MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_020568	ATTT	2	8	2381876	2381883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_020568	TA	3	6	2382545	2382550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_020568	CCT	2	6	2385033	2385038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14004	NC_020568	TAT	2	6	2385103	2385108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_020568	TA	3	6	2385114	2385119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_020568	CATT	2	8	2385145	2385152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14007	NC_020568	CTATA	2	10	2385160	2385169	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14008	NC_020568	ATTA	2	8	2385185	2385192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_020568	TAG	2	6	2385618	2385623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_020568	ATCT	2	8	2385669	2385676	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14011	NC_020568	ATG	2	6	2385718	2385723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_020568	AGA	2	6	2385726	2385731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_020568	ATT	2	6	2385780	2385785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_020568	TTG	2	6	2385832	2385837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_020568	TAA	2	6	2385854	2385859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_020568	TAA	2	6	2385894	2385899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_020568	GAT	2	6	2385902	2385907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_020568	TAAT	2	8	2385921	2385928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_020568	AT	3	6	2385931	2385936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_020568	TGA	2	6	2385966	2385971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_020568	TGA	2	6	2386034	2386039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_020568	ATG	2	6	2386048	2386053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_020568	TAATA	2	10	2386055	2386064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_020568	TGT	2	6	2386114	2386119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_020568	GTT	2	6	2386144	2386149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_020568	TTC	2	6	2386209	2386214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14027	NC_020568	GCT	2	6	2386215	2386220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14028	NC_020568	ATG	2	6	2386267	2386272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_020568	TG	3	6	2386296	2386301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_020568	TTG	2	6	2386309	2386314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_020568	ATT	2	6	2386365	2386370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_020568	T	6	6	2386474	2386479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_020568	TTG	3	9	2386514	2386522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_020568	AAT	2	6	2386528	2386533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_020568	CTA	2	6	2386559	2386564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_020568	AAG	2	6	2386579	2386584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_020568	TGA	2	6	2386614	2386619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_020568	AAT	2	6	2386642	2386647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_020568	T	6	6	2386682	2386687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_020568	T	7	7	2386717	2386723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_020568	AGTT	2	8	2386757	2386764	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_020568	T	6	6	2386783	2386788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_020568	ATTA	2	8	2386813	2386820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_020568	TAATT	2	10	2386830	2386839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_020568	AT	4	8	2387052	2387059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_020568	GA	4	8	2387067	2387074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_020568	CAT	2	6	2387099	2387104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14048	NC_020568	TAA	2	6	2387134	2387139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_020568	TAT	2	6	2387140	2387145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_020568	TAA	2	6	2387159	2387164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_020568	GAT	2	6	2389268	2389273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_020568	TAT	2	6	2389340	2389345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_020568	ATA	2	6	2389355	2389360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_020568	TAG	2	6	2389371	2389376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_020568	AT	3	6	2389377	2389382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_020568	ATG	2	6	2389394	2389399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_020568	TA	3	6	2389409	2389414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_020568	CAG	2	6	2389463	2389468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14059	NC_020568	AGT	2	6	2389536	2389541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_020568	AGA	2	6	2389605	2389610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_020568	TGA	2	6	2389655	2389660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_020568	TA	4	8	2389709	2389716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_020568	AC	3	6	2389829	2389834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14064	NC_020568	GT	3	6	2389860	2389865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_020568	AATT	2	8	2389873	2389880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_020568	TGA	2	6	2389956	2389961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_020568	GAAAAA	2	12	2389967	2389978	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_020568	CAT	2	6	2390009	2390014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14069	NC_020568	TGTA	2	8	2390021	2390028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_020568	ATG	3	9	2390043	2390051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_020568	GAAA	2	8	2390059	2390066	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_020568	ATAC	2	8	2390068	2390075	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14073	NC_020568	ATA	2	6	2390092	2390097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_020568	CTA	2	6	2390098	2390103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14076	NC_020568	A	7	7	2390140	2390146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_020568	TTCAGA	2	12	2390159	2390170	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14078	NC_020568	GTTAAA	2	12	2390172	2390183	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_020568	A	6	6	2390181	2390186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_020568	GTTAAA	2	12	2390232	2390243	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_020568	A	6	6	2390241	2390246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_020568	ATG	