MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 8856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021006	CTT	2	6	1140	1145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021006	AG	3	6	1152	1157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021006	AATG	2	8	3605	3612	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021006	CA	3	6	7527	7532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021006	AGAT	2	8	10432	10439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021006	AT	3	6	10438	10443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021006	AAG	2	6	10451	10456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021006	AGG	2	6	10460	10465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021006	ATGG	2	8	11466	11473	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021006	T	6	6	11493	11498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021006	TTA	2	6	13188	13193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021006	TAT	2	6	13219	13224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021006	TGAT	2	8	13309	13316	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021006	CAA	2	6	13322	13327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021006	A	6	6	13326	13331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021006	T	6	6	13699	13704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021006	AGG	2	6	13717	13722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021006	ACA	2	6	13787	13792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021006	TGAA	2	8	13829	13836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021006	TAAA	2	8	13857	13864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021006	GAA	2	6	13871	13876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021006	A	7	7	13875	13881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021006	AGA	2	6	14128	14133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021006	GAA	2	6	14179	14184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021006	ATCA	2	8	14188	14195	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021006	ACT	2	6	14212	14217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021006	TGGT	2	8	14259	14266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021006	TAAAAA	2	12	14384	14395	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021006	T	6	6	14404	14409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021006	A	6	6	14411	14416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021006	TAT	2	6	14420	14425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021006	ATT	2	6	14458	14463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021006	A	6	6	18390	18395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021006	CTAA	2	8	18396	18403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021006	AGG	2	6	18404	18409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021006	T	6	6	18414	18419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021006	ATGA	2	8	18469	18476	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021006	ATA	2	6	18524	18529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021006	AAAG	2	8	18535	18542	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021006	ACA	2	6	18642	18647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021006	TTA	2	6	18664	18669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021006	A	7	7	18673	18679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021006	TAC	2	6	18789	18794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021006	GAT	2	6	18804	18809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021006	AAGC	2	8	18880	18887	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021006	AG	5	10	19104	19113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021006	GA	3	6	19115	19120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021006	T	6	6	19142	19147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021006	AGA	2	6	19179	19184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021006	CA	4	8	19214	19221	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021006	A	8	8	19452	19459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021006	AGA	2	6	19506	19511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021006	TAA	2	6	19713	19718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021006	CAAGA	2	10	19756	19765	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021006	ATT	2	6	19771	19776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021006	TAA	2	6	19786	19791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021006	AAT	2	6	19817	19822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021006	A	7	7	19828	19834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021006	AAAG	2	8	19849	19856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021006	TAAG	2	8	19864	19871	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021006	AGGG	2	8	19883	19890	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021006	GAA	2	6	19907	19912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021006	TGTCAA	2	12	20002	20013	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021006	A	6	6	20012	20017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021006	TTAA	2	8	20019	20026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021006	ATT	2	6	20034	20039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021006	AGG	2	6	20056	20061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021006	TA	3	6	20062	20067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021006	TTAAA	2	10	20268	20277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021006	A	7	7	20275	20281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021006	TA	3	6	20283	20288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021006	A	6	6	20331	20336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021006	TTG	2	6	20448	20453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021006	ATG	2	6	20516	20521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021006	TTCT	2	8	20604	20611	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021006	GGAA	2	8	20781	20788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021006	TGG	2	6	20796	20801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021006	TAC	2	6	20898	20903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021006	TTTG	2	8	20982	20989	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021006	AAGA	2	8	21003	21010	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021006	TA	3	6	21026	21031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021006	GAA	3	9	21050	21058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021006	GCT	2	6	21169	21174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021006	CA	3	6	21237	21242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021006	AAGAAA	2	12	21307	21318	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021006	TTA	2	6	21342	21347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021006	GAT	2	6	21369	21374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021006	AGA	2	6	21411	21416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021006	GAT	2	6	21424	21429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021006	AGTA	2	8	21456	21463	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021006	ATG	2	6	21481	21486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021006	A	6	6	21491	21496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021006	GAT	2	6	21652	21657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021006	GTAT	2	8	21668	21675	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021006	ATC	2	6	21696	21701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021006	AT	3	6	21763	21768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021006	ATGA	2	8	21805	21812	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021006	GAA	2	6	21865	21870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021006	AGA	2	6	21924	21929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021006	ATG	2	6	21953	21958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021006	TTA	2	6	21979	21984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021006	CGA	2	6	22114	22119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021006	GT	3	6	22142	22147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021006	AGTA	2	8	22168	22175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021006	ATG	2	6	22182	22187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021006	GAT	2	6	22189	22194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021006	AG	3	6	22197	22202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021006	GA	3	6	22255	22260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021006	TA	3	6	22855	22860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021006	G	6	6	22897	22902	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021006	T	6	6	23030	23035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021006	TAT	2	6	23092	23097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021006	TGA	2	6	23147	23152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021006	TAT	2	6	23356	23361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021006	T	6	6	23361	23366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021006	TGA	2	6	23398	23403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021006	AGG	2	6	24209	24214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021006	ACG	2	6	25142	25147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021006	TA	3	6	26072	26077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021006	T	6	6	26087	26092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021006	AAC	2	6	26128	26133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021006	TGAA	2	8	26207	26214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021006	TGA	2	6	27982	27987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021006	TA	3	6	28011	28016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021006	TAA	2	6	28020	28025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021006	CAA	2	6	28146	28151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021006	AAG	2	6	28224	28229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021006	TTG	2	6	28707	28712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021006	TAG	2	6	28754	28759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021006	ACA	2	6	28791	28796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021006	TAA	2	6	28833	28838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021006	A	6	6	28996	29001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021006	AAT	2	6	29009	29014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021006	AAT	2	6	29076	29081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021006	T	6	6	29105	29110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021006	T	6	6	31604	31609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021006	TGC	2	6	31663	31668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021006	G	6	6	31713	31718	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021006	AGGA	2	8	31721	31728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021006	AT	3	6	31774	31779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021006	TA	3	6	31821	31826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021006	GTA	2	6	31886	31891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021006	GAA	2	6	31928	31933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021006	AATGGA	2	12	31942	31953	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021006	GAA	2	6	31956	31961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021006	CT	3	6	31982	31987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021006	GA	3	6	32316	32321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021006	A	7	7	33155	33161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021006	AT	3	6	33182	33187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021006	TAA	2	6	33302	33307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021006	CAA	2	6	33351	33356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_021006	CAT	2	6	33369	33374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_021006	GAA	2	6	33414	33419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021006	ATG	2	6	33444	33449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_021006	ATT	2	6	33633	33638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_021006	TTGAA	2	10	33694	33703	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021006	T	6	6	33716	33721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_021006	T	6	6	33749	33754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021006	AAAGC	2	10	33759	33768	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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168	NC_021006	T	6	6	33888	33893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_021006	GAA	2	6	34038	34043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_021006	A	6	6	34419	34424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_021006	ATA	2	6	56393	56398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_021006	TGA	2	6	93539	93544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
445	NC_021006	TGA	2	6	93556	93561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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