MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_020568	AGG	2	6	2238493	2238498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_020568	A	6	6	2239474	2239479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_020568	AAT	2	6	2239556	2239561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_020568	AC	3	6	2239568	2239573	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13005	NC_020568	A	7	7	2239580	2239586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_020568	ATA	2	6	2239596	2239601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_020568	TA	3	6	2239615	2239620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_020568	ACG	2	6	2239656	2239661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_020568	GCT	2	6	2239663	2239668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_020568	T	6	6	2239680	2239685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_020568	AGTA	2	8	2239710	2239717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_020568	TAA	2	6	2239761	2239766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_020568	AGCTTG	2	12	2239791	2239802	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13014	NC_020568	ACC	3	9	2239812	2239820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13015	NC_020568	CAT	2	6	2239838	2239843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_020568	TGGT	2	8	2239872	2239879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_020568	TTA	2	6	2239930	2239935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_020568	ACG	2	6	2239989	2239994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_020568	TCC	2	6	2240032	2240037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13020	NC_020568	GTT	2	6	2240070	2240075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_020568	CCA	2	6	2240099	2240104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13022	NC_020568	T	6	6	2240116	2240121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_020568	TTC	2	6	2240196	2240201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_020568	CAG	2	6	2240211	2240216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13025	NC_020568	TGAT	2	8	2240217	2240224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_020568	ACC	2	6	2240230	2240235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13027	NC_020568	GAT	2	6	2240238	2240243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_020568	GTA	2	6	2240254	2240259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_020568	TAA	2	6	2240307	2240312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_020568	GTGTG	2	10	2240338	2240347	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_020568	AGAT	2	8	2240373	2240380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_020568	TGA	2	6	2240389	2240394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_020568	ATA	2	6	2240480	2240485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_020568	TCC	2	6	2240490	2240495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13035	NC_020568	A	6	6	2240497	2240502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_020568	GAT	2	6	2240546	2240551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_020568	ATTT	2	8	2240585	2240592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_020568	TGT	2	6	2240600	2240605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_020568	TA	3	6	2240617	2240622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_020568	TAA	2	6	2240681	2240686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_020568	CAT	2	6	2243110	2243115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_020568	TC	4	8	2243995	2244002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13043	NC_020568	TATC	2	8	2244017	2244024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13044	NC_020568	TA	3	6	2244075	2244080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_020568	GTT	2	6	2244119	2244124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_020568	AAC	2	6	2244126	2244131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_020568	CT	3	6	2244153	2244158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13048	NC_020568	TAA	2	6	2244178	2244183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_020568	GGT	2	6	2244207	2244212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_020568	ATA	2	6	2244229	2244234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_020568	TTCA	2	8	2244242	2244249	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13052	NC_020568	A	6	6	2244302	2244307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_020568	A	6	6	2244370	2244375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_020568	GC	3	6	2244376	2244381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13055	NC_020568	CAT	2	6	2244386	2244391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_020568	TTG	2	6	2244396	2244401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_020568	TTTA	2	8	2244419	2244426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_020568	TA	3	6	2244495	2244500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_020568	AGT	2	6	2244503	2244508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_020568	TA	3	6	2244518	2244523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_020568	CGA	2	6	2244569	2244574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_020568	ACC	2	6	2244601	2244606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13063	NC_020568	AAT	2	6	2244641	2244646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_020568	ACG	2	6	2244718	2244723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_020568	T	6	6	2244739	2244744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_020568	CAA	2	6	2244765	2244770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_020568	CTT	2	6	2244780	2244785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_020568	TAA	3	9	2244819	2244827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_020568	CCT	2	6	2244905	2244910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13070	NC_020568	TCC	2	6	2245866	2245871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13071	NC_020568	TA	3	6	2245873	2245878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_020568	CAT	2	6	2245924	2245929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_020568	ACG	3	9	2245939	2245947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13074	NC_020568	TGG	2	6	2245951	2245956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_020568	TGC	2	6	2246134	2246139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13076	NC_020568	T	6	6	2246152	2246157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_020568	TGA	2	6	2246185	2246190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_020568	TCA	2	6	2246213	2246218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13079	NC_020568	GTT	2	6	2246236	2246241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_020568	TG	3	6	2246256	2246261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_020568	CCT	2	6	2246333	2246338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13082	NC_020568	TAT	2	6	2246344	2246349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_020568	T	6	6	2246349	2246354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_020568	CG	3	6	2246392	2246397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13085	NC_020568	T	6	6	2246408	2246413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_020568	ACG	2	6	2246433	2246438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13087	NC_020568	ATG	2	6	2246456	2246461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_020568	AGTT	2	8	2246489	2246496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_020568	ACG	2	6	2246499	2246504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_020568	TCA	2	6	2246560	2246565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13091	NC_020568	CTT	2	6	2246603	2246608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_020568	T	6	6	2246615	2246620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_020568	TA	4	8	2246644	2246651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_020568	CT	3	6	2246724	2246729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13095	NC_020568	TTA	2	6	2246731	2246736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_020568	TTTG	2	8	2246745	2246752	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_020568	CTTTAC	2	12	2246781	2246792	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_020568	TAT	2	6	2246863	2246868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_020568	ATT	2	6	2246878	2246883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_020568	TTC	2	6	2246899	2246904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13101	NC_020568	ATTC	2	8	2246969	2246976	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13102	NC_020568	AATT	2	8	2247204	2247211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_020568	ATCT	2	8	2247231	2247238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13104	NC_020568	CCT	2	6	2247944	2247949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13105	NC_020568	CTG	3	9	2249287	2249295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_020568	AAC	2	6	2249381	2249386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13107	NC_020568	CTA	2	6	2249395	2249400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13108	NC_020568	TTA	2	6	2249436	2249441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_020568	ACG	2	6	2249507	2249512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_020568	AAT	2	6	2249514	2249519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_020568	ACC	2	6	2249528	2249533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13112	NC_020568	ACC	2	6	2249552	2249557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13113	NC_020568	ATTTC	2	10	2249680	2249689	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13114	NC_020568	CCT	2	6	2249694	2249699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13115	NC_020568	ATT	2	6	2249702	2249707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_020568	TCT	2	6	2249710	2249715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_020568	TTG	2	6	2249737	2249742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_020568	CAA	2	6	2249771	2249776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_020568	GAC	2	6	2249837	2249842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_020568	CCT	2	6	2250409	2250414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13121	NC_020568	TTAAA	2	10	2250415	2250424	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_020568	TGC	2	6	2250444	2250449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_020568	TCC	2	6	2250486	2250491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13124	NC_020568	CAG	2	6	2250524	2250529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13125	NC_020568	T	6	6	2250531	2250536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_020568	GTA	2	6	2250583	2250588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_020568	GAA	2	6	2250607	2250612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_020568	TAT	2	6	2250635	2250640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_020568	AAT	2	6	2250645	2250650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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