MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 8563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021005	AGT	2	6	1188258	1188263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_021005	T	6	6	1188280	1188285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021005	AAAT	2	8	1188327	1188334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_021005	TAT	2	6	1188340	1188345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021005	TAAC	2	8	1188346	1188353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5006	NC_021005	TTC	2	6	1188355	1188360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_021005	TTTA	2	8	1188393	1188400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_021005	GAAG	2	8	1188420	1188427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_021005	AGCA	2	8	1188429	1188436	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5010	NC_021005	A	7	7	1188445	1188451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_021005	T	7	7	1188473	1188479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_021005	TAT	2	6	1188679	1188684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_021005	TCAA	2	8	1188739	1188746	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5014	NC_021005	C	6	6	1188761	1188766	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5015	NC_021005	TCC	2	6	1188997	1189002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_021005	CT	3	6	1189046	1189051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5017	NC_021005	CAG	2	6	1189053	1189058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_021005	TA	3	6	1189098	1189103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_021005	TA	4	8	1191234	1191241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_021005	ATG	2	6	1191271	1191276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_021005	ATTATC	2	12	1191334	1191345	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5022	NC_021005	TAT	2	6	1191381	1191386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_021005	T	6	6	1191414	1191419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021005	TAC	2	6	1191441	1191446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_021005	CAC	2	6	1191453	1191458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_021005	TATC	2	8	1191474	1191481	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_021005	TTC	2	6	1191490	1191495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_021005	T	6	6	1191509	1191514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_021005	ATC	2	6	1191532	1191537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_021005	TAG	2	6	1191579	1191584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_021005	AT	3	6	1191593	1191598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_021005	ATTA	2	8	1191688	1191695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_021005	GTT	2	6	1191707	1191712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021005	TAA	2	6	1191736	1191741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_021005	ATTT	2	8	1191780	1191787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_021005	ACA	2	6	1191806	1191811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_021005	TGA	2	6	1191835	1191840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_021005	TTA	2	6	1191854	1191859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_021005	TTC	2	6	1191881	1191886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_021005	TC	3	6	1191885	1191890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5041	NC_021005	ATTG	2	8	1191954	1191961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_021005	AAAG	2	8	1192014	1192021	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_021005	TAA	2	6	1192029	1192034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_021005	CATG	2	8	1192074	1192081	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5045	NC_021005	T	6	6	1192093	1192098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_021005	T	7	7	1192201	1192207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_021005	AAT	2	6	1192275	1192280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_021005	ATACC	2	10	1192295	1192304	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5049	NC_021005	ATCT	2	8	1192306	1192313	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5050	NC_021005	TCA	2	6	1192376	1192381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_021005	TAT	2	6	1192408	1192413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_021005	TGA	2	6	1192463	1192468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_021005	CTA	2	6	1192515	1192520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_021005	CAA	2	6	1192557	1192562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_021005	ATT	2	6	1192579	1192584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_021005	AAG	2	6	1192631	1192636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_021005	CATT	2	8	1192685	1192692	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5058	NC_021005	TC	3	6	1192726	1192731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_021005	GAA	2	6	1192733	1192738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_021005	ATT	2	6	1192787	1192792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_021005	T	7	7	1192791	1192797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_021005	TCT	2	6	1192802	1192807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_021005	TA	3	6	1192821	1192826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_021005	CAC	2	6	1192830	1192835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_021005	TAA	2	6	1192863	1192868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_021005	T	6	6	1192885	1192890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_021005	TCTT	2	8	1192892	1192899	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5068	NC_021005	AAC	2	6	1192975	1192980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_021005	CAA	2	6	1192989	1192994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_021005	TCA	2	6	1193000	1193005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_021005	CTT	2	6	1193014	1193019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_021005	TCA	2	6	1193021	1193026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_021005	AC	3	6	1193043	1193048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5074	NC_021005	AT	3	6	1193059	1193064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_021005	AT	3	6	1193096	1193101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_021005	TAA	2	6	1193178	1193183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_021005	TCT	2	6	1193237	1193242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_021005	TAT	2	6	1193316	1193321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021005	CAA	2	6	1193358	1193363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_021005	TCA	2	6	1193393	1193398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5082	NC_021005	ATT	2	6	1193470	1193475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_021005	AAAG	2	8	1193482	1193489	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_021005	AT	3	6	1193550	1193555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_021005	AGAC	2	8	1193564	1193571	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5086	NC_021005	TTA	2	6	1193572	1193577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5089	NC_021005	CTC	2	6	1193840	1193845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5091	NC_021005	CT	3	6	1193891	1193896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_021005	CAG	2	6	1193898	1193903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5095	NC_021005	AAT	2	6	1193941	1193946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_021005	TC	4	8	1193976	1193983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_021005	AGTT	2	8	1193995	1194002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_021005	A	7	7	1196017	1196023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_021005	TTA	2	6	1196057	1196062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_021005	TCC	2	6	1196562	1196567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5101	NC_021005	T	7	7	1196593	1196599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_021005	GT	3	6	1197133	1197138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_021005	ATT	2	6	1197150	1197155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_021005	CTT	2	6	1197218	1197223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_021005	T	7	7	1197290	1197296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_021005	TA	3	6	1197303	1197308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021005	A	7	7	1197323	1197329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_021005	T	7	7	1197351	1197357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_021005	CT	3	6	1198671	1198676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_021005	A	6	6	1198840	1198845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_021005	T	6	6	1198862	1198867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_021005	GAA	2	6	1202399	1202404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_021005	CT	3	6	1202419	1202424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_021005	TA	3	6	1203444	1203449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5117	NC_021005	TCT	2	6	1203605	1203610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_021005	TAT	2	6	1205832	1205837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_021005	A	6	6	1205865	1205870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_021005	CTT	2	6	1205889	1205894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_021005	TCTA	2	8	1206686	1206693	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5122	NC_021005	CTC	2	6	1206729	1206734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_021005	CAGA	2	8	1206793	1206800	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5124	NC_021005	T	7	7	1207898	1207904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_021005	TAG	2	6	1207915	1207920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_021005	TATCG	2	10	1212309	1212318	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5127	NC_021005	A	6	6	1212364	1212369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_021005	AAC	2	6	1212444	1212449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_021005	TAGGTA	2	12	1212468	1212479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_021005	AGC	2	6	1212524	1212529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_021005	TAT	2	6	1212571	1212576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_021005	TTC	2	6	1216878	1216883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_021005	A	6	6	1222978	1222983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_021005	T	6	6	1222998	1223003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_021005	CTT	2	6	1223007	1223012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5136	NC_021005	A	6	6	1223015	1223020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_021005	A	6	6	1223074	1223079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_021005	GGA	2	6	1223094	1223099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5143	NC_021005	GAA	2	6	1223237	1223242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_021005	GAATT	2	10	1223597	1223606	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5148	NC_021005	TAA	2	6	1223667	1223672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5158	NC_021005	A	8	8	1224179	1224186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5166	NC_021005	AGGA	2	8	1224448	1224455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5167	NC_021005	CTT	2	6	1224457	1224462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5233	NC_021005	CCT	2	6	1245469	1245474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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