MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020568	ATGA	2	8	722246	722253	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_020568	TTA	2	6	722278	722283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_020568	A	6	6	722363	722368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_020568	TAA	2	6	722379	722384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_020568	GAT	2	6	722456	722461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_020568	A	6	6	722462	722467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_020568	A	6	6	722501	722506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_020568	TTG	2	6	722521	722526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_020568	GTTT	2	8	722541	722548	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_020568	TTA	2	6	722556	722561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_020568	CAA	2	6	722569	722574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_020568	TGAA	2	8	722701	722708	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_020568	AAAT	2	8	722750	722757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_020568	AGAA	2	8	722837	722844	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_020568	ATA	2	6	722931	722936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_020568	ATA	2	6	722942	722947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_020568	AAT	2	6	722992	722997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_020568	ATG	2	6	723029	723034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_020568	GAA	2	6	723094	723099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_020568	AACG	2	8	723136	723143	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4021	NC_020568	AGA	2	6	723202	723207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_020568	GCT	2	6	723350	723355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_020568	TTGG	2	8	723356	723363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_020568	AGA	2	6	723366	723371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_020568	GTG	2	6	723423	723428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_020568	ATGA	2	8	723507	723514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_020568	TAA	2	6	723516	723521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_020568	CAA	2	6	723522	723527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_020568	TTGA	2	8	723600	723607	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_020568	ATG	2	6	727415	727420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_020568	AT	3	6	727470	727475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_020568	TTTTTA	2	12	727567	727578	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_020568	ATGA	2	8	727584	727591	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_020568	T	6	6	727619	727624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_020568	TAAA	2	8	727696	727703	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_020568	TAT	2	6	728956	728961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_020568	T	7	7	728983	728989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_020568	AT	3	6	730475	730480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_020568	TGGT	2	8	730511	730518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_020568	T	7	7	730521	730527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_020568	T	6	6	730592	730597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_020568	TTG	2	6	730628	730633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_020568	GA	3	6	730677	730682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_020568	AAAT	2	8	731578	731585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_020568	TAAA	2	8	731639	731646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_020568	A	7	7	732647	732653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_020568	CTT	2	6	732674	732679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_020568	ATTTT	2	10	732692	732701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_020568	ATAA	2	8	732702	732709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_020568	ATATCA	2	12	734318	734329	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4051	NC_020568	CTT	2	6	734349	734354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_020568	GTT	2	6	734369	734374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_020568	TTCT	2	8	734916	734923	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_020568	TG	3	6	734930	734935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_020568	TA	3	6	734941	734946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_020568	AAAC	2	8	735026	735033	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4057	NC_020568	A	7	7	735044	735050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_020568	TA	4	8	735093	735100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_020568	A	6	6	735104	735109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_020568	G	6	6	735134	735139	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_020568	TGT	2	6	735216	735221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_020568	ATT	2	6	735247	735252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_020568	GCC	2	6	735263	735268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4064	NC_020568	T	6	6	735284	735289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_020568	TCA	2	6	735306	735311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4067	NC_020568	T	6	6	735405	735410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_020568	TGA	2	6	735440	735445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_020568	TAGT	2	8	735450	735457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_020568	GTTTT	2	10	735538	735547	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4074	NC_020568	A	6	6	735669	735674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_020568	CTC	2	6	735694	735699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4099	NC_020568	TAA	2	6	738487	738492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4101	NC_020568	A	7	7	738536	738542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_020568	GAAA	2	8	738566	738573	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_020568	AT	4	8	738589	738596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_020568	T	6	6	738637	738642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_020568	GAATA	2	10	738689	738698	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_020568	AT	3	6	738703	738708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4109	NC_020568	CTA	2	6	739479	739484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4111	NC_020568	ATG	2	6	741170	741175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4113	NC_020568	TGT	2	6	741232	741237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_020568	AT	3	6	741294	741299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_020568	GTT	2	6	741300	741305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_020568	TAC	2	6	741323	741328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4119	NC_020568	AAAGT	2	10	741469	741478	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_020568	ATG	2	6	742268	742273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4122	NC_020568	ATA	2	6	743265	743270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_020568	GT	3	6	743334	743339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_020568	TATT	2	8	743371	743378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_020568	TTA	3	9	743392	743400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_020568	ATA	2	6	743438	743443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_020568	TAAA	2	8	743445	743452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_020568	TTA	2	6	743591	743596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4131	NC_020568	TAT	2	6	745676	745681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_020568	TAT	2	6	745713	745718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_020568	TCA	2	6	745736	745741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_020568	TTTA	2	8	745756	745763	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_020568	CAA	2	6	745773	745778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_020568	AGA	2	6	745874	745879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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