MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_020568	T	6	6	2539667	2539672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_020568	TTTTC	2	10	2539741	2539750	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15003	NC_020568	TTA	2	6	2540622	2540627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_020568	T	6	6	2540634	2540639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_020568	T	7	7	2540678	2540684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_020568	TA	3	6	2540704	2540709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_020568	AC	3	6	2541529	2541534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15008	NC_020568	AT	3	6	2541564	2541569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_020568	TTTAT	2	10	2542750	2542759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_020568	ATT	2	6	2542801	2542806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_020568	AT	3	6	2542823	2542828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_020568	TGA	2	6	2542836	2542841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_020568	TGA	2	6	2542897	2542902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_020568	AT	3	6	2543823	2543828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_020568	AT	3	6	2543900	2543905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_020568	A	6	6	2543965	2543970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_020568	TAA	2	6	2543998	2544003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_020568	A	6	6	2545409	2545414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_020568	TAT	2	6	2545441	2545446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_020568	CCA	2	6	2545462	2545467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15021	NC_020568	CGT	2	6	2545474	2545479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15022	NC_020568	CAAA	2	8	2545496	2545503	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15023	NC_020568	A	7	7	2545501	2545507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_020568	AT	3	6	2545539	2545544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_020568	ATTA	2	8	2546244	2546251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_020568	TAT	2	6	2546279	2546284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_020568	AT	3	6	2546296	2546301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_020568	TAA	2	6	2546354	2546359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_020568	ATT	2	6	2546373	2546378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_020568	ATA	2	6	2546886	2546891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_020568	TAACA	2	10	2546919	2546928	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15032	NC_020568	T	6	6	2546978	2546983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_020568	TAG	2	6	2547045	2547050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_020568	ATA	2	6	2547091	2547096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_020568	ATG	2	6	2547147	2547152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15037	NC_020568	ATC	2	6	2547185	2547190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15039	NC_020568	ATCT	2	8	2547294	2547301	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15040	NC_020568	CAGA	2	8	2547315	2547322	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15041	NC_020568	CTT	2	6	2547325	2547330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15042	NC_020568	T	6	6	2547329	2547334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_020568	CT	4	8	2550009	2550016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15044	NC_020568	TTTAT	2	10	2550020	2550029	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_020568	ATCAA	2	10	2550086	2550095	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15046	NC_020568	ACT	2	6	2550154	2550159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15048	NC_020568	TG	3	6	2550213	2550218	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_020568	T	6	6	2550223	2550228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_020568	T	6	6	2550235	2550240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_020568	TATT	2	8	2550303	2550310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15053	NC_020568	TTA	2	6	2550362	2550367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_020568	AT	3	6	2550371	2550376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_020568	ATT	2	6	2550403	2550408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_020568	ATG	2	6	2550427	2550432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_020568	T	7	7	2550457	2550463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_020568	TCTA	2	8	2550580	2550587	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15059	NC_020568	CTT	2	6	2550614	2550619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15060	NC_020568	ATT	2	6	2550628	2550633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_020568	TA	3	6	2550635	2550640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15062	NC_020568	ATG	2	6	2550656	2550661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15064	NC_020568	CATT	2	8	2550770	2550777	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15065	NC_020568	TATC	2	8	2550795	2550802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15066	NC_020568	GAT	2	6	2550823	2550828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15067	NC_020568	T	7	7	2550828	2550834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15068	NC_020568	AAC	2	6	2551907	2551912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15069	NC_020568	T	6	6	2551940	2551945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15085	NC_020568	CTTG	2	8	2553580	2553587	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15086	NC_020568	TTGA	2	8	2553682	2553689	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15091	NC_020568	ATTT	2	8	2553892	2553899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15099	NC_020568	TAT	2	6	2556429	2556434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_020568	CAA	2	6	2556456	2556461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15101	NC_020568	ATC	2	6	2556477	2556482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15102	NC_020568	ATAA	2	8	2556504	2556511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_020568	TTG	2	6	2556532	2556537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_020568	TTCAA	2	10	2556562	2556571	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15105	NC_020568	ATGTTT	2	12	2559092	2559103	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_020568	T	6	6	2559112	2559117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_020568	TAA	2	6	2559160	2559165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_020568	TA	3	6	2559182	2559187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_020568	ATA	2	6	2559216	2559221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15111	NC_020568	TAA	2	6	2559260	2559265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_020568	TCT	2	6	2559279	2559284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15113	NC_020568	TAAA	2	8	2559320	2559327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_020568	CAA	2	6	2559340	2559345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15115	NC_020568	ATG	2	6	2559408	2559413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15116	NC_020568	GTA	3	9	2559424	2559432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15118	NC_020568	TAT	2	6	2559503	2559508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_020568	T	7	7	2559539	2559545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_020568	CT	3	6	2559577	2559582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15121	NC_020568	A	7	7	2559603	2559609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15122	NC_020568	TCA	2	6	2559613	2559618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15125	NC_020568	TTA	2	6	2559662	2559667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15127	NC_020568	TAT	2	6	2560677	2560682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15128	NC_020568	GAGGT	2	10	2560707	2560716	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15129	NC_020568	TGA	2	6	2560753	2560758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15130	NC_020568	CAT	2	6	2560957	2560962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15131	NC_020568	TTTC	2	8	2561036	2561043	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15132	NC_020568	CTTTT	2	10	2561062	2561071	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15133	NC_020568	AATT	2	8	2561140	2561147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15134	NC_020568	A	6	6	2561177	2561182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15135	NC_020568	TTA	2	6	2561190	2561195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15136	NC_020568	TTG	2	6	2561239	2561244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15137	NC_020568	TTGC	2	8	2561246	2561253	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15138	NC_020568	A	7	7	2561264	2561270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15139	NC_020568	A	7	7	2561301	2561307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15140	NC_020568	TTA	2	6	2561353	2561358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15146	NC_020568	GTA	2	6	2561657	2561662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15151	NC_020568	GACT	2	8	2561854	2561861	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15152	NC_020568	T	6	6	2563200	2563205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15161	NC_020568	ATAA	2	8	2565355	2565362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15173	NC_020568	T	6	6	2565650	2565655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15256	NC_020568	AC	3	6	2582579	2582584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15257	NC_020568	TGAA	2	8	2582592	2582599	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15258	NC_020568	TAGG	2	8	2582613	2582620	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15500	NC_020568	TGC	2	6	2623331	2623336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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