MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_020566	ATT	2	6	2459313	2459318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_020566	T	6	6	2459340	2459345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_020566	TCT	2	6	2459381	2459386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14504	NC_020566	CCT	2	6	2461036	2461041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14505	NC_020566	CCA	2	6	2461651	2461656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14506	NC_020566	CAT	2	6	2463009	2463014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14507	NC_020566	TATG	2	8	2463080	2463087	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14508	NC_020566	TTTG	2	8	2463107	2463114	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14509	NC_020566	ATG	2	6	2463155	2463160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_020566	TTA	2	6	2463161	2463166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14511	NC_020566	ATT	3	9	2463170	2463178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_020566	T	6	6	2463210	2463215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_020566	TAT	2	6	2463227	2463232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_020566	GTT	2	6	2463243	2463248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14515	NC_020566	A	6	6	2463256	2463261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14516	NC_020566	ATT	2	6	2463280	2463285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14517	NC_020566	TAA	2	6	2463304	2463309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_020566	TCA	2	6	2463386	2463391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14519	NC_020566	GACA	2	8	2463475	2463482	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14520	NC_020566	A	7	7	2463488	2463494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_020566	CAAC	2	8	2463495	2463502	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14522	NC_020566	GTT	2	6	2463517	2463522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_020566	TGT	3	9	2463538	2463546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_020566	TAT	2	6	2464199	2464204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_020566	AT	3	6	2464203	2464208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_020566	A	6	6	2464220	2464225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_020566	A	6	6	2464256	2464261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_020566	TAT	3	9	2464272	2464280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_020566	ATT	2	6	2464303	2464308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_020566	T	6	6	2464307	2464312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_020566	AT	3	6	2466000	2466005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_020566	AC	5	10	2466013	2466022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14533	NC_020566	AACC	2	8	2466026	2466033	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14534	NC_020566	TTGG	2	8	2466049	2466056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_020566	T	6	6	2466057	2466062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_020566	TAAC	2	8	2466084	2466091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14537	NC_020566	AGA	2	6	2466135	2466140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14539	NC_020566	ATC	2	6	2466232	2466237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14540	NC_020566	GAT	2	6	2466265	2466270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_020566	AGG	2	6	2466273	2466278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_020566	TAA	2	6	2466280	2466285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_020566	A	6	6	2467654	2467659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_020566	CAAA	2	8	2468904	2468911	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14545	NC_020566	A	6	6	2468950	2468955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_020566	TG	3	6	2468956	2468961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14547	NC_020566	TA	4	8	2468973	2468980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14548	NC_020566	TAT	2	6	2468988	2468993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14549	NC_020566	ATA	2	6	2468994	2468999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14550	NC_020566	ATT	2	6	2469032	2469037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14551	NC_020566	TAA	2	6	2469083	2469088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14552	NC_020566	CAA	2	6	2469111	2469116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14553	NC_020566	A	6	6	2469124	2469129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_020566	GCAC	2	8	2469130	2469137	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14555	NC_020566	CTC	2	6	2470725	2470730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14556	NC_020566	AT	3	6	2470736	2470741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_020566	TAT	2	6	2470748	2470753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14558	NC_020566	T	7	7	2470759	2470765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_020566	A	6	6	2470791	2470796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14560	NC_020566	A	6	6	2470857	2470862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14561	NC_020566	AAC	2	6	2470918	2470923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14562	NC_020566	TAT	2	6	2470946	2470951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14563	NC_020566	T	6	6	2472133	2472138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14564	NC_020566	TTA	2	6	2472219	2472224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_020566	TAT	2	6	2472276	2472281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14566	NC_020566	AAC	2	6	2472303	2472308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14567	NC_020566	TTAA	2	8	2472352	2472359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_020566	CTT	2	6	2472430	2472435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14571	NC_020566	TTC	2	6	2472481	2472486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14573	NC_020566	CAA	2	6	2472565	2472570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14574	NC_020566	CTT	2	6	2472584	2472589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14578	NC_020566	TAT	2	6	2472705	2472710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_020566	TCTCTT	2	12	2472716	2472727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14581	NC_020566	TCT	2	6	2472785	2472790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14582	NC_020566	ATT	2	6	2472808	2472813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14583	NC_020566	ATT	2	6	2472820	2472825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14584	NC_020566	ATT	3	9	2472850	2472858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14585	NC_020566	T	6	6	2472863	2472868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14590	NC_020566	A	6	6	2473163	2473168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14591	NC_020566	A	8	8	2473180	2473187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14592	NC_020566	AAATTT	2	12	2473193	2473204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14593	NC_020566	CAT	2	6	2473213	2473218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14595	NC_020566	GACT	2	8	2473269	2473276	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14596	NC_020566	TG	3	6	2473816	2473821	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_020566	ACT	2	6	2473832	2473837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14598	NC_020566	ATT	2	6	2473846	2473851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_020566	GCT	2	6	2473871	2473876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14600	NC_020566	ATACA	2	10	2475611	2475620	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14601	NC_020566	TA	3	6	2475643	2475648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_020566	TAT	2	6	2476435	2476440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_020566	TTTA	2	8	2476506	2476513	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_020566	AG	3	6	2476545	2476550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_020566	AGT	2	6	2476597	2476602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14607	NC_020566	GAC	2	6	2476666	2476671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14608	NC_020566	AAAT	2	8	2476673	2476680	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_020566	CGA	2	6	2478677	2478682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14610	NC_020566	GTG	2	6	2480319	2480324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_020566	ATA	2	6	2480346	2480351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_020566	AAT	2	6	2480353	2480358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14613	NC_020566	TAA	2	6	2480389	2480394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14614	NC_020566	ATT	2	6	2483010	2483015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_020566	ATT	2	6	2483023	2483028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14616	NC_020566	AAT	2	6	2483062	2483067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14617	NC_020566	T	7	7	2483067	2483073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14618	NC_020566	TAT	2	6	2483075	2483080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14619	NC_020566	TAA	2	6	2484385	2484390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14620	NC_020566	AAGC	2	8	2486117	2486124	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14621	NC_020566	AGA	2	6	2486154	2486159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14623	NC_020566	GTT	2	6	2486359	2486364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14624	NC_020566	TCA	2	6	2486365	2486370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14625	NC_020566	CTT	2	6	2486401	2486406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14626	NC_020566	TTCA	2	8	2486441	2486448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14627	NC_020566	A	6	6	2486488	2486493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14628	NC_020566	TA	3	6	2486530	2486535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14629	NC_020566	AATG	2	8	2486573	2486580	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14894	NC_020566	ATA	2	6	2514409	2514414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14895	NC_020566	TAA	2	6	2514430	2514435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14896	NC_020566	AT	3	6	2514442	2514447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14897	NC_020566	GCTA	2	8	2514460	2514467	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14898	NC_020566	ATTTTG	2	12	2514494	2514505	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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14901	NC_020566	TTAT	2	8	2514568	2514575	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14902	NC_020566	TA	4	8	2514580	2514587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14903	NC_020566	TA	4	8	2514589	2514596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14904	NC_020566	ATA	2	6	2514650	2514655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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