MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020568	ACT	2	6	2018437	2018442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_020568	GC	3	6	2018534	2018539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11503	NC_020568	CTA	2	6	2018570	2018575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_020568	CCT	2	6	2019224	2019229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11505	NC_020568	TAA	2	6	2019377	2019382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_020568	CCT	2	6	2019437	2019442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11507	NC_020568	GATT	2	8	2019511	2019518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_020568	TCT	2	6	2019583	2019588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_020568	CTT	3	9	2019621	2019629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_020568	AAATC	2	10	2019643	2019652	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11511	NC_020568	ATTA	2	8	2019660	2019667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_020568	ACAT	2	8	2019675	2019682	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11513	NC_020568	TCC	2	6	2019709	2019714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11514	NC_020568	CAA	2	6	2019775	2019780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_020568	T	7	7	2019788	2019794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_020568	GTA	2	6	2019817	2019822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_020568	ATA	2	6	2019915	2019920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_020568	CTA	2	6	2019924	2019929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_020568	TCC	2	6	2019961	2019966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11520	NC_020568	T	6	6	2019975	2019980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_020568	AAT	2	6	2020040	2020045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_020568	TTC	2	6	2020176	2020181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_020568	TGG	2	6	2020206	2020211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_020568	CTTTC	2	10	2020236	2020245	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11525	NC_020568	TGT	2	6	2020254	2020259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_020568	CGA	2	6	2020296	2020301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_020568	TGT	2	6	2020348	2020353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_020568	CTA	2	6	2020377	2020382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_020568	TGA	2	6	2020444	2020449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_020568	GTT	2	6	2020455	2020460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_020568	TCC	2	6	2020484	2020489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11532	NC_020568	A	6	6	2020492	2020497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_020568	ACC	2	6	2020579	2020584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11534	NC_020568	ACT	2	6	2020622	2020627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_020568	TGA	2	6	2020692	2020697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_020568	TTG	2	6	2020724	2020729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_020568	T	6	6	2020733	2020738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_020568	CTCAT	2	10	2020748	2020757	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11539	NC_020568	T	7	7	2020761	2020767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_020568	TGT	2	6	2020826	2020831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_020568	CTT	2	6	2021512	2021517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_020568	AAC	2	6	2021519	2021524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11543	NC_020568	GTT	3	9	2021551	2021559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_020568	ATTT	2	8	2021604	2021611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_020568	CTTT	2	8	2021612	2021619	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11546	NC_020568	CCT	2	6	2021653	2021658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11547	NC_020568	TGTT	2	8	2021666	2021673	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_020568	TTA	2	6	2021688	2021693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_020568	TTG	2	6	2021702	2021707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_020568	CCA	2	6	2021713	2021718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11551	NC_020568	GAA	2	6	2021727	2021732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_020568	A	6	6	2021793	2021798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_020568	T	6	6	2021815	2021820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_020568	T	6	6	2021822	2021827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_020568	ATTT	2	8	2021828	2021835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_020568	TTAA	2	8	2021861	2021868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_020568	AAACT	2	10	2021907	2021916	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11558	NC_020568	ACC	2	6	2021977	2021982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11559	NC_020568	TCAT	2	8	2022005	2022012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11560	NC_020568	A	6	6	2022136	2022141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_020568	TTAAA	2	10	2022181	2022190	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_020568	ATTT	2	8	2022211	2022218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_020568	TAGT	2	8	2022253	2022260	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_020568	AATTT	2	10	2023956	2023965	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_020568	TAT	2	6	2023968	2023973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_020568	TCT	2	6	2023992	2023997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_020568	TTG	2	6	2024051	2024056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_020568	ACACG	2	10	2024059	2024068	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11569	NC_020568	CTT	2	6	2024074	2024079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11570	NC_020568	CAT	2	6	2024104	2024109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11571	NC_020568	GTT	2	6	2024196	2024201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_020568	TGTTCT	2	12	2024202	2024213	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11573	NC_020568	T	6	6	2024213	2024218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_020568	AAT	2	6	2024222	2024227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_020568	TCC	2	6	2024261	2024266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11576	NC_020568	A	6	6	2024269	2024274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_020568	ACAT	2	8	2024309	2024316	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11578	NC_020568	TAA	2	6	2024320	2024325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_020568	TTAA	2	8	2024359	2024366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_020568	ATAAA	2	10	2024392	2024401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_020568	GGA	2	6	2024418	2024423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_020568	A	6	6	2025176	2025181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_020568	CA	3	6	2025187	2025192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11584	NC_020568	TAA	2	6	2026450	2026455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_020568	AATATT	2	12	2026497	2026508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_020568	AAG	2	6	2026585	2026590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_020568	AAT	2	6	2026595	2026600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_020568	AT	3	6	2027232	2027237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_020568	GTA	2	6	2027286	2027291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_020568	GCT	2	6	2027309	2027314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11591	NC_020568	ACT	2	6	2027469	2027474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11592	NC_020568	T	6	6	2027526	2027531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_020568	TA	4	8	2027558	2027565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_020568	ATA	2	6	2028387	2028392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_020568	GA	3	6	2028426	2028431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_020568	T	7	7	2028453	2028459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_020568	ATA	2	6	2028460	2028465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_020568	ATGA	2	8	2028501	2028508	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_020568	TTAA	2	8	2028514	2028521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_020568	T	6	6	2028531	2028536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_020568	AT	3	6	2028563	2028568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_020568	CTT	2	6	2028606	2028611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_020568	A	6	6	2028621	2028626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_020568	TTA	3	9	2028660	2028668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_020568	T	6	6	2028688	2028693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_020568	TTA	2	6	2028713	2028718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_020568	A	7	7	2028725	2028731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_020568	TTTA	2	8	2028733	2028740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_020568	AAT	2	6	2028744	2028749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_020568	TGT	2	6	2028760	2028765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_020568	AAT	2	6	2028788	2028793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_020568	CTA	2	6	2028849	2028854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_020568	TTA	2	6	2028887	2028892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_020568	TAA	2	6	2028906	2028911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_020568	TAAT	2	8	2028958	2028965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_020568	T	6	6	2028977	2028982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_020568	TTG	2	6	2029030	2029035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_020568	TCCT	2	8	2029064	2029071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11619	NC_020568	TCA	2	6	2029105	2029110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11620	NC_020568	ATTT	2	8	2029164	2029171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_020568	T	6	6	2029194	2029199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_020568	T	7	7	2029215	2029221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_020568	TATT	2	8	2029262	2029269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_020568	T	6	6	2029931	2029936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_020568	AATTA	2	10	2029945	2029954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_020568	GCA	2	6	2029992	2029997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11627	NC_020568	TGA	2	6	2030005	2030010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_020568	GT	3	6	2030072	2030077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11629	NC_020568	ATA	2	6	2032106	2032111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11631	NC_020568	TAA	2	6	2032203	2032208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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