MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_020568	ATTACA	2	12	1241719	1241730	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7002	NC_020568	TGT	2	6	1241733	1241738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_020568	AAG	2	6	1241795	1241800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_020568	TAT	2	6	1241877	1241882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_020568	ATCA	2	8	1241906	1241913	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7006	NC_020568	TAA	2	6	1241925	1241930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_020568	ACAA	2	8	1241957	1241964	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7008	NC_020568	GATA	2	8	1241965	1241972	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_020568	T	7	7	1242078	1242084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_020568	AT	3	6	1242115	1242120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_020568	A	6	6	1242124	1242129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_020568	TA	3	6	1244059	1244064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_020568	TAG	2	6	1244090	1244095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_020568	AGG	2	6	1244145	1244150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_020568	TACT	2	8	1244251	1244258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7016	NC_020568	AC	3	6	1244292	1244297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7017	NC_020568	A	6	6	1244298	1244303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_020568	ACC	2	6	1244305	1244310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7019	NC_020568	CGT	2	6	1244316	1244321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_020568	ATT	2	6	1244324	1244329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_020568	GTC	2	6	1244341	1244346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_020568	ACT	2	6	1244362	1244367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_020568	GTA	2	6	1244371	1244376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_020568	AATT	2	8	1244398	1244405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_020568	CGT	2	6	1244421	1244426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_020568	A	6	6	1244488	1244493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_020568	TAT	2	6	1244516	1244521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_020568	AAT	2	6	1244543	1244548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_020568	GAT	2	6	1244568	1244573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_020568	TAA	2	6	1244590	1244595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_020568	T	6	6	1244620	1244625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_020568	A	6	6	1244626	1244631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_020568	ATA	2	6	1244683	1244688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_020568	CT	3	6	1244702	1244707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7035	NC_020568	T	7	7	1244707	1244713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_020568	ATA	2	6	1244749	1244754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_020568	ATGAT	2	10	1244756	1244765	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_020568	AG	3	6	1244782	1244787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_020568	GAC	2	6	1246910	1246915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_020568	T	7	7	1246933	1246939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_020568	T	6	6	1246946	1246951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_020568	TGT	2	6	1246974	1246979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_020568	TAT	2	6	1247001	1247006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_020568	TGTA	2	8	1247031	1247038	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_020568	T	6	6	1247065	1247070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_020568	ATG	2	6	1248884	1248889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_020568	GAT	2	6	1248943	1248948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_020568	TA	4	8	1249010	1249017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_020568	CGT	2	6	1249022	1249027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_020568	AAG	2	6	1252149	1252154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_020568	AGG	2	6	1252161	1252166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_020568	TA	3	6	1252168	1252173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_020568	TGAT	2	8	1255465	1255472	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_020568	AGG	2	6	1256368	1256373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_020568	CGGT	2	8	1256388	1256395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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7057	NC_020568	TTA	2	6	1256538	1256543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_020568	GTA	2	6	1256558	1256563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_020568	AATT	2	8	1256580	1256587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7061	NC_020568	AAT	3	9	1256651	1256659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_020568	ATT	2	6	1256701	1256706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_020568	TAA	2	6	1256730	1256735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_020568	AAAT	2	8	1256777	1256784	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_020568	TTTCAT	2	12	1257404	1257415	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7066	NC_020568	T	7	7	1257427	1257433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_020568	AT	3	6	1257475	1257480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_020568	T	6	6	1257501	1257506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_020568	TGT	2	6	1257516	1257521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7074	NC_020568	AGG	2	6	1258912	1258917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_020568	GATT	2	8	1260015	1260022	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_020568	AAT	2	6	1260051	1260056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_020568	T	6	6	1260098	1260103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_020568	TATT	2	8	1260108	1260115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_020568	TAG	2	6	1260163	1260168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7081	NC_020568	TA	4	8	1260253	1260260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_020568	AGG	2	6	1260309	1260314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7084	NC_020568	TAA	2	6	1261959	1261964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_020568	AAG	2	6	1262014	1262019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_020568	TAA	2	6	1262030	1262035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_020568	TATATT	2	12	1262060	1262071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_020568	A	6	6	1262109	1262114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_020568	GAAGA	2	10	1262115	1262124	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_020568	TCT	2	6	1262134	1262139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7092	NC_020568	ATTT	2	8	1262160	1262167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_020568	TTG	2	6	1262240	1262245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_020568	TTG	2	6	1262249	1262254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7096	NC_020568	CTTT	2	8	1262299	1262306	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7097	NC_020568	TATT	2	8	1262395	1262402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_020568	TATT	2	8	1262412	1262419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_020568	TC	3	6	1262466	1262471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7100	NC_020568	GAA	2	6	1262479	1262484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_020568	AAT	2	6	1262486	1262491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_020568	GTAA	2	8	1263371	1263378	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_020568	GGT	2	6	1263448	1263453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_020568	T	6	6	1266188	1266193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_020568	A	6	6	1266202	1266207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_020568	AAT	2	6	1266251	1266256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_020568	ACAATG	2	12	1266271	1266282	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7108	NC_020568	AAT	2	6	1266311	1266316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_020568	ATGA	2	8	1266375	1266382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_020568	TTTAAT	2	12	1266386	1266397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_020568	TGG	2	6	1266418	1266423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_020568	TAT	2	6	1266440	1266445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_020568	AAGTT	2	10	1266451	1266460	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_020568	ATG	2	6	1266508	1266513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_020568	ATT	2	6	1266612	1266617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_020568	TAA	2	6	1268202	1268207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_020568	ATA	2	6	1268231	1268236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_020568	CAA	2	6	1268278	1268283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_020568	TCA	2	6	1268298	1268303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7120	NC_020568	A	6	6	1268337	1268342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_020568	AAAT	2	8	1268432	1268439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_020568	ATT	2	6	1268490	1268495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_020568	CAA	2	6	1268510	1268515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_020568	ATA	2	6	1268537	1268542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_020568	ATTA	2	8	1268558	1268565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_020568	CAAA	2	8	1268566	1268573	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7127	NC_020568	AT	3	6	1269088	1269093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_020568	CTTA	2	8	1269135	1269142	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7129	NC_020568	TAATT	2	10	1269169	1269178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_020568	TTA	2	6	1269201	1269206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_020568	AGTA	2	8	1269273	1269280	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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