MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_020566	TTG	2	6	2727497	2727502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_020566	GTT	2	6	2729008	2729013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_020566	TACTT	2	10	2729014	2729023	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16004	NC_020566	TAA	2	6	2729051	2729056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_020566	CTT	2	6	2729192	2729197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_020566	TTA	2	6	2729216	2729221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_020566	TTTC	2	8	2729233	2729240	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16008	NC_020566	TTA	2	6	2729248	2729253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_020566	TAT	2	6	2730406	2730411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_020566	TAT	2	6	2730430	2730435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_020566	ATTTTA	2	12	2730467	2730478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_020566	T	6	6	2730479	2730484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_020566	CTATTT	2	12	2731015	2731026	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16014	NC_020566	TAA	2	6	2731794	2731799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_020566	TGA	2	6	2731828	2731833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_020566	TAT	2	6	2731865	2731870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_020566	AT	3	6	2733582	2733587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_020566	CATT	2	8	2733601	2733608	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16019	NC_020566	CAA	2	6	2733622	2733627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16020	NC_020566	A	6	6	2734206	2734211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_020566	CCT	2	6	2735071	2735076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16022	NC_020566	T	6	6	2735076	2735081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_020566	A	7	7	2735090	2735096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_020566	TAG	2	6	2735179	2735184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_020566	ATA	3	9	2735199	2735207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_020566	CTT	2	6	2735251	2735256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16027	NC_020566	AATT	2	8	2735265	2735272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_020566	GTG	2	6	2735293	2735298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_020566	ATTCGA	2	12	2735335	2735346	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16030	NC_020566	T	6	6	2735368	2735373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_020566	GGT	2	6	2735375	2735380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_020566	TGTA	2	8	2735383	2735390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_020566	A	6	6	2735401	2735406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_020566	AT	5	10	2735986	2735995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_020566	ATC	2	6	2736012	2736017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16036	NC_020566	AGGT	2	8	2736100	2736107	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_020566	ATG	2	6	2737238	2737243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_020566	TTAA	2	8	2738283	2738290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_020566	T	6	6	2738345	2738350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_020566	CATA	2	8	2738356	2738363	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16041	NC_020566	TAAAT	2	10	2738398	2738407	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_020566	CAAA	2	8	2739082	2739089	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16043	NC_020566	GAT	2	6	2739135	2739140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_020566	ATG	2	6	2739161	2739166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_020566	ATC	2	6	2739980	2739985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16046	NC_020566	GCC	2	6	2740072	2740077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16047	NC_020566	T	7	7	2740087	2740093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_020566	T	6	6	2740114	2740119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_020566	TAC	2	6	2740146	2740151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16050	NC_020566	ATCTG	2	10	2740265	2740274	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16051	NC_020566	CTA	2	6	2740294	2740299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16052	NC_020566	ATA	2	6	2740306	2740311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_020566	GTT	2	6	2740360	2740365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_020566	AAC	2	6	2740387	2740392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16055	NC_020566	TTA	2	6	2740924	2740929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_020566	AAC	2	6	2740936	2740941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16057	NC_020566	T	6	6	2740953	2740958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_020566	T	6	6	2740977	2740982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_020566	TAA	2	6	2740988	2740993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_020566	TTC	2	6	2741010	2741015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16061	NC_020566	AAT	2	6	2741030	2741035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_020566	TTAAT	2	10	2741052	2741061	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_020566	ATT	2	6	2741072	2741077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_020566	AGAA	2	8	2741133	2741140	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_020566	A	7	7	2742810	2742816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_020566	ATTT	2	8	2742861	2742868	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_020566	CA	3	6	2742911	2742916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16068	NC_020566	CCT	2	6	2743901	2743906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16069	NC_020566	TAA	2	6	2743967	2743972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16070	NC_020566	ACCA	2	8	2744019	2744026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16071	NC_020566	AAT	2	6	2744048	2744053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_020566	ACA	2	6	2744093	2744098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16073	NC_020566	GGAT	2	8	2744103	2744110	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_020566	AT	4	8	2744730	2744737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_020566	TAA	2	6	2744740	2744745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_020566	AAT	2	6	2744750	2744755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16077	NC_020566	ATA	2	6	2744761	2744766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16078	