MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_020566	T	6	6	2379944	2379949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_020566	TCA	2	6	2379957	2379962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_020566	CAA	2	6	2380004	2380009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_020566	TG	3	6	2380028	2380033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_020566	GAA	2	6	2380091	2380096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_020566	CAT	2	6	2380109	2380114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14007	NC_020566	TA	3	6	2380141	2380146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_020566	AGA	2	6	2380150	2380155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_020566	AGT	2	6	2380168	2380173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_020566	TAA	2	6	2380205	2380210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_020566	AAACAT	2	12	2380217	2380228	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14012	NC_020566	TG	4	8	2380245	2380252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_020566	TGT	2	6	2380268	2380273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_020566	CT	3	6	2380301	2380306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14015	NC_020566	TAAA	2	8	2380321	2380328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_020566	A	6	6	2380342	2380347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_020566	ATA	2	6	2380357	2380362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_020566	TCC	2	6	2380379	2380384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14019	NC_020566	TAT	2	6	2380414	2380419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_020566	A	6	6	2380429	2380434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_020566	AAATA	2	10	2380511	2380520	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_020566	CGCT	2	8	2380533	2380540	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14023	NC_020566	TAT	2	6	2380559	2380564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_020566	TATT	2	8	2380568	2380575	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_020566	ATTA	2	8	2381860	2381867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_020566	CCT	2	6	2381868	2381873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14027	NC_020566	TGT	2	6	2381902	2381907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_020566	TAT	2	6	2381909	2381914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_020566	TCA	2	6	2381948	2381953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14030	NC_020566	AGG	2	6	2382000	2382005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_020566	ATTT	2	8	2382009	2382016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_020566	TA	3	6	2382678	2382683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_020566	CCT	2	6	2385166	2385171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14034	NC_020566	TAT	2	6	2385236	2385241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_020566	TA	3	6	2385247	2385252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_020566	CATT	2	8	2385278	2385285	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14037	NC_020566	CTATA	2	10	2385293	2385302	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14038	NC_020566	ATTA	2	8	2385318	2385325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_020566	TAG	2	6	2385751	2385756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_020566	ATCT	2	8	2385802	2385809	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14041	NC_020566	ATG	2	6	2385851	2385856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_020566	AGA	2	6	2385859	2385864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_020566	ATT	2	6	2385913	2385918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_020566	TTG	2	6	2385965	2385970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_020566	TAA	2	6	2385987	2385992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_020566	TAA	2	6	2386027	2386032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_020566	GAT	2	6	2386035	2386040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_020566	TAAT	2	8	2386054	2386061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_020566	AT	3	6	2386064	2386069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_020566	TGA	2	6	2386099	2386104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_020566	TGA	2	6	2386167	2386172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_020566	ATG	2	6	2386181	2386186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_020566	TAATA	2	10	2386188	2386197	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_020566	TGT	2	6	2386247	2386252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_020566	GTT	2	6	2386277	2386282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_020566	TTC	2	6	2386342	2386347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14057	NC_020566	GCT	2	6	2386348	2386353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14058	NC_020566	ATG	2	6	2386400	2386405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_020566	TG	3	6	2386429	2386434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_020566	TTG	2	6	2386442	2386447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_020566	ATT	2	6	2386498	2386503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_020566	T	6	6	2386607	2386612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_020566	TTG	3	9	2386647	2386655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_020566	AAT	2	6	2386661	2386666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_020566	CTA	2	6	2386692	2386697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14066	NC_020566	AAG	2	6	2386712	2386717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_020566	TGA	2	6	2386747	2386752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_020566	AAT	2	6	2386775	2386780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_020566	T	6	6	2386815	2386820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_020566	T	7	7	2386850	2386856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_020566	AGTT	2	8	2386890	2386897	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_020566	T	6	6	2386916	2386921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_020566	ATTA	2	8	2386946	