2	6	2390254	2390259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_020568	ATG	2	6	2390277	2390282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_020568	AGA	2	6	2390346	2390351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_020568	AGC	2	6	2390359	2390364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14086	NC_020568	CTG	2	6	2390397	2390402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14088	NC_020568	AAC	2	6	2390472	2390477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14089	NC_020568	GCAT	2	8	2390515	2390522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14090	NC_020568	AAC	2	6	2390533	2390538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14091	NC_020568	GCAT	2	8	2390576	2390583	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14092	NC_020568	AAC	2	6	2390594	2390599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14093	NC_020568	A	6	6	2391978	2391983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_020568	AAT	2	6	2392049	2392054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_020568	TTGA	2	8	2392119	2392126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_020568	CAA	2	6	2392181	2392186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14097	NC_020568	TTA	2	6	2392195	2392200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_020568	AGA	2	6	2392262	2392267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_020568	T	6	6	2392272	2392277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_020568	T	6	6	2392292	2392297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_020568	CAA	2	6	2392403	2392408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14102	NC_020568	AAAT	2	8	2392415	2392422	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_020568	T	8	8	2392447	2392454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_020568	CTT	2	6	2392455	2392460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14105	NC_020568	ATTT	2	8	2392507	2392514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_020568	T	7	7	2392544	2392550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_020568	ATT	2	6	2392560	2392565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_020568	TACA	2	8	2392579	2392586	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14109	NC_020568	A	6	6	2392597	2392602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_020568	TAA	2	6	2392605	2392610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_020568	ATTTT	2	10	2392614	2392623	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_020568	CTAT	2	8	2392625	2392632	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14113	NC_020568	ACT	2	6	2392644	2392649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14114	NC_020568	GAT	2	6	2392663	2392668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_020568	T	7	7	2392678	2392684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_020568	A	6	6	2392691	2392696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_020568	AT	3	6	2392739	2392744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_020568	ATT	2	6	2392750	2392755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14119	NC_020568	AAT	2	6	2392785	2392790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14120	NC_020568	ATA	2	6	2392827	2392832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_020568	T	6	6	2393440	2393445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_020568	T	6	6	2393466	2393471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_020568	TAC	2	6	2393474	2393479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14124	NC_020568	TGA	2	6	2393520	2393525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_020568	TCAA	2	8	2393535	2393542	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14126	NC_020568	T	6	6	2393558	2393563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14127	NC_020568	AT	4	8	2393643	2393650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14128	NC_020568	TAAA	2	8	2393694	2393701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14129	NC_020568	AAT	3	9	2393723	2393731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14130	NC_020568	CTA	2	6	2393748	2393753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14131	NC_020568	AAC	2	6	2393775	2393780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14132	NC_020568	TTA	2	6	2393876	2393881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14133	NC_020568	ACT	2	6	2393918	2393923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14134	NC_020568	TCA	2	6	2393924	2393929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14135	NC_020568	ACT	2	6	2393970	2393975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14136	NC_020568	AATG	2	8	2394035	2394042	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14138	NC_020568	TA	3	6	2395281	2395286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14139	NC_020568	AT	4	8	2395359	2395366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14140	NC_020568	TAT	2	6	2395369	2395374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14252	NC_020568	ATA	2	6	2417283	2417288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14255	NC_020568	TAA	3	9	2417505	2417513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14256	NC_020568	CTA	2	6	2417549	2417554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14257	NC_020568	AACT	2	8	2417564	2417571	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14258	NC_020568	TAAT	2	8	2417579	2417586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14259	NC_020568	ACT	2	6	2417618	2417623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14260	NC_020568	AT	3	6	2417682	2417687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14261	NC_020568	ATAAA	2	10	2417722	2417731	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14262	NC_020568	A	7	7	2417729	2417735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14263	NC_020568	ATT	2	6	2417740	2417745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14270	NC_020568	AT	3	6	2421350	2421355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14271	NC_020568	CTTATT	2	12	2421359	2421370	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14272	NC_020568	TA	3	6	2421446	2421451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14273	NC_020568	A	6	6	2422930	2422935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14275	NC_020568	A	6	6	2422978	2422983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14292	NC_020568	TAA	2	6	2424298	2424303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14293	NC_020568	CCT	2	6	2424309	2424314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14295	NC_020568	ACC	2	6	2425225	2425230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14388	NC_020568	CATC	2	8	2441253	2441260	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14389	NC_020568	CCT	2	6	2441266	2441271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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