MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020568	TAAATG	2	12	2166059	2166070	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_020568	GTG	2	6	2166122	2166127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_020568	ATT	2	6	2166258	2166263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_020568	AGT	2	6	2166297	2166302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_020568	GAA	3	9	2166379	2166387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_020568	ATCGT	2	10	2166395	2166404	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12507	NC_020568	AGA	2	6	2166420	2166425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_020568	GAG	2	6	2166442	2166447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_020568	TTTG	2	8	2167576	2167583	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_020568	AAG	2	6	2167588	2167593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_020568	TAA	2	6	2167621	2167626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_020568	GTA	2	6	2167628	2167633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_020568	A	6	6	2167670	2167675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_020568	TATG	2	8	2167708	2167715	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_020568	TAA	2	6	2167734	2167739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_020568	TCC	2	6	2175337	2175342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12517	NC_020568	ATT	2	6	2175349	2175354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_020568	AGT	2	6	2175395	2175400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_020568	AATTAA	2	12	2175436	2175447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_020568	ATC	2	6	2175452	2175457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_020568	TA	3	6	2175460	2175465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_020568	ATT	2	6	2175546	2175551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_020568	A	7	7	2175563	2175569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_020568	TCC	2	6	2178739	2178744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12525	NC_020568	ATA	2	6	2178760	2178765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_020568	AT	3	6	2178804	2178809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_020568	A	6	6	2178818	2178823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_020568	ACT	2	6	2178842	2178847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12529	NC_020568	A	7	7	2178868	2178874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_020568	AAT	2	6	2179861	2179866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_020568	TTA	2	6	2179917	2179922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_020568	A	8	8	2179929	2179936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_020568	AGT	2	6	2179962	2179967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_020568	AT	3	6	2180118	2180123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_020568	TGG	2	6	2180127	2180132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_020568	G	6	6	2180134	2180139	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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12538	NC_020568	TAA	2	6	2180228	2180233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_020568	TGG	2	6	2180240	2180245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_020568	CCG	2	6	2180263	2180268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12541	NC_020568	AAT	2	6	2180318	2180323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_020568	CCG	2	6	2180352	2180357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12543	NC_020568	CCT	2	6	2180574	2180579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12544	NC_020568	AGTA	2	8	2180630	2180637	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_020568	ATTT	2	8	2180661	2180668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_020568	TCGA	2	8	2180680	2180687	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12547	NC_020568	TCA	2	6	2180742	2180747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12549	NC_020568	CA	3	6	2180833	2180838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12550	NC_020568	CTC	2	6	2180919	2180924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12553	NC_020568	ACC	2	6	2181163	2181168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12554	NC_020568	ATGA	2	8	2181245	2181252	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_020568	AGG	2	6	2181299	2181304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_020568	CAC	2	6	2181344	2181349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12557	NC_020568	GTG	2	6	2181355	2181360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_020568	GTA	2	6	2181387	2181392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_020568	CCA	2	6	2181395	2181400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12560	NC_020568	CCTA	2	8	2181439	2181446	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12561	NC_020568	TC	3	6	2181559	2181564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12562	NC_020568	GCC	2	6	2181656	2181661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12563	NC_020568	CTC	2	6	2181704	2181709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12564	NC_020568	TCGC	2	8	2181893	2181900	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12565	NC_020568	TCTA	2	8	2181959	2181966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12566	NC_020568	TCT	2	6	2182013	2182018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12567	NC_020568	CAATC	2	10	2182086	2182095	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12568	NC_020568	C	6	6	2182121	2182126	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12569	NC_020568	GGT	2	6	2182146	2182151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12572	NC_020568	AT	3	6	2182531	2182536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_020568	TGG	2	6	2182551	2182556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_020568	AATT	2	8	2182616	2182623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_020568	AAT	2	6	2182692	2182697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12577	NC_020568	TCGGT	2	10	2182807	2182816	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12578	NC_020568	ACT	2	6	2183012	2183017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12582	NC_020568	AG	3	6	2183188	2183193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_020568	ACA	2	6	2183194	2183199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12584	NC_020568	ATT	2	6	2183214	2183219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_020568	CTT	2	6	2183222	2183227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12586	NC_020568	GAT	2	6	2183243	2183248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12588	NC_020568	CAA	2	6	2183297	2183302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12589	NC_020568	TTG	2	6	2183309	2183314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_020568	TCGC	2	8	2183333	2183340	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12591	NC_020568	CTA	2	6	2183343	2183348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12593	NC_020568	CTTA	2	8	2183495	2183502	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12594	NC_020568	TCG	2	6	2183520	2183525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12595	NC_020568	TAA	2	6	2183578	2183583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_020568	CCA	2	6	2183598	2183603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12597	NC_020568	TTA	2	6	2183663	2183668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_020568	ATT	2	6	2183699	2183704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_020568	TACT	2	8	2183771	2183778	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12600	NC_020568	A	6	6	2183839	2183844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_020568	CTTT	2	8	2183909	2183916	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12602	NC_020568	A	6	6	2183965	2183970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_020568	TAAA	2	8	2183982	2183989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_020568	TCT	2	6	2184028	2184033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12605	NC_020568	GAA	2	6	2184034	2184039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_020568	AT	3	6	2184050	2184055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_020568	AGG	2	6	2184064	2184069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_020568	GTG	2	6	2184191	2184196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_020568	GT	3	6	2184206	2184211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_020568	AAC	2	6	2184310	2184315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_020568	GT	3	6	2184375	2184380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_020568	ATG	2	6	2184400	2184405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_020568	TCC	2	6	2184426	2184431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12614	NC_020568	ATG	2	6	2184470	2184475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_020568	CACGA	2	10	2184525	2184534	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12616	NC_020568	GAC	2	6	2184538	2184543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12621	NC_020568	A	6	6	2185013	2185018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_020568	CG	3	6	2185026	2185031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12623	NC_020568	AAT	2	6	2185042	2185047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12624	NC_020568	GCT	2	6	2185082	2185087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12625	NC_020568	TTAC	2	8	2185140	2185147	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12626	NC_020568	TTC	2	6	2185155	2185160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12627	NC_020568	TAA	2	6	2185163	2185168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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