MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_020568	CAAA	2	8	2623343	2623350	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15502	NC_020568	ATT	4	12	2623403	2623414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15503	NC_020568	AATC	2	8	2623468	2623475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15504	NC_020568	TAC	2	6	2623480	2623485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15505	NC_020568	TCA	2	6	2623537	2623542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15506	NC_020568	GTA	2	6	2624389	2624394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_020568	TAT	2	6	2625243	2625248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_020568	GAAAG	2	10	2625276	2625285	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_020568	AAG	3	9	2625283	2625291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_020568	AT	3	6	2626157	2626162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_020568	ACC	2	6	2626194	2626199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15512	NC_020568	ACT	2	6	2627005	2627010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15513	NC_020568	ATA	2	6	2627071	2627076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_020568	ATT	3	9	2627086	2627094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_020568	TGCT	2	8	2627121	2627128	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15516	NC_020568	A	7	7	2627129	2627135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_020568	AT	3	6	2627190	2627195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_020568	TAAT	2	8	2627199	2627206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_020568	CCTAA	2	10	2628190	2628199	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15520	NC_020568	ATTT	2	8	2628204	2628211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_020568	ATTTT	2	10	2628261	2628270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_020568	AATA	2	8	2628344	2628351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_020568	T	7	7	2628461	2628467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_020568	TA	3	6	2628507	2628512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_020568	CCT	2	6	2628514	2628519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15526	NC_020568	TCA	2	6	2628536	2628541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15527	NC_020568	CAT	2	6	2628551	2628556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15528	NC_020568	A	6	6	2628707	2628712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_020568	ATT	2	6	2628791	2628796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15530	NC_020568	A	6	6	2628818	2628823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15531	NC_020568	GGA	2	6	2628853	2628858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15532	NC_020568	A	7	7	2630320	2630326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15533	NC_020568	T	6	6	2630365	2630370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15534	NC_020568	GCAA	2	8	2631764	2631771	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15535	NC_020568	CT	3	6	2631778	2631783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15536	NC_020568	TAA	2	6	2631858	2631863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15537	NC_020568	AT	3	6	2631879	2631884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15538	NC_020568	TGC	2	6	2632018	2632023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15539	NC_020568	TCAT	2	8	2632034	2632041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15540	NC_020568	TGT	2	6	2632059	2632064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_020568	TAA	2	6	2632071	2632076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_020568	CAAT	2	8	2632078	2632085	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15543	NC_020568	TAT	2	6	2632101	2632106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_020568	AT	3	6	2632144	2632149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15545	NC_020568	ATA	2	6	2632157	2632162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15546	NC_020568	ATTT	2	8	2632187	2632194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15547	NC_020568	CTAT	2	8	2632234	2632241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15548	NC_020568	TTAT	2	8	2632262	2632269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15549	NC_020568	TATT	2	8	2632290	2632297	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_020568	ATT	2	6	2632346	2632351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_020568	AATAA	2	10	2632396	2632405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15552	NC_020568	TTAA	2	8	2632411	2632418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_020568	ATT	2	6	2632426	2632431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15554	NC_020568	T	6	6	2633436	2633441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_020568	ACT	2	6	2633449	2633454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15556	NC_020568	T	6	6	2633499	2633504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_020568	GTAT	2	8	2633524	2633531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15558	NC_020568	A	7	7	2633542	2633548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_020568	ATC	2	6	2635141	2635146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15560	NC_020568	TAGT	2	8	2635241	2635248	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_020568	AGCA	2	8	2635268	2635275	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15562	NC_020568	GTAAAT	2	12	2635279	2635290	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15563	NC_020568	ATT	2	6	2635295	2635300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15564	NC_020568	AT	3	6	2635314	2635319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15565	NC_020568	AGA	2	6	2635336	2635341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15566	NC_020568	ATCAA	2	10	2635347	2635356	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15567	NC_020568	ATT	2	6	2635362	2635367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15568	NC_020568	ACA	2	6	2635370	2635375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15569	NC_020568	ATCA	2	8	2635458	2635465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15570	NC_020568	ATT	2	6	2635527	2635532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_020568	TTA	2	6	2635617	2635622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_020568	GAC	2	6	2635714	2635719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15574	NC_020568	ATC	2	6	2635756	2635761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15575	NC_020568	TGA	2	6	2637425	2637430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15576	NC_020568	TA	4	8	2637454	2637461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15577	NC_020568	ATTC	2	8	2638086	2638093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15578	NC_020568	TATT	2	8	2638097	2638104	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_020568	CTT	2	6	2638124	2638129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15580	NC_020568	ATT	2	6	2638222	2638227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15581	NC_020568	TTTTA	2	10	2638279	2638288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15582	NC_020568	TGA	2	6	2638384	2638389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15583	NC_020568	GAAT	2	8	2638431	2638438	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15584	NC_020568	TCT	2	6	2638441	2638446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15586	NC_020568	TA	3	6	2638500	2638505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15587	NC_020568	TC	3	6	2638530	2638535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15588	NC_020568	TA	3	6	2638544	2638549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15589	NC_020568	ATC	2	6	2638651	2638656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15591	NC_020568	ACA	2	6	2638710	2638715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15593	NC_020568	CAATA	2	10	2638758	2638767	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15594	NC_020568	CTA	2	6	2638785	2638790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15595	NC_020568	TA	3	6	2638789	2638794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15596	NC_020568	AAT	2	6	2640653	2640658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15597	NC_020568	ATCA	2	8	2640689	2640696	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15598	NC_020568	ACAAA	2	10	2640713	2640722	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15599	NC_020568	CAA	2	6	2642260	2642265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15600	NC_020568	TTTA	2	8	2642288	2642295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15601	NC_020568	AAC	2	6	2642350	2642355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15602	NC_020568	TTTA	2	8	2642388	2642395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15603	NC_020568	T	7	7	2642437	2642443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15604	NC_020568	TATT	2	8	2642468	2642475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_020568	ATG	2	6	2643096	2643101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15606	NC_020568	ATG	2	6	2643109	2643114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15607	NC_020568	ACAAT	2	10	2643118	2643127	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15608	NC_020568	AATA	2	8	2643160	2643167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_020568	CAAT	2	8	2643194	2643201	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15610	NC_020568	TA	3	6	2643202	2643207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_020568	CAT	2	6	2643231	2643236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15612	NC_020568	T	6	6	2644859	2644864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15613	NC_020568	ATT	2	6	2644882	2644887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_020568	TAA	2	6	2644924	2644929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15615	NC_020568	TAA	3	9	2644966	2644974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15616	NC_020568	ATT	2	6	2645005	2645010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15617	NC_020568	TA	3	6	2645018	2645023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15618	NC_020568	TAA	2	6	2645034	2645039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15619	NC_020568	ATTT	2	8	2645146	2645153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15621	NC_020568	T	6	6	2645204	2645209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15622	NC_020568	T	6	6	2645218	2645223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15623	NC_020568	A	6	6	2645224	2645229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15624	NC_020568	AT	3	6	2645286	2645291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15625	NC_020568	TTA	2	6	2645310	2645315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15626	NC_020568	ACCTA	2	10	2645330	2645339	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15627	NC_020568	AAG	2	6	2645342	2645347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15628	NC_020568	AT	3	6	2645700	2645705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15629	NC_020568	ATC	2	6	2645719	2645724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15630	NC_020568	TCA	2	6	2645744	2645749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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