MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_020568	GA	3	6	2302314	2302319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_020568	AGG	2	6	2302382	2302387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_020568	CAA	2	6	2303226	2303231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13504	NC_020568	TTG	2	6	2303245	2303250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_020568	T	6	6	2303253	2303258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_020568	A	7	7	2303269	2303275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_020568	TAA	2	6	2303329	2303334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_020568	ACA	2	6	2303342	2303347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13509	NC_020568	AC	3	6	2303359	2303364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13510	NC_020568	AATT	2	8	2303448	2303455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_020568	TTACA	2	10	2303483	2303492	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13512	NC_020568	TA	4	8	2303615	2303622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_020568	TGA	2	6	2305057	2305062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_020568	TTC	2	6	2305073	2305078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13515	NC_020568	CAT	2	6	2305125	2305130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13516	NC_020568	AAC	2	6	2306215	2306220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13517	NC_020568	TTAAAA	2	12	2306238	2306249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13518	NC_020568	ATG	2	6	2306277	2306282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_020568	CAT	2	6	2306296	2306301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13520	NC_020568	TA	4	8	2306315	2306322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_020568	CCA	2	6	2306354	2306359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13522	NC_020568	ATT	2	6	2306360	2306365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_020568	TAA	2	6	2306374	2306379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_020568	TAA	2	6	2306385	2306390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_020568	ATA	2	6	2306429	2306434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_020568	ACG	2	6	2306477	2306482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13527	NC_020568	ATC	2	6	2306489	2306494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13529	NC_020568	TATT	2	8	2306542	2306549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_020568	TAT	2	6	2306565	2306570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_020568	ATA	2	6	2306581	2306586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13532	NC_020568	A	6	6	2306596	2306601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_020568	A	6	6	2306631	2306636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_020568	TAT	2	6	2306661	2306666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_020568	TCATTA	2	12	2306732	2306743	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13536	NC_020568	TCA	2	6	2306750	2306755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13537	NC_020568	ATT	2	6	2306815	2306820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_020568	GT	3	6	2306823	2306828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_020568	ATTT	2	8	2306874	2306881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_020568	AAAT	2	8	2306893	2306900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_020568	ATTA	2	8	2306908	2306915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_020568	TTA	2	6	2306948	2306953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_020568	T	7	7	2306969	2306975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_020568	AAG	2	6	2307006	2307011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_020568	TCA	2	6	2307038	2307043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13546	NC_020568	A	7	7	2307086	2307092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_020568	GGA	2	6	2307106	2307111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13549	NC_020568	TCA	2	6	2307671	2307676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13550	NC_020568	A	6	6	2307676	2307681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_020568	T	7	7	2307711	2307717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_020568	TTAT	2	8	2307740	2307747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_020568	T	6	6	2307773	2307778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_020568	TAATT	2	10	2307810	2307819	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_020568	CAT	2	6	2307899	2307904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13556	NC_020568	CAT	2	6	2307917	2307922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13557	NC_020568	TCT	2	6	2307945	2307950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13558	NC_020568	TAT	2	6	2308945	2308950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_020568	TTG	2	6	2309018	2309023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_020568	TAT	2	6	2310252	2310257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_020568	TACAT	2	10	2310269	2310278	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13562	NC_020568	CAT	2	6	2310306	2310311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13563	NC_020568	ATG	2	6	2310326	2310331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_020568	TA	3	6	2310354	2310359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_020568	T	6	6	2310363	2310368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_020568	TAAC	2	8	2310387	2310394	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13567	NC_020568	AC	3	6	2310393	2310398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13568	NC_020568	CTTA	2	8	2311258	2311265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13569	NC_020568	A	6	6	2311272	2311277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_020568	A	6	6	2311308	2311313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13571	NC_020568	GTT	2	6	2311338	2311343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13573	NC_020568	A	7	7	2311397	2311403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_020568	TCA	2	6	2311423	2311428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13578	NC_020568	CATAAT	2	12	2311536	2311547	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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13582	NC_020568	ATT	2	6	2311617	2311622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13583	NC_020568	A	7	7	2311667	2311673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13587	NC_020568	CTT	2	6	2311808	2311813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13593	NC_020568	ATG	2	6	2311991	2311996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13598	NC_020568	TC	3	6	2312182	2312187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13599	NC_020568	AATT	2	8	2315245	2315252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13600	NC_020568	GTT	2	6	2315276	2315281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13603	NC_020568	ATT	2	6	2315379	2315384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_020568	TTA	2	6	2315434	2315439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13607	NC_020568	TAA	2	6	2315510	2315515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13610	NC_020568	AAATC	2	10	2315596	2315605	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13611	NC_020568	TAAA	2	8	2315612	2315619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_020568	TCTA	2	8	2315698	2315705	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13613	NC_020568	TATT	2	8	2316744	2316751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_020568	T	7	7	2316766	2316772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_020568	T	6	6	2316799	2316804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13616	NC_020568	T	6	6	2316809	2316814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13618	NC_020568	ATCATT	2	12	2317647	2317658	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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13620	NC_020568	CAA	2	6	2317685	2317690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13621	NC_020568	CTT	2	6	2317703	2317708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13622	NC_020568	A	7	7	2317721	2317727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13623	NC_020568	GAAAG	2	10	2317757	2317766	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13624	NC_020568	TAA	2	6	2317771	2317776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13625	NC_020568	TGT	2	6	2317787	2317792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13626	NC_020568	TA	3	6	2317824	2317829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13627	NC_020568	T	6	6	2317886	2317891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13628	NC_020568	A	6	6	2317910	2317915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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