MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_020566	TAA	2	6	2619073	2619078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_020566	TCC	2	6	2619084	2619089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15503	NC_020566	GATTC	2	10	2619150	2619159	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15504	NC_020566	AATTAA	2	12	2619223	2619234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_020566	T	6	6	2619291	2619296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_020566	TGT	2	6	2619326	2619331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_020566	T	7	7	2621197	2621203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_020566	TAA	2	6	2621221	2621226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_020566	ACT	2	6	2622360	2622365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15510	NC_020566	TTTA	2	8	2622389	2622396	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_020566	CTC	2	6	2622419	2622424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15512	NC_020566	ACT	2	6	2622429	2622434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15513	NC_020566	ACT	2	6	2622438	2622443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15514	NC_020566	ATT	2	6	2622444	2622449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_020566	TCC	2	6	2622965	2622970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15516	NC_020566	TAT	2	6	2622980	2622985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_020566	TAT	2	6	2623008	2623013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_020566	TCAAT	2	10	2623024	2623033	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15519	NC_020566	ACA	2	6	2623055	2623060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15520	NC_020566	GTTAA	2	10	2623078	2623087	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_020566	AAAT	2	8	2623105	2623112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_020566	CAT	2	6	2623168	2623173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15523	NC_020566	ATA	2	6	2623197	2623202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_020566	ATAAAA	2	12	2623234	2623245	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_020566	CTA	2	6	2623273	2623278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15526	NC_020566	AAT	2	6	2623340	2623345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_020566	TTCA	2	8	2623355	2623362	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15528	NC_020566	TCT	2	6	2623395	2623400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15529	NC_020566	CAA	2	6	2623447	2623452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15530	NC_020566	TGC	2	6	2623460	2623465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15531	NC_020566	CAAA	2	8	2623472	2623479	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15532	NC_020566	ATT	4	12	2623532	2623543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15533	NC_020566	AATC	2	8	2623597	2623604	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15534	NC_020566	TAC	2	6	2623609	2623614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15535	NC_020566	TCA	2	6	2623666	2623671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15536	NC_020566	GTA	2	6	2624518	2624523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15537	NC_020566	TAT	2	6	2625372	2625377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15538	NC_020566	GAAAG	2	10	2625405	2625414	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15539	NC_020566	AAG	3	9	2625412	2625420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_020566	AT	3	6	2626286	2626291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_020566	ACC	2	6	2626323	2626328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15542	NC_020566	ACT	2	6	2627134	2627139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15543	NC_020566	ATA	2	6	2627200	2627205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_020566	ATT	3	9	2627215	2627223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15545	NC_020566	TGCT	2	8	2627250	2627257	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15546	NC_020566	A	7	7	2627258	2627264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15547	NC_020566	AT	3	6	2627319	2627324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15548	NC_020566	TAAT	2	8	2627328	2627335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15549	NC_020566	CCTAA	2	10	2628319	2628328	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15550	NC_020566	ATTT	2	8	2628333	2628340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_020566	ATTTT	2	10	2628390	2628399	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15552	NC_020566	AATA	2	8	2628473	2628480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_020566	T	7	7	2628590	2628596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15554	NC_020566	TA	3	6	2628636	2628641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_020566	CCT	2	6	2628643	2628648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15556	NC_020566	TCA	2	6	2628665	2628670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15557	NC_020566	CAT	2	6	2628680	2628685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15558	NC_020566	A	6	6	2628836	2628841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_020566	ATT	2	6	2628920	2628925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15560	NC_020566	A	6	6	2628947	2628952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_020566	GGA	2	6	2628982	2628987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15562	NC_020566	A	7	7	2630449	2630455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15563	NC_020566	T	6	6	2630494	2630499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15564	NC_020566	GCAA	2	8	2631893	2631900	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15565	NC_020566	CT	3	6	2631907	2631912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15566	NC_020566	TAA	2	6	2631987	2631992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15567	