MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020566	AATA	2	8	2157997	2158004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_020566	TTAA	2	8	2158901	2158908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_020566	ATT	2	6	2158917	2158922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_020566	TTA	2	6	2158925	2158930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_020566	TAACA	2	10	2159774	2159783	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12506	NC_020566	TAAA	3	12	2159804	2159815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_020566	A	6	6	2159874	2159879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_020566	TTTAAT	2	12	2159920	2159931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_020566	TGAT	2	8	2159935	2159942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_020566	A	6	6	2159946	2159951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_020566	ATA	2	6	2161843	2161848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_020566	TAT	2	6	2161864	2161869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_020566	T	6	6	2161949	2161954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_020566	TTA	2	6	2161975	2161980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_020566	TAA	2	6	2162014	2162019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_020566	CCG	2	6	2162051	2162056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12517	NC_020566	TCC	2	6	2162073	2162078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12518	NC_020566	AT	3	6	2162093	2162098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_020566	AT	3	6	2162120	2162125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_020566	CAAATA	2	12	2162140	2162151	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12521	NC_020566	ATT	2	6	2162208	2162213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_020566	GTT	2	6	2162224	2162229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_020566	T	7	7	2162278	2162284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_020566	TGA	2	6	2162319	2162324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_020566	TTTA	2	8	2162328	2162335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_020566	ATTT	2	8	2162346	2162353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_020566	TA	4	8	2162406	2162413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_020566	AT	3	6	2162419	2162424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_020566	A	6	6	2162426	2162431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_020566	TAAA	2	8	2163986	2163993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_020566	ATT	2	6	2166168	2166173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_020566	TAAATG	2	12	2166194	2166205	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_020566	GTG	2	6	2166257	2166262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_020566	ATT	2	6	2166393	2166398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_020566	AGT	2	6	2166432	2166437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_020566	GAA	3	9	2166514	2166522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_020566	ATCGT	2	10	2166530	2166539	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12538	NC_020566	AGA	2	6	2166555	2166560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_020566	GAG	2	6	2166577	2166582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_020566	TTTG	2	8	2167711	2167718	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_020566	AAG	2	6	2167723	2167728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_020566	TAA	2	6	2167756	2167761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_020566	GTA	2	6	2167763	2167768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_020566	A	6	6	2167805	2167810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_020566	TATG	2	8	2167843	2167850	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_020566	TAA	2	6	2167869	2167874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_020566	TCC	2	6	2175472	2175477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12548	NC_020566	ATT	2	6	2175484	2175489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_020566	AGT	2	6	2175530	2175535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_020566	AATTAA	2	12	2175571	2175582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_020566	ATC	2	6	2175587	2175592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12552	NC_020566	TA	3	6	2175595	2175600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_020566	ATT	2	6	2175681	2175686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_020566	A	7	7	2175698	2175704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_020566	TCC	2	6	2178874	2178879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12556	NC_020566	ATA	2	6	2178895	2178900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_020566	AT	3	6	2178939	2178944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_020566	A	6	6	2178953	2178958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_020566	ACT	2	6	2178977	2178982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12560	NC_020566	A	7	7	2179003	2179009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_020566	AAT	2	6	2179996	2180001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_020566	TTA	2	6	2180052	2180057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_020566	A	8	8	2180064	2180071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_020566	AGT	2	6	2180097	2180102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_020566	AT	3	6	2180253	2180258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_020566	TGG	2	6	2180262	2180267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_020566	G	6	6	2180269	2180274	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_020566	CCG	2	6	2180315	2180320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12569	NC_020566	TAA	2	6	2180363	2180368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_020566	TGG	2	6	2180375	2180380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_020566	CCG	2	6	2180398	2180403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12572	NC_020566	AAT	2	6	2180453	2180458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_020566	CCG	2	6	2180487	2180492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12574	NC_020566	CCT	2	6	2180709	2180714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12575	NC_020566	AGTA	2	8	2180765	2180772	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_020566	ATTT	2	8	2180796	2180803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_020566	TCGA	2	8	2180815	2180822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12578	NC_020566	TCA	2	6	2180877	2180882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12580	NC_020566	CA	3	6	2180968	2180973	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12581	NC_020566	CTC	2	6	2181054	2181059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12583	NC_020566	ACG	2	6	2181103	2181108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12584	NC_020566	ACC	2	6	2181298	2181303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12585	NC_020566	ATGA	2	8	2181380	2181387	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12588	NC_020566	GTG	2	6	2181490	2181495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12589	NC_020566	GTA	2	6	2181522	2181527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_020566	CCA	2	6	2181530	2181535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12591	NC_020566	CCTA	2	8	2181574	2181581	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12592	NC_020566	TC	3	6	2181694	2181699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12593	NC_020566	GCC	2	6	2181791	2181796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12594	NC_020566	CTC	2	6	2181839	2181844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12595	NC_020566	TCGC	2	8	2182028	2182035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12596	NC_020566	TCTA	2	8	2182094	2182101	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12597	NC_020566	TCT	2	6	2182147	2182152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12598	NC_020566	CAATC	2	10	2182220	2182229	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12599	NC_020566	C	6	6	2182255	2182260	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12600	NC_020566	GGT	2	6	2182280	2182285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_020566	ATG	2	6	2182600	2182605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_020566	GCT	2	6	2182606	2182611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12603	NC_020566	AT	3	6	2182665	2182670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_020566	TGG	2	6	2182685	2182690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_020566	AATT	2	8	2182750	2182757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_020566	AAT	2	6	2182826	2182831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_020566	GA	3	6	2182864	2182869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_020566	TCGGT	2	10	2182941	2182950	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12609	NC_020566	ACT	2	6	2183146	2183151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12610	NC_020566	AG	3	6	2183241	2183246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_020566	TCC	2	6	2183267	2183272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12612	NC_020566	CGT	2	6	2183300	2183305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12613	NC_020566	AG	3	6	2183322	2183327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_020566	ACA	2	6	2183328	2183333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12615	NC_020566	ATT	2	6	2183348	2183353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_020566	CTT	2	6	2183356	2183361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12617	NC_020566	GAT	2	6	2183377	2183382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_020566	GTC	2	6	2183392	2183397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12619	NC_020566	CAA	2	6	2183431	2183436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12620	NC_020566	TTG	2	6	2183443	2183448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_020566	TCGC	2	8	2183467	2183474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12622	NC_020566	CTA	2	6	2183477	2183482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12623	NC_020566	TCC	2	6	2183506	2183511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12624	NC_020566	CTTA	2	8	2183629	2183636	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12625	NC_020566	TCG	2	6	2183654	2183659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12626	NC_020566	TAA	2	6	2183712	2183717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12627	NC_020566	CCA	2	6	2183732	2183737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12628	NC_020566	TTA	2	6	2183797	2183802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12630	NC_020566	TACT	2	8	2183905	2183912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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