MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_020566	ATA	2	6	2237435	2237440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_020566	TAAA	2	8	2237493	2237500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_020566	TAAA	2	8	2237502	2237509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_020566	AGT	2	6	2237564	2237569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_020566	CTT	2	6	2237625	2237630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13006	NC_020566	TGA	2	6	2237648	2237653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_020566	ACA	2	6	2237729	2237734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_020566	TAG	2	6	2237819	2237824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_020566	TAT	2	6	2237828	2237833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_020566	GAT	2	6	2237858	2237863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_020566	ATA	2	6	2237867	2237872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_020566	AAT	2	6	2237879	2237884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_020566	CTT	2	6	2237900	2237905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_020566	ATT	2	6	2237926	2237931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_020566	TTC	2	6	2237941	2237946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_020566	ATC	2	6	2237948	2237953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_020566	TAA	2	6	2238039	2238044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_020566	TTG	2	6	2238081	2238086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_020566	ATT	2	6	2238153	2238158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_020566	A	7	7	2238203	2238209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_020566	GATA	2	8	2238227	2238234	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_020566	TAAA	2	8	2238250	2238257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_020566	AGA	2	6	2238272	2238277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_020566	GAA	2	6	2238294	2238299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_020566	CATAC	2	10	2238346	2238355	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13026	NC_020566	TAG	2	6	2238357	2238362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_020566	TAT	2	6	2238480	2238485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_020566	CAA	2	6	2238498	2238503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_020566	AAG	2	6	2238508	2238513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_020566	GAC	2	6	2238544	2238549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_020566	ATC	2	6	2238577	2238582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_020566	AGG	2	6	2238627	2238632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_020566	A	6	6	2239608	2239613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_020566	AAT	2	6	2239690	2239695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_020566	AC	3	6	2239702	2239707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13036	NC_020566	A	7	7	2239714	2239720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_020566	ATA	2	6	2239730	2239735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_020566	TA	3	6	2239749	2239754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_020566	ACG	2	6	2239790	2239795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13041	NC_020566	T	6	6	2239814	2239819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_020566	AGTA	2	8	2239844	2239851	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_020566	TAA	2	6	2239895	2239900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_020566	AGCTTG	2	12	2239925	2239936	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13045	NC_020566	ACC	3	9	2239946	2239954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13046	NC_020566	CAT	2	6	2239972	2239977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_020566	TGGT	2	8	2240006	2240013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_020566	TTA	2	6	2240064	2240069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_020566	ACG	2	6	2240123	2240128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13050	NC_020566	TCC	2	6	2240166	2240171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13051	NC_020566	GTT	2	6	2240204	2240209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_020566	CCA	2	6	2240233	2240238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13053	NC_020566	T	6	6	2240250	2240255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_020566	TTC	2	6	2240330	2240335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_020566	CAG	2	6	2240345	2240350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_020566	TGAT	2	8	2240351	2240358	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_020566	ACC	2	6	2240364	2240369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13058	NC_020566	GAT	2	6	2240372	2240377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_020566	GTA	2	6	2240388	2240393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_020566	TAA	2	6	2240441	2240446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_020566	GTGTG	2	10	2240472	2240481	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_020566	AGAT	2	8	2240507	2240514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_020566	TGA	2	6	2240523	2240528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_020566	ATA	2	6	2240614	2240619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_020566	TCC	2	6	2240624	2240629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13066	NC_020566	A	6	6	2240631	2240636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_020566	GAT	2	6	2240680	2240685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_020566	ATTT	2	8	2240719	2240726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_020566	TGT	2	6	2240734	2240739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_020566	TA	3	6	2240751	2240756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_020566	TAA	2	6	2240815	2240820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_020566	CAT	2	6	2243244	2243249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_020566	TC	4	8	2244129	2244136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13074	NC_020566	TATC	2	8	2244151	2244158	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13075	NC_020566	TA	3	6	2244209	2244214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_020566	GTT	2	6	2244253	2244258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13078	NC_020566	CT	3	6	2244287	2244292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13079	NC_020566	TAA	2	6	2244312	2244317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_020566	GGT	2	6	2244341	2244346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_020566	ATA	2	6	2244363	2244368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_020566	TTCA	2	8	2244376	2244383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13083	NC_020566	A	6	6	2244436	2244441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_020566	A	6	6	2244504	2244509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_020566	GC	3	6	2244510	2244515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13086	NC_020566	CAT	2	6	2244520	2244525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13087	NC_020566	TTG	2	6	2244530	2244535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_020566	TTTA	2	8	2244553	2244560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_020566	TA	3	6	2244629	2244634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_020566	AGT	2	6	2244637	2244642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_020566	TA	3	6	2244652	2244657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_020566	CGA	2	6	2244703	2244708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13094	NC_020566	AAT	2	6	2244775	2244780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_020566	ACG	2	6	2244852	2244857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13097	NC_020566	CAA	2	6	2244899	2244904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_020566	CTT	2	6	2244914	2244919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13099	NC_020566	TAA	3	9	2244953	2244961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_020566	CCT	2	6	2245039	2245044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13101	NC_020566	TCC	2	6	2246000	2246005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13102	NC_020566	TA	3	6	2246007	2246012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_020566	CAT	2	6	2246058	2246063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_020566	ACG	3	9	2246073	2246081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_020566	TGG	2	6	2246085	2246090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_020566	TGC	2	6	2246268	2246273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13107	NC_020566	T	6	6	2246286	2246291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_020566	TGA	2	6	2246319	2246324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_020566	TCA	2	6	2246347	2246352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_020566	GTT	2	6	2246370	2246375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_020566	TG	3	6	2246390	2246395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_020566	CCT	2	6	2246467	2246472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13113	NC_020566	TAT	2	6	2246478	2246483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_020566	T	6	6	2246483	2246488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_020566	CG	3	6	2246526	2246531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13116	NC_020566	T	6	6	2246542	2246547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_020566	ACG	2	6	2246567	2246572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13119	NC_020566	AGTT	2	8	2246623	2246630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_020566	ACG	2	6	2246633	2246638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13122	NC_020566	CTT	2	6	2246737	2246742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_020566	T	6	6	2246749	2246754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_020566	TA	4	8	2246778	2246785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_020566	CT	3	6	2246858	2246863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13126	NC_020566	TTA	2	6	2246865	2246870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_020566	TTTG	2	8	2246879	2246886	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_020566	CTTTAC	2	12	2246915	2246926	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13129	NC_020566	TAT	2	6	2246997	2247002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_020566	ATT	2	6	2247012	2247017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13131	NC_020566	TTC	2	6	2247033	2247038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13132	NC_020566	ATTC	2	8	2247103	2247110	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13133	NC_020566	AATT	2	8	2247338	2247345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13134	NC_020566	ATCT	2	8	2247365	2247372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13135	NC_020566	CCT	2	6	2248078	2248083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13143	NC_020566	ACC	2	6	2249686	2249691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13144	NC_020566	ATTTC	2	10	2249814	2249823	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13145	NC_020566	CCT	2	6	2249828	2249833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13146	NC_020566	ATT	2	6	2249836	2249841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13162	NC_020566	CCT	2	6	2251490	2251495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13169	NC_020566	TTG	2	6	2251907	2251912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13172	NC_020566	AGCT	2	8	2251940	2251947	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13251	NC_020566	T	6	6	2256742	2256747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13252	NC_020566	TTC	2	6	2256799	2256804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13255	NC_020566	CTT	2	6	2257573	2257578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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