MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_020566	A	6	6	2537096	2537101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_020566	CTT	2	6	2537141	2537146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15003	NC_020566	TCC	2	6	2537757	2537762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15004	NC_020566	TA	3	6	2538743	2538748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_020566	TTG	2	6	2538857	2538862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_020566	TTTGAC	2	12	2538943	2538954	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15007	NC_020566	AT	3	6	2538975	2538980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_020566	ATC	2	6	2538989	2538994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15009	NC_020566	ACA	2	6	2539041	2539046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15010	NC_020566	TGC	2	6	2539054	2539059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15011	NC_020566	TAT	2	6	2539111	2539116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_020566	TCT	2	6	2539170	2539175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15013	NC_020566	ATTC	2	8	2539208	2539215	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15014	NC_020566	TTCG	2	8	2539239	2539246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15015	NC_020566	ATC	2	6	2539253	2539258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15016	NC_020566	ATTT	2	8	2539271	2539278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_020566	TA	3	6	2539295	2539300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_020566	TAA	2	6	2539356	2539361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_020566	GTC	2	6	2539386	2539391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15020	NC_020566	AATAG	2	10	2539430	2539439	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_020566	TGA	3	9	2539525	2539533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_020566	AAT	2	6	2539535	2539540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_020566	ATA	2	6	2539572	2539577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_020566	TGA	2	6	2539609	2539614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_020566	TGG	2	6	2539618	2539623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_020566	A	6	6	2539637	2539642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_020566	GTT	2	6	2539655	2539660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_020566	ATT	2	6	2539688	2539693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_020566	AGA	2	6	2539729	2539734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_020566	TAAA	2	8	2539760	2539767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_020566	T	6	6	2539796	2539801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_020566	TTTTC	2	10	2539870	2539879	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15033	NC_020566	TTA	2	6	2540751	2540756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_020566	T	6	6	2540763	2540768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_020566	T	7	7	2540807	2540813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_020566	TA	3	6	2540833	2540838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_020566	AC	3	6	2541658	2541663	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15038	NC_020566	AT	3	6	2541693	2541698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_020566	TTTAT	2	10	2542879	2542888	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_020566	ATT	2	6	2542930	2542935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_020566	AT	3	6	2542952	2542957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_020566	TGA	2	6	2542965	2542970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_020566	TGA	2	6	2543026	2543031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_020566	AT	3	6	2543952	2543957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_020566	AT	3	6	2544029	2544034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15046	NC_020566	A	6	6	2544094	2544099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_020566	TAA	2	6	2544127	2544132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_020566	A	6	6	2545538	2545543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_020566	TAT	2	6	2545570	2545575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_020566	CCA	2	6	2545591	2545596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15051	NC_020566	CGT	2	6	2545603	2545608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15052	NC_020566	CAAA	2	8	2545625	2545632	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15053	NC_020566	A	7	7	2545630	2545636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_020566	AT	3	6	2545668	2545673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_020566	ATTA	2	8	2546373	2546380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_020566	TAT	2	6	2546408	2546413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_020566	AT	3	6	2546425	2546430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_020566	TAA	2	6	2546483	2546488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_020566	ATT	2	6	2546502	2546507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_020566	ATA	2	6	2547015	2547020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_020566	TAACA	2	10	2547048	2547057	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15062	NC_020566	T	6	6	2547107	2547112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_020566	TAG	2	6	2547174	2547179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_020566	ATA	2	6	2547220	2547225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_020566	ATG	2	6	2547276	2547281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15066	NC_020566	GAT	2	6	2547293	2547298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15067	NC_020566	ATC	2	6	2547314	2547319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15068	NC_020566	AAG	2	6	2547416	2547421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_020566	ATCT	2	8	2547423	2547430	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15070	NC_020566	CAGA	2	8	2547444	2547451	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15071	NC_020566	CTT	2	6	2547454	2547459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15072	NC_020566	T	6	6	2547458	2547463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15073	NC_020566	CT	4	8	