MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 8575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021026	GAA	2	6	1399429	1399434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_021026	TAT	2	6	1399444	1399449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_021026	TCT	2	6	1399450	1399455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_021026	T	6	6	1399531	1399536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_021026	AGCT	2	8	1399552	1399559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6006	NC_021026	GA	3	6	1399583	1399588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_021026	TTACT	2	10	1399670	1399679	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6008	NC_021026	T	7	7	1399712	1399718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_021026	T	6	6	1399723	1399728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_021026	ACCA	2	8	1399736	1399743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6011	NC_021026	AAT	2	6	1401163	1401168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_021026	TTAA	2	8	1401208	1401215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_021026	TTAA	2	8	1401230	1401237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_021026	ATA	2	6	1401309	1401314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_021026	TA	3	6	1401351	1401356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_021026	A	6	6	1401356	1401361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_021026	TTC	2	6	1402966	1402971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_021026	GGT	2	6	1402980	1402985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_021026	CTTTT	2	10	1403016	1403025	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6020	NC_021026	CTT	2	6	1403066	1403071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_021026	AAAAG	2	10	1403078	1403087	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_021026	CCT	2	6	1404391	1404396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_021026	TA	3	6	1404420	1404425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_021026	ATAG	2	8	1404429	1404436	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_021026	A	6	6	1404460	1404465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_021026	T	6	6	1404473	1404478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_021026	T	7	7	1404535	1404541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_021026	AGG	2	6	1404566	1404571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_021026	ATA	2	6	1405984	1405989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_021026	T	6	6	1408164	1408169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_021026	TCTTT	2	10	1408171	1408180	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6032	NC_021026	TC	3	6	1408201	1408206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6033	NC_021026	T	6	6	1408208	1408213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_021026	AGAA	2	8	1408230	1408237	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_021026	TCTT	2	8	1410505	1410512	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6036	NC_021026	TCC	2	6	1410524	1410529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6037	NC_021026	T	6	6	1410551	1410556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_021026	CT	5	10	1410583	1410592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6039	NC_021026	CAA	2	6	1410601	1410606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_021026	AAG	2	6	1410644	1410649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_021026	TTA	2	6	1410717	1410722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_021026	T	6	6	1410759	1410764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_021026	T	6	6	1410767	1410772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_021026	ATCA	2	8	1410794	1410801	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6045	NC_021026	ATT	2	6	1410827	1410832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_021026	ATTT	2	8	1410841	1410848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_021026	ATC	2	6	1410902	1410907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_021026	ATA	2	6	1410921	1410926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_021026	T	8	8	1410946	1410953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_021026	GCT	2	6	1411106	1411111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_021026	AC	3	6	1413251	1413256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_021026	TAG	2	6	1413287	1413292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_021026	AAC	2	6	1413309	1413314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_021026	AATT	2	8	1413331	1413338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_021026	AGC	2	6	1413353	1413358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_021026	TCAA	2	8	1413379	1413386	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6057	NC_021026	AATC	2	8	1413436	1413443	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6058	NC_021026	TCT	2	6	1414622	1414627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_021026	T	6	6	1414630	1414635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_021026	AAGAA	2	10	1414654	1414663	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_021026	CTT	2	6	1414688	1414693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_021026	GTT	2	6	1414766	1414771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_021026	ATC	2	6	1415817	1415822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_021026	TAT	2	6	1415864	1415869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_021026	A	7	7	1415900	1415906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_021026	T	9	9	1417106	1417114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_021026	TTA	2	6	1417122	1417127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6069	NC_021026	T	6	6	1419388	1419393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_021026	ATT	2	6	1419407	1419412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_021026	T	6	6	1419411	1419416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_021026	AGC	2	6	1419581	1419586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6074	NC_021026	TTA	2	6	1422255	1422260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6076	NC_021026	TAA	2	6	1422332	1422337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_021026	A	6	6	1422380	1422385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_021026	A	6	6	1422387	1422392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_021026	A	6	6	1422425	1422430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_021026	A	6	6	1422460	1422465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_021026	GGT	2	6	1422495	1422500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_021026	AACA	2	8	1422586	1422593	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6083	NC_021026	ACT	2	6	1422608	1422613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_021026	TA	3	6	1422695	1422700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_021026	TTAC	2	8	1422713	1422720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6086	NC_021026	TAA	2	6	1422754	1422759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6088	NC_021026	TAT	2	6	1422842	1422847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_021026	AAT	2	6	1422950	1422955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6093	NC_021026	ATG	2	6	1423202	1423207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_021026	A	7	7	1423208	1423214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_021026	A	6	6	1423216	1423221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_021026	TATT	2	8	1423228	1423235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6098	NC_021026	GAA	2	6	1423251	1423256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_021026	AGA	2	6	1423263	1423268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_021026	ATTT	2	8	1423310	1423317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_021026	AGA	3	9	1423320	1423328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_021026	A	6	6	1423328	1423333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_021026	ATT	2	6	1423337	1423342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_021026	AATA	3	12	1423380	1423391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_021026	A	6	6	1423400	1423405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_021026	TTA	2	6	1423406	1423411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_021026	ATC	2	6	1423471	1423476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_021026	ATG	2	6	1423502	1423507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_021026	TGA	2	6	1423530	1423535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6111	NC_021026	A	7	7	1423560	1423566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_021026	TAC	2	6	1423584	1423589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_021026	TGA	2	6	1423599	1423604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6115	NC_021026	GAA	2	6	1423663	1423668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_021026	A	6	6	1423706	1423711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_021026	TA	4	8	1423792	1423799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_021026	C	6	6	1423814	1423819	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6119	NC_021026	TCTT	2	8	1424692	1424699	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6120	NC_021026	TCC	2	6	1424711	1424716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6121	NC_021026	T	6	6	1424738	1424743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_021026	CT	3	6	1424804	1424809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_021026	T	6	6	1424819	1424824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_021026	CAA	2	6	1424865	1424870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_021026	AAG	2	6	1424908	1424913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_021026	TTA	2	6	1424981	1424986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6128	NC_021026	ATCA	2	8	1425058	1425065	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6129	NC_021026	ATT	2	6	1425091	1425096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_021026	ATTT	2	8	1425105	1425112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_021026	ATC	2	6	1425166	1425171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_021026	ATA	2	6	1425185	1425190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_021026	T	6	6	1425211	1425216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_021026	TCA	2	6	1425240	1425245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6135	NC_021026	T	6	6	1425268	1425273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_021026	TC	3	6	1425288	1425293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6137	NC_021026	A	6	6	1425302	1425307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6138	NC_021026	CTA	2	6	1425433	1425438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6139	NC_021026	ATT	2	6	1425455	1425460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6143	NC_021026	TAA	2	6	1427542	1427547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6144	NC_021026	TCT	2	6	1427551	1427556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6249	NC_021026	CTC	2	6	1448927	1448932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6264	NC_021026	CAGC	2	8	1452328	1452335	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6265	NC_021026	A	6	6	1452344	1452349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6266	NC_021026	GAT	2	6	1453394	1453399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6392	NC_021026	A	6	6	1464759	1464764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6393	NC_021026	CCAGA	2	10	1464821	1464830	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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6434	NC_021026	CAA	2	6	1470684	1470689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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