MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020566	TTTTC	2	10	2014385	2014394	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11502	NC_020566	TGA	2	6	2014451	2014456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_020566	TCT	2	6	2014477	2014482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_020566	TTTC	2	8	2014499	2014506	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11505	NC_020566	T	6	6	2014511	2014516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_020566	TG	3	6	2014529	2014534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_020566	TTC	2	6	2014537	2014542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_020566	TCAT	2	8	2014552	2014559	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11509	NC_020566	TTTTC	2	10	2014562	2014571	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11510	NC_020566	ATC	2	6	2014584	2014589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_020566	CAA	2	6	2014614	2014619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_020566	AT	3	6	2014645	2014650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_020566	GCTTT	2	10	2014671	2014680	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11514	NC_020566	GT	3	6	2016067	2016072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_020566	T	6	6	2016106	2016111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_020566	GTT	2	6	2016154	2016159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_020566	AT	3	6	2016167	2016172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_020566	GTTG	2	8	2016191	2016198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_020566	TGT	2	6	2016261	2016266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_020566	T	6	6	2016280	2016285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_020566	AAT	2	6	2016286	2016291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_020566	CCT	2	6	2018302	2018307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11523	NC_020566	GTT	2	6	2018336	2018341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_020566	ATT	2	6	2018351	2018356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_020566	AGTTTG	2	12	2018360	2018371	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_020566	TGA	2	6	2018379	2018384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_020566	TTG	2	6	2018388	2018393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_020566	GTT	2	6	2018398	2018403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_020566	GTT	2	6	2018405	2018410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_020566	TTC	2	6	2018412	2018417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11531	NC_020566	CTA	2	6	2018443	2018448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11532	NC_020566	ACT	2	6	2018574	2018579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_020566	GC	3	6	2018671	2018676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11534	NC_020566	CTA	2	6	2018707	2018712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_020566	CCT	2	6	2019361	2019366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11536	NC_020566	TAA	2	6	2019514	2019519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_020566	CCT	2	6	2019574	2019579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11538	NC_020566	GATT	2	8	2019648	2019655	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_020566	TCT	2	6	2019720	2019725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11540	NC_020566	CTT	3	9	2019758	2019766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_020566	AAATC	2	10	2019780	2019789	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11542	NC_020566	ATTA	2	8	2019797	2019804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_020566	ACAT	2	8	2019812	2019819	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11544	NC_020566	TCC	2	6	2019846	2019851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11545	NC_020566	CAA	2	6	2019912	2019917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_020566	T	7	7	2019925	2019931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_020566	GTA	2	6	2019954	2019959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_020566	ATA	2	6	2020052	2020057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_020566	CTA	2	6	2020061	2020066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11550	NC_020566	TCC	2	6	2020098	2020103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11551	NC_020566	T	6	6	2020112	2020117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_020566	AAT	2	6	2020177	2020182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_020566	TTC	2	6	2020313	2020318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_020566	TGG	2	6	2020343	2020348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_020566	CTTTC	2	10	2020373	2020382	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11556	NC_020566	TGT	2	6	2020391	2020396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_020566	CGA	2	6	2020433	2020438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_020566	TGT	2	6	2020485	2020490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_020566	CTA	2	6	2020514	2020519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_020566	TGA	2	6	2020581	2020586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_020566	GTT	2	6	2020592	2020597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_020566	TCC	2	6	2020621	2020626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11563	NC_020566	A	6	6	2020629	2020634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_020566	ACC	2	6	2020716	2020721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11565	NC_020566	ACT	2	6	2020759	2020764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_020566	TGA	2	6	2020829	2020834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_020566	TTG	2	6	2020861	2020866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_020566	T	6	6	2020870	2020875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_020566	CTCAT	2	10	2020885	2020894	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11570	NC_020566	T	7	7	2020898	2020904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_020566	TGT	2	6	2020963	2020968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_020566	CTT	2	6	2021649	2021654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11573	NC_020566	AAC	2	6	2021656	2021661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11574	NC_020566	GTT	3	9	2021688	2021696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_020566	ATTT	2	8	2021741	2021748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_020566	CTTT	2	8	2021749	2021756	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11577	NC_020566	CCT	2	6	2021790	2021795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11578	NC_020566	TGTT	2	8	2021803	2021810	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_020566	TTA	2	6	2021825	2021830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_020566	TTG	2	6	2021839	2021844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_020566	CCA	2	6	2021850	2021855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11582	NC_020566	GAA	2	6	2021864	2021869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_020566	A	6	6	2021930	2021935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_020566	T	6	6	2021952	2021957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_020566	T	6	6	2021959	2021964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_020566	ATTT	2	8	2021965	2021972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_020566	TTAA	2	8	2021998	2022005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_020566	AAACT	2	10	2022044	2022053	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11589	NC_020566	ACC	2	6	2022114	2022119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11590	NC_020566	TCAT	2	8	2022142	2022149	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11591	NC_020566	A	6	6	2022273	2022278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_020566	TTAAA	2	10	2022318	2022327	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_020566	ATTT	2	8	2022348	2022355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_020566	TAGT	2	8	2022390	2022397	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_020566	AATTT	2	10	2024093	2024102	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_020566	TAT	2	6	2024105	2024110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_020566	TCT	2	6	2024129	2024134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_020566	TTG	2	6	2024188	2024193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_020566	ACACG	2	10	2024196	2024205	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11600	NC_020566	CTT	2	6	2024211	2024216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11601	NC_020566	CAT	2	6	2024241	2024246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11602	NC_020566	GTT	2	6	2024333	2024338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_020566	TGTTCT	2	12	2024339	2024350	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11604	NC_020566	T	6	6	2024350	2024355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_020566	AAT	2	6	2024359	2024364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_020566	TCC	2	6	2024398	2024403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11607	NC_020566	A	6	6	2024406	2024411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_020566	ACAT	2	8	2024446	2024453	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11609	NC_020566	TAA	2	6	2024457	2024462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_020566	TTAA	2	8	2024496	2024503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_020566	ATAAA	2	10	2024529	2024538	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_020566	GGA	2	6	2024555	2024560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_020566	A	6	6	2025313	2025318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_020566	CA	3	6	2025324	2025329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11615	NC_020566	TAA	2	6	2026587	2026592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_020566	AATATT	2	12	2026634	2026645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_020566	AAG	2	6	2026722	2026727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_020566	AAT	2	6	2026732	2026737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_020566	AT	3	6	2027369	2027374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_020566	GTA	2	6	2027423	2027428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_020566	GCT	2	6	2027446	2027451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11622	NC_020566	ACT	2	6	2027606	2027611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11623	NC_020566	T	6	6	2027663	2027668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_020566	TA	4	8	2027695	2027702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_020566	ATA	2	6	2028524	2028529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_020566	GA	3	6	2028563	2028568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11627	NC_020566	T	7	7	2028590	2028596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_020566	ATA	2	6	2028597	2028602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11629	NC_020566	ATGA	2	8	2028638	2028645	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11631	NC_020566	T	6	6	2028668	2028673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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