7	1667092	1667098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_021026	ATA	2	6	1667927	1667932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7079	NC_021026	CAT	2	6	1668109	1668114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7081	NC_021026	AAC	2	6	1668238	1668243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7082	NC_021026	CTA	2	6	1668252	1668257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7085	NC_021026	TAT	2	6	1668364	1668369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_021026	A	6	6	1668375	1668380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_021026	TTGA	2	8	1668392	1668399	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7093	NC_021026	AGA	2	6	1669040	1669045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7095	NC_021026	AAT	2	6	1669251	1669256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7098	NC_021026	A	6	6	1669341	1669346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_021026	TCCT	2	8	1670382	1670389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7101	NC_021026	GA	3	6	1673931	1673936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7105	NC_021026	GAA	2	6	1675859	1675864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_021026	TGC	2	6	1675870	1675875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7109	NC_021026	CTG	2	6	1675905	1675910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7110	NC_021026	T	8	8	1675925	1675932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7113	NC_021026	TTG	2	6	1676028	1676033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_021026	T	8	8	1676048	1676055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_021026	AT	3	6	1676058	1676063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_021026	ACGG	2	8	1676162	1676169	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7117	NC_021026	AAATT	2	10	1676191	1676200	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_021026	AT	3	6	1676301	1676306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_021026	CTC	2	6	1676362	1676367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7120	NC_021026	A	7	7	1676576	1676582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_021026	AGA	2	6	1676598	1676603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7123	NC_021026	ATA	2	6	1677849	1677854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_021026	T	6	6	1677879	1677884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7127	NC_021026	ATC	2	6	1679475	1679480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7130	NC_021026	CTT	2	6	1679596	1679601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7132	NC_021026	CCT	2	6	1682746	1682751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7259	NC_021026	ATCA	2	8	1696833	1696840	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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