2550138	2550145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15074	NC_020566	TTTAT	2	10	2550149	2550158	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_020566	ATCAA	2	10	2550215	2550224	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15076	NC_020566	ACT	2	6	2550283	2550288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15077	NC_020566	TGT	2	6	2550291	2550296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_020566	TG	3	6	2550342	2550347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_020566	T	6	6	2550352	2550357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_020566	T	6	6	2550364	2550369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_020566	TATT	2	8	2550432	2550439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_020566	TTTTGT	2	12	2550440	2550451	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_020566	TTA	2	6	2550491	2550496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_020566	AT	3	6	2550500	2550505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15085	NC_020566	ATT	2	6	2550532	2550537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_020566	ATG	2	6	2550556	2550561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15087	NC_020566	T	7	7	2550586	2550592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_020566	TCTA	2	8	2550709	2550716	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15089	NC_020566	CTT	2	6	2550743	2550748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15090	NC_020566	ATT	2	6	2550757	2550762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15091	NC_020566	TA	3	6	2550764	2550769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_020566	ATG	2	6	2550785	2550790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_020566	TCA	2	6	2550822	2550827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15094	NC_020566	CATT	2	8	2550899	2550906	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15095	NC_020566	TATC	2	8	2550924	2550931	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15096	NC_020566	GAT	2	6	2550952	2550957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_020566	T	7	7	2550957	2550963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_020566	AAC	2	6	2552036	2552041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15099	NC_020566	T	6	6	2552069	2552074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_020566	GTC	2	6	2553049	2553054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15101	NC_020566	CTC	2	6	2553056	2553061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15102	NC_020566	TGA	2	6	2553064	2553069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_020566	CTA	2	6	2553073	2553078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15104	NC_020566	TTA	2	6	2553104	2553109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_020566	ATG	2	6	2553137	2553142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_020566	TCAT	2	8	2553210	2553217	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15107	NC_020566	GAT	2	6	2553226	2553231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_020566	AC	3	6	2553425	2553430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15109	NC_020566	TGA	2	6	2553474	2553479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_020566	CTT	2	6	2553533	2553538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15111	NC_020566	ATT	2	6	2553564	2553569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_020566	TTG	2	6	2553570	2553575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_020566	TCT	2	6	2553612	2553617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15114	NC_020566	CTGT	2	8	2553642	2553649	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15115	NC_020566	CTTG	2	8	2553709	2553716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15116	NC_020566	TTGA	2	8	2553811	2553818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_020566	TTG	2	6	2553822	2553827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_020566	TAA	2	6	2553846	2553851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_020566	TTTC	2	8	2553939	2553946	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15120	NC_020566	TGT	2	6	2553967	2553972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15121	NC_020566	ATTT	2	8	2554021	2554028	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15122	NC_020566	TTA	2	6	2554029	2554034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15123	NC_020566	TTA	2	6	2554066	2554071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_020566	TTA	2	6	2554187	2554192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_020566	TCA	2	6	2554193	2554198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15126	NC_020566	AC	3	6	2554199	2554204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15127	NC_020566	CAT	2	6	2554213	2554218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15128	NC_020566	TTCA	2	8	2554320	2554327	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15129	NC_020566	TAT	2	6	2556558	2556563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15130	NC_020566	CAA	2	6	2556585	2556590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15133	NC_020566	TTG	2	6	2556661	2556666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15246	NC_020566	ATTA	2	8	2576742	2576749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15253	NC_020566	ATTA	2	8	2576991	2576998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15254	NC_020566	CTT	2	6	2577002	2577007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15256	NC_020566	AG	3	6	2577025	2577030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15257	NC_020566	TTG	2	6	2577032	2577037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15258	NC_020566	TC	3	6	2577057	2577062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15391	NC_020566	TAA	2	6	2602612	2602617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15392	NC_020566	TTA	2	6	2602700	2602705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15396	NC_020566	TAA	2	6	2606227	2606232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15452	NC_020566	GCCT	2	8	2610529	2610536	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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15455	NC_020566	GTCA	2	8	2611335	2611342	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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