MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_020568	GGT	2	6	2735246	2735251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_020568	TGTA	2	8	2735254	2735261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_020568	A	6	6	2735272	2735277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_020568	AT	5	10	2735857	2735866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_020568	ATC	2	6	2735883	2735888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_020568	AGGT	2	8	2735971	2735978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_020568	ATG	2	6	2737109	2737114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_020568	TTAA	2	8	2738154	2738161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_020568	T	6	6	2738216	2738221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_020568	CATA	2	8	2738227	2738234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16011	NC_020568	TAAAT	2	10	2738269	2738278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_020568	CAAA	2	8	2738953	2738960	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16013	NC_020568	GAT	2	6	2739006	2739011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_020568	ATG	2	6	2739032	2739037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_020568	ATC	2	6	2739851	2739856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16016	NC_020568	GCC	2	6	2739943	2739948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16017	NC_020568	T	7	7	2739958	2739964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_020568	T	6	6	2739985	2739990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_020568	TAC	2	6	2740017	2740022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16020	NC_020568	ATCTG	2	10	2740136	2740145	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16021	NC_020568	CTA	2	6	2740165	2740170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16022	NC_020568	ATA	2	6	2740177	2740182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_020568	GTT	2	6	2740231	2740236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_020568	AAC	2	6	2740258	2740263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16025	NC_020568	TTA	2	6	2740795	2740800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_020568	AAC	2	6	2740807	2740812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16027	NC_020568	T	6	6	2740824	2740829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_020568	T	6	6	2740848	2740853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_020568	TAA	2	6	2740859	2740864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_020568	TTC	2	6	2740881	2740886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_020568	AAT	2	6	2740901	2740906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_020568	TTAAT	2	10	2740923	2740932	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_020568	ATT	2	6	2740943	2740948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_020568	AGAA	2	8	2741004	2741011	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_020568	A	7	7	2742681	2742687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_020568	ATTT	2	8	2742732	2742739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_020568	CA	3	6	2742782	2742787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16038	NC_020568	CCT	2	6	2743772	2743777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16039	NC_020568	TAA	2	6	2743838	2743843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_020568	ACCA	2	8	2743890	2743897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16041	NC_020568	AAT	2	6	2743919	2743924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_020568	ACA	2	6	2743964	2743969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16043	NC_020568	GGAT	2	8	2743974	2743981	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_020568	AT	4	8	2744601	2744608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_020568	TAA	2	6	2744611	2744616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_020568	AAT	2	6	2744621	2744626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_020568	ATA	2	6	2744632	2744637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_020568	TTG	2	6	2745768	2745773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_020568	CTT	2	6	2745795	2745800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16050	NC_020568	AGT	2	6	2745819	2745824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_020568	AGG	2	6	2745966	2745971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_020568	CTTA	2	8	2746804	2746811	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16053	NC_020568	GTAG	2	8	2746814	2746821	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_020568	T	6	6	2746828	2746833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_020568	ACA	2	6	2746847	2746852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16056	NC_020568	CTT	2	6	2746885	2746890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16057	NC_020568	CAAT	2	8	2747425	2747432	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16058	NC_020568	A	6	6	2747466	2747471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_020568	TAT	2	6	2747474	2747479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_020568	AAT	2	6	2747482	2747487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_020568	CAT	2	6	2747516	2747521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16062	NC_020568	CTCA	2	8	2747573	2747580	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16063	NC_020568	CTA	2	6	2747586	2747591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16064	NC_020568	TTCA	2	8	2747620	2747627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16065	NC_020568	CTA	2	6	2747652	2747657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16066	NC_020568	ATT	2	6	2747666	2747671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_020568	GATTTT	2	12	2750362	2750373	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_020568	GA	3	6	2750412	2750417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16069	NC_020568	ACA	2	6	2750536	2750541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16070	NC_020568	TTA	2	6	2750566	2750571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_020568	TTA	2	6	2750580	2750585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16077	NC_020568	T	6	6	2750780	2750785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16078	NC_020568	ATTT	2	8	2750841	2750848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16081	NC_020568	T	6	6	2750949	2750954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_020568	AGA	2	6	2751130	2751135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16084	NC_020568	TTG	2	6	2751272	2751277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16085	NC_020568	T	7	7	2751281	2751287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16086	NC_020568	ATA	2	6	2751300	2751305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16090	NC_020568	TTA	2	6	2752082	2752087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_020568	ATG	2	6	2752088	2752093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16092	NC_020568	T	6	6	2752202	2752207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16093	NC_020568	ATAC	2	8	2752234	2752241	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16094	NC_020568	TGA	2	6	2752247	2752252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16096	NC_020568	CAT	2	6	2752308	2752313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16098	NC_020568	TAA	2	6	2752500	2752505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_020568	C	6	6	2752516	2752521	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16100	NC_020568	A	6	6	2752524	2752529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16101	NC_020568	ATG	2	6	2752549	2752554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16102	NC_020568	TAA	2	6	2752579	2752584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_020568	CAA	2	6	2752661	2752666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16104	NC_020568	AG	3	6	2752713	2752718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16105	NC_020568	GAT	2	6	2752809	2752814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_020568	ATA	2	6	2752829	2752834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_020568	AAGA	2	8	2752840	2752847	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_020568	TAG	2	6	2752857	2752862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_020568	CCT	2	6	2752871	2752876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16110	NC_020568	ACC	2	6	2752882	2752887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16111	NC_020568	AAT	2	6	2752900	2752905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_020568	ACC	2	6	2752927	2752932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16113	NC_020568	GAA	2	6	2752944	2752949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_020568	TAAT	2	8	2752990	2752997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_020568	CA	3	6	2753018	2753023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16116	NC_020568	ATTT	2	8	2753175	2753182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_020568	CGT	2	6	2753183	2753188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16119	NC_020568	ACT	2	6	2753253	2753258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16120	NC_020568	ATATAA	2	12	2753314	2753325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16121	NC_020568	A	7	7	2753348	2753354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_020568	TCA	2	6	2753397	2753402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16123	NC_020568	CCT	2	6	2756909	2756914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16124	NC_020568	CTT	2	6	2756934	2756939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16125	NC_020568	CCT	2	6	2758358	2758363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16126	NC_020568	TTA	2	6	2758393	2758398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16127	NC_020568	TTCC	2	8	2758483	2758490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16128	NC_020568	CTTA	2	8	2758502	2758509	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16129	NC_020568	TTA	2	6	2758516	2758521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16130	NC_020568	GTC	2	6	2758573	2758578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16131	NC_020568	GCTG	2	8	2758588	2758595	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16132	NC_020568	AAT	2	6	2758608	2758613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16133	NC_020568	AT	3	6	2758625	2758630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16134	NC_020568	T	6	6	2758701	2758706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16135	NC_020568	TAT	2	6	2758745	2758750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16136	NC_020568	ACA	2	6	2758762	2758767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16137	NC_020568	T	6	6	2758794	2758799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16138	NC_020568	AT	3	6	2758800	2758805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16139	NC_020568	TTAT	2	8	2758864	2758871	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16140	NC_020568	TATT	2	8	2758926	2758933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16141	NC_020568	A	8	8	2758947	2758954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16142	NC_020568	TGA	2	6	2758961	2758966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16143	NC_020568	ACG	3	9	2759004	2759012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16144	NC_020568	GC	3	6	2759013	2759018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16145	NC_020568	T	6	6	2759035	2759040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16146	NC_020568	ACT	2	6	2759254	2759259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16147	NC_020568	TAC	2	6	2759301	2759306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16148	NC_020568	T	7	7	2759314	2759320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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