2386953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_020566	TAATT	2	10	2386963	2386972	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_020566	AT	4	8	2387185	2387192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_020566	GA	4	8	2387200	2387207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_020566	CAT	2	6	2387232	2387237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14078	NC_020566	TAA	2	6	2387267	2387272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_020566	TAT	2	6	2387273	2387278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_020566	TAA	2	6	2387292	2387297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_020566	GAT	2	6	2389401	2389406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_020566	TAT	2	6	2389473	2389478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_020566	ATA	2	6	2389488	2389493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_020566	TAG	2	6	2389504	2389509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_020566	AT	3	6	2389510	2389515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_020566	ATG	2	6	2389527	2389532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_020566	TA	3	6	2389542	2389547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_020566	CAG	2	6	2389596	2389601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14089	NC_020566	AGT	2	6	2389669	2389674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_020566	AGA	2	6	2389738	2389743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_020566	TGA	2	6	2389788	2389793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_020566	TA	4	8	2389842	2389849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_020566	AC	3	6	2389962	2389967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14094	NC_020566	GT	3	6	2389993	2389998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_020566	AATT	2	8	2390006	2390013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_020566	TGA	2	6	2390089	2390094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_020566	GAAAAA	2	12	2390100	2390111	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_020566	CAT	2	6	2390142	2390147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14099	NC_020566	TGTA	2	8	2390154	2390161	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_020566	ATG	3	9	2390176	2390184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_020566	GAAA	2	8	2390192	2390199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_020566	ATAC	2	8	2390201	2390208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14103	NC_020566	ATA	2	6	2390225	2390230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_020566	CTA	2	6	2390231	2390236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14105	NC_020566	A	6	6	2390240	2390245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_020566	A	7	7	2390273	2390279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_020566	TTCAGA	2	12	2390292	2390303	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14108	NC_020566	GTTAAA	2	12	2390305	2390316	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_020566	A	6	6	2390314	2390319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_020566	GTTAAA	2	12	2390365	2390376	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_020566	A	6	6	2390374	2390379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_020566	ATG	2	6	2390387	2390392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_020566	ATG	2	6	2390410	2390415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_020566	AGA	2	6	2390479	2390484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_020566	AGC	2	6	2390492	2390497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14116	NC_020566	CTG	2	6	2390530	2390535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14117	NC_020566	GCAT	2	8	2390587	2390594	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14118	NC_020566	AAC	2	6	2390605	2390610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14119	NC_020566	GCAT	2	8	2390648	2390655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14120	NC_020566	AAC	2	6	2390666	2390671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14121	NC_020566	GCAT	2	8	2390709	2390716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14122	NC_020566	AAC	2	6	2390727	2390732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14123	NC_020566	A	6	6	2392111	2392116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_020566	AAT	2	6	2392182	2392187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_020566	TTGA	2	8	2392252	2392259	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_020566	CAA	2	6	2392314	2392319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14127	NC_020566	TTA	2	6	2392328	2392333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14128	NC_020566	AGA	2	6	2392395	2392400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14129	NC_020566	T	6	6	2392405	2392410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14130	NC_020566	T	6	6	2392425	2392430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14262	NC_020566	ATT	2	6	2416238	2416243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14263	NC_020566	CAT	2	6	2416271	2416276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14264	NC_020566	TAC	2	6	2416304	2416309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14265	NC_020566	ATC	2	6	2416316	2416321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14266	NC_020566	ATC	2	6	2416349	2416354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14267	NC_020566	AAT	2	6	2416399	2416404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14285	NC_020566	TAA	3	9	2417638	2417646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14288	NC_020566	TAAT	2	8	2417712	2417719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14291	NC_020566	ATAAA	2	10	2417855	2417864	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14292	NC_020566	A	7	7	2417862	2417868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14293	NC_020566	ATT	2	6	2417873	2417878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14384	NC_020566	TA	3	6	2433521	2433526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14385	NC_020566	TGT	2	6	2433561	2433566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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