MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 8563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021005	TCC	2	6	1486845	1486850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6502	NC_021005	A	6	6	1486894	1486899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_021005	A	7	7	1487344	1487350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_021005	GATT	2	8	1487974	1487981	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_021005	GAA	2	6	1488003	1488008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_021005	CT	3	6	1489843	1489848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6507	NC_021005	AAT	2	6	1489858	1489863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_021005	T	6	6	1489863	1489868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_021005	T	6	6	1489903	1489908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_021005	A	6	6	1490033	1490038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_021005	TAA	2	6	1491408	1491413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_021005	ATTTC	2	10	1491457	1491466	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6513	NC_021005	CATC	2	8	1491475	1491482	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6514	NC_021005	CTC	2	6	1491486	1491491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6515	NC_021005	T	6	6	1491494	1491499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_021005	AGTA	2	8	1491508	1491515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_021005	TCC	2	6	1493758	1493763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6518	NC_021005	ATT	2	6	1493783	1493788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_021005	TTAAAA	2	12	1493794	1493805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_021005	GTA	2	6	1493821	1493826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_021005	CTC	2	6	1493866	1493871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6522	NC_021005	T	6	6	1495030	1495035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_021005	CTT	2	6	1497142	1497147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_021005	CTT	2	6	1498881	1498886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_021005	TTC	2	6	1500288	1500293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_021005	TCT	2	6	1500758	1500763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_021005	CCT	2	6	1500766	1500771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6528	NC_021005	TTC	2	6	1500805	1500810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_021005	CTA	2	6	1500824	1500829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_021005	ACT	2	6	1500845	1500850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_021005	CT	3	6	1500849	1500854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6532	NC_021005	TA	3	6	1500906	1500911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_021005	CTA	2	6	1500957	1500962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_021005	TCT	2	6	1500974	1500979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_021005	TTCA	2	8	1500986	1500993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6536	NC_021005	AGG	2	6	1501014	1501019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_021005	AATA	2	8	1501044	1501051	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_021005	AGTT	2	8	1501052	1501059	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_021005	CCTT	2	8	1501070	1501077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6540	NC_021005	GAAG	2	8	1501099	1501106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_021005	T	6	6	1501117	1501122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_021005	GCT	2	6	1501168	1501173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_021005	AAT	2	6	1501190	1501195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_021005	TAT	2	6	1501203	1501208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_021005	AG	3	6	1501273	1501278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_021005	T	12	12	1501338	1501349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_021005	T	6	6	1501393	1501398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_021005	AAT	2	6	1501432	1501437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_021005	ATA	2	6	1501522	1501527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_021005	AATT	2	8	1501574	1501581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_021005	GTT	2	6	1501598	1501603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_021005	CTA	2	6	1501620	1501625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_021005	ACT	2	6	1501641	1501646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_021005	AGT	2	6	1501652	1501657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6556	NC_021005	A	7	7	1501698	1501704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_021005	TTC	2	6	1501764	1501769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_021005	CT	3	6	1504842	1504847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6559	NC_021005	CTTT	2	8	1504917	1504924	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6560	NC_021005	TAC	2	6	1504925	1504930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6562	NC_021005	ATG	2	6	1505080	1505085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_021005	ATT	2	6	1505350	1505355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_021005	TC	3	6	1505380	1505385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6565	NC_021005	CTA	3	9	1505405	1505413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6568	NC_021005	TAT	2	6	1505485	1505490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_021005	TAG	2	6	1505527	1505532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6571	NC_021005	TA	3	6	1505556	1505561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_021005	AGT	2	6	1505576	1505581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_021005	AAG	2	6	1505663	1505668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_021005	ATG	2	6	1505677	1505682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_021005	AT	3	6	1505867	1505872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_021005	GGCAA	2	10	1505875	1505884	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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6580	NC_021005	A	6	6	1506028	1506033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_021005	ATA	2	6	1506044	1506049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_021005	T	7	7	1506178	1506184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_021005	AAGA	2	8	1507286	1507293	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6587	NC_021005	T	6	6	1507400	1507405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_021005	CTTC	2	8	1507407	1507414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6589	NC_021005	TGA	2	6	1507480	1507485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6593	NC_021005	GAA	2	6	1515808	1515813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6595	NC_021005	TAATA	2	10	1518280	1518289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_021005	AT	3	6	1518384	1518389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_021005	CCT	2	6	1518782	1518787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6598	NC_021005	T	6	6	1518787	1518792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_021005	TTA	2	6	1518826	1518831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6601	NC_021005	CCT	2	6	1518888	1518893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6602	NC_021005	CTT	2	6	1519267	1519272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_021005	TAT	2	6	1519295	1519300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_021005	A	7	7	1519304	1519310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_021005	CCT	2	6	1523922	1523927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6606	NC_021005	TTTTC	2	10	1523933	1523942	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6610	NC_021005	TGT	2	6	1524007	1524012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6612	NC_021005	ATT	2	6	1525130	1525135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_021005	T	6	6	1526018	1526023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_021005	GAACG	2	10	1526068	1526077	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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6618	NC_021005	TTC	2	6	1528769	1528774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_021005	A	6	6	1528790	1528795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6622	NC_021005	CTA	2	6	1528868	1528873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6623	NC_021005	TA	3	6	1528922	1528927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_021005	TAT	2	6	1529024	1529029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_021005	TAT	2	6	1529033	1529038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_021005	CAC	2	6	1529042	1529047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6627	NC_021005	TAA	2	6	1529057	1529062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_021005	CCTAAG	2	12	1529094	1529105	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6630	NC_021005	A	6	6	1529169	1529174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6631	NC_021005	AGA	2	6	1529198	1529203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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