NC_020566	AT	3	6	2632008	2632013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15568	NC_020566	TGC	2	6	2632147	2632152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15569	NC_020566	TCAT	2	8	2632163	2632170	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15570	NC_020566	TGT	2	6	2632188	2632193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_020566	TAA	2	6	2632200	2632205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_020566	CAAT	2	8	2632207	2632214	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15573	NC_020566	TAT	2	6	2632230	2632235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15574	NC_020566	AT	3	6	2632273	2632278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15575	NC_020566	ATA	2	6	2632286	2632291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15576	NC_020566	ATTT	2	8	2632316	2632323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15577	NC_020566	CTAT	2	8	2632363	2632370	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15578	NC_020566	TTAT	2	8	2632391	2632398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_020566	TATT	2	8	2632419	2632426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15580	NC_020566	ATT	2	6	2632475	2632480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15581	NC_020566	AATAA	2	10	2632525	2632534	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15582	NC_020566	TTAA	2	8	2632540	2632547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15583	NC_020566	ATT	2	6	2632555	2632560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15584	NC_020566	T	6	6	2633565	2633570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15585	NC_020566	ACT	2	6	2633578	2633583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15586	NC_020566	T	6	6	2633628	2633633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15587	NC_020566	GTAT	2	8	2633653	2633660	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15588	NC_020566	A	7	7	2633671	2633677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15589	NC_020566	ATC	2	6	2635270	2635275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15590	NC_020566	TAGT	2	8	2635370	2635377	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15591	NC_020566	AGCA	2	8	2635397	2635404	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15592	NC_020566	GTAAAT	2	12	2635408	2635419	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15593	NC_020566	ATT	2	6	2635424	2635429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15594	NC_020566	AT	3	6	2635443	2635448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15595	NC_020566	AGA	2	6	2635465	2635470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15596	NC_020566	ATCAA	2	10	2635476	2635485	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15597	NC_020566	ATT	2	6	2635491	2635496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15598	NC_020566	ACA	2	6	2635499	2635504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15599	NC_020566	ATCA	2	8	2635587	2635594	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15600	NC_020566	ATT	2	6	2635656	2635661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15601	NC_020566	TTA	2	6	2635746	2635751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_020566	GAC	2	6	2635843	2635848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15603	NC_020566	CAT	2	6	2635855	2635860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15604	NC_020566	ATC	2	6	2635885	2635890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15605	NC_020566	TGA	2	6	2637554	2637559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15606	NC_020566	TA	4	8	2637583	2637590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15607	NC_020566	ATTC	2	8	2638215	2638222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15608	NC_020566	TATT	2	8	2638226	2638233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_020566	CTT	2	6	2638253	2638258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15610	NC_020566	ATT	2	6	2638351	2638356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_020566	TTTTA	2	10	2638408	2638417	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15612	NC_020566	TGA	2	6	2638513	2638518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15613	NC_020566	GAAT	2	8	2638560	2638567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_020566	TCT	2	6	2638570	2638575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15615	NC_020566	ATC	2	6	2638611	2638616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15616	NC_020566	TA	3	6	2638629	2638634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15617	NC_020566	TC	3	6	2638659	2638664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15618	NC_020566	TA	3	6	2638673	2638678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15619	NC_020566	ATC	2	6	2638780	2638785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15620	NC_020566	CA	3	6	2638823	2638828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15621	NC_020566	ACA	2	6	2638839	2638844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15622	NC_020566	A	6	6	2638872	2638877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15623	NC_020566	CAATA	2	10	2638887	2638896	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15624	NC_020566	CTA	2	6	2638914	2638919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15625	NC_020566	TA	3	6	2638918	2638923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15626	NC_020566	AAT	2	6	2640782	2640787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15627	NC_020566	ATCA	2	8	2640818	2640825	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15628	NC_020566	ACAAA	2	10	2640842	2640851	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15629	NC_020566	CAA	2	6	2642389	2642394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15631	NC_020566	AAC	2	6	2642479	2642484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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