NC_020566	TTG	2	6	2745897	2745902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16079	NC_020566	CTT	2	6	2745924	2745929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16083	NC_020566	GTAG	2	8	2746943	2746950	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16084	NC_020566	T	6	6	2746957	2746962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16087	NC_020566	CAAT	2	8	2747554	2747561	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16088	NC_020566	A	6	6	2747595	2747600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16089	NC_020566	TAT	2	6	2747603	2747608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16090	NC_020566	AAT	2	6	2747611	2747616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_020566	CAT	2	6	2747645	2747650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16093	NC_020566	CTA	2	6	2747715	2747720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16094	NC_020566	TTCA	2	8	2747749	2747756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16095	NC_020566	CTA	2	6	2747781	2747786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16096	NC_020566	ATT	2	6	2747795	2747800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_020566	GATTTT	2	12	2750491	2750502	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_020566	GA	3	6	2750541	2750546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_020566	ACA	2	6	2750665	2750670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16100	NC_020566	TTA	2	6	2750695	2750700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16101	NC_020566	TTA	2	6	2750709	2750714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16102	NC_020566	CGT	2	6	2750722	2750727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16103	NC_020566	GAA	2	6	2750728	2750733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_020566	CAA	2	6	2750801	2750806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16105	NC_020566	GCT	2	6	2750819	2750824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16107	NC_020566	T	6	6	2750909	2750914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_020566	ATTT	2	8	2750970	2750977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_020566	A	6	6	2750980	2750985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_020566	TAA	2	6	2751028	2751033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_020566	T	6	6	2751078	2751083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_020566	AGA	2	6	2751259	2751264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16113	NC_020566	CAA	2	6	2751384	2751389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16114	NC_020566	TTG	2	6	2751401	2751406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_020566	T	7	7	2751410	2751416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_020566	ATA	2	6	2751429	2751434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_020566	GAT	3	9	2751446	2751454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_020566	ACA	2	6	2752126	2752131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16119	NC_020566	AGAC	2	8	2752154	2752161	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16120	NC_020566	TTA	2	6	2752211	2752216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16121	NC_020566	ATG	2	6	2752217	2752222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_020566	T	6	6	2752331	2752336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_020566	ATAC	2	8	2752363	2752370	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16124	NC_020566	TGA	2	6	2752376	2752381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_020566	CAA	2	6	2752397	2752402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16126	NC_020566	CAT	2	6	2752437	2752442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16127	NC_020566	TAA	2	6	2752538	2752543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16128	NC_020566	TAA	2	6	2752629	2752634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16129	NC_020566	C	6	6	2752645	2752650	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16130	NC_020566	A	6	6	2752653	2752658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16131	NC_020566	ATG	2	6	2752678	2752683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16132	NC_020566	TAA	2	6	2752708	2752713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16133	NC_020566	CAA	2	6	2752790	2752795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16134	NC_020566	AG	3	6	2752842	2752847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16135	NC_020566	GAT	2	6	2752938	2752943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16136	NC_020566	ATA	2	6	2752958	2752963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16137	NC_020566	AAGA	2	8	2752969	2752976	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16138	NC_020566	TAG	2	6	2752986	2752991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16142	NC_020566	ACC	2	6	2753056	2753061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16143	NC_020566	GAA	2	6	2753073	2753078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16144	NC_020566	TAAT	2	8	2753119	2753126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16146	NC_020566	ATTT	2	8	2753304	2753311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16151	NC_020566	A	7	7	2753477	2753483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16152	NC_020566	TCA	2	6	2753526	2753531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16154	NC_020566	CTT	2	6	2757063	2757068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16155	NC_020566	CCT	2	6	2758487	2758492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16158	NC_020566	CTTA	2	8	2758631	2758638	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16159	NC_020566	TTA	2	6	2758645	2758650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16161	NC_020566	GCTG	2	8	2758717	2758724	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16162	NC_020566	AAT	2	6	2758737	2758742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16163	NC_020566	AT	3	6	2758754	2758759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16164	NC_020566	T	6	6	2758830	2758835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16165	NC_020566	TAT	2	6	2758874	2758879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16167	NC_020566	T	6	6	2758923	2758928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16168	NC_020566	AT	3	6	2758929	2758934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16169	NC_020566	TTAT	2	8	2758993	2759000	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16170	NC_020566	TATT	2	8	2759055	2759062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16171	NC_020566	A	8	8	2759076	2759083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16178	NC_020566	T	7	7	2759443	2759449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.