MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_020566	A	6	6	2087672	2087677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12002	NC_020566	T	6	6	2087678	2087683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_020566	CAA	2	6	2087712	2087717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12004	NC_020566	TAC	2	6	2087754	2087759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12005	NC_020566	TA	3	6	2087777	2087782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_020566	ACT	2	6	2087792	2087797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12007	NC_020566	TA	3	6	2087801	2087806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12008	NC_020566	GT	3	6	2087809	2087814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_020566	AAAAAG	2	12	2087861	2087872	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12010	NC_020566	AC	3	6	2087887	2087892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12011	NC_020566	ACC	2	6	2087896	2087901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12012	NC_020566	TCT	2	6	2087902	2087907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12013	NC_020566	TA	3	6	2091980	2091985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12014	NC_020566	CGT	2	6	2091995	2092000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12015	NC_020566	AT	3	6	2092015	2092020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12016	NC_020566	ATA	2	6	2092033	2092038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12017	NC_020566	TA	3	6	2092095	2092100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12018	NC_020566	A	6	6	2092131	2092136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12019	NC_020566	ATC	2	6	2092140	2092145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12020	NC_020566	CGA	2	6	2092154	2092159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12021	NC_020566	GT	3	6	2092171	2092176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12022	NC_020566	ATT	2	6	2092195	2092200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12023	NC_020566	ACTT	2	8	2092211	2092218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12024	NC_020566	TAA	2	6	2092240	2092245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12025	NC_020566	T	7	7	2092264	2092270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12026	NC_020566	ATG	2	6	2092285	2092290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12027	NC_020566	ATT	2	6	2092332	2092337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12028	NC_020566	TAC	2	6	2092391	2092396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12029	NC_020566	ATTT	2	8	2092416	2092423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12031	NC_020566	TAT	2	6	2092554	2092559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12032	NC_020566	TGA	2	6	2092573	2092578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12033	NC_020566	ACTT	2	8	2092614	2092621	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12034	NC_020566	TTC	2	6	2092623	2092628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12036	NC_020566	TAA	2	6	2092712	2092717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12037	NC_020566	ATA	2	6	2092761	2092766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12038	NC_020566	TGT	2	6	2092779	2092784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12039	NC_020566	TAA	2	6	2092787	2092792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12040	NC_020566	CAT	2	6	2092846	2092851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12041	NC_020566	TCT	2	6	2092863	2092868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12043	NC_020566	TACTA	2	10	2093003	2093012	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12044	NC_020566	GT	3	6	2093042	2093047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12045	NC_020566	GTA	2	6	2095312	2095317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12047	NC_020566	GTT	2	6	2095340	2095345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12049	NC_020566	GTCAT	2	10	2095401	2095410	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12050	NC_020566	ATG	2	6	2095456	2095461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12051	NC_020566	ATG	2	6	2095556	2095561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12052	NC_020566	ATG	2	6	2095656	2095661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12053	NC_020566	TAT	2	6	2095681	2095686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12054	NC_020566	ATGCC	2	10	2095704	2095713	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12055	NC_020566	TGT	2	6	2095731	2095736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12056	NC_020566	TAT	2	6	2095754	2095759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12057	NC_020566	TGA	2	6	2095839	2095844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12058	NC_020566	GAA	2	6	2095872	2095877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12059	NC_020566	TTA	2	6	2095889	2095894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12060	NC_020566	ATT	2	6	2095926	2095931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12062	NC_020566	ATC	2	6	2095971	2095976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12063	NC_020566	CTG	2	6	2095980	2095985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12065	NC_020566	ATT	2	6	2096093	2096098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12071	NC_020566	A	7	7	2100023	2100029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12072	NC_020566	AGT	2	6	2100046	2100051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12076	NC_020566	TAT	3	9	2100250	2100258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12094	NC_020566	ATT	2	6	2101544	2101549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12098	NC_020566	TTTA	2	8	2101856	2101863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12099	NC_020566	GT	3	6	2101871	2101876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12100	NC_020566	CCT	2	6	2101883	2101888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12101	NC_020566	TA	3	6	2101938	2101943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12103	NC_020566	T	8	8	2102549	2102556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12104	NC_020566	TTTTA	2	10	2102558	2102567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12105	NC_020566	CAAG	2	8	2102600	2102607	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12108	NC_020566	TAAT	2	8	2102811	2102818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12109	NC_020566	CA	3	6	2102893	2102898	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12110	NC_020566	CTT	2	6	2102907	2102912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12112	NC_020566	TAA	2	6	2102935	2102940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12113	NC_020566	CTGT	2	8	2102947	2102954	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12114	NC_020566	TCC	2	6	2103009	2103014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12115	NC_020566	TCC	2	6	2104306	2104311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12116	NC_020566	ATT	2	6	2104351	2104356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12117	NC_020566	ATT	2	6	2104364	2104369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12118	NC_020566	TTATT	2	10	2104410	2104419	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12119	NC_020566	TAA	2	6	2104482	2104487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12123	NC_020566	A	6	6	2104539	2104544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12124	NC_020566	ATCTA	2	10	2104548	2104557	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12125	NC_020566	ATTG	2	8	2104558	2104565	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12128	NC_020566	AAT	2	6	2104692	2104697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12129	NC_020566	TA	3	6	2104745	2104750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12130	NC_020566	A	6	6	2104795	2104800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12131	NC_020566	A	6	6	2104814	2104819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12132	NC_020566	GTG	2	6	2104840	2104845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12133	NC_020566	A	6	6	2104883	2104888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12134	NC_020566	AGT	2	6	2104952	2104957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12138	NC_020566	A	6	6	2105159	2105164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12139	NC_020566	TTTA	2	8	2105197	2105204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12140	NC_020566	CT	4	8	2105240	2105247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12148	NC_020566	TCC	2	6	2107049	2107054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12149	NC_020566	CAC	2	6	2107935	2107940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12153	NC_020566	A	7	7	2110598	2110604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12164	NC_020566	ATT	2	6	2110990	2110995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12203	NC_020566	ATT	2	6	2122073	2122078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12221	NC_020566	AACT	2	8	2124110	2124117	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12255	NC_020566	TCA	2	6	2129469	2129474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12256	NC_020566	AACAT	2	10	2129493	2129502	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12257	NC_020566	AAGC	2	8	2129505	2129512	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12258	NC_020566	GTT	2	6	2129521	2129526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12260	NC_020566	TTAC	2	8	2129559	2129566	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12387	NC_020566	CTA	2	6	2144444	2144449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12393	NC_020566	TAA	2	6	2145799	2145804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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