MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_020566	AT	3	6	1836216	1836221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_020566	TAAT	2	8	1836252	1836259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_020566	TTAAA	2	10	1836592	1836601	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_020566	TCG	2	6	1836615	1836620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_020566	CTT	2	6	1836621	1836626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_020566	CT	3	6	1836675	1836680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10007	NC_020566	TAG	2	6	1836702	1836707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_020566	CTGA	2	8	1836709	1836716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10009	NC_020566	TTCATT	2	12	1836755	1836766	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10010	NC_020566	TTA	2	6	1836777	1836782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_020566	CTT	2	6	1836838	1836843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_020566	AGA	2	6	1836868	1836873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_020566	TA	3	6	1836881	1836886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_020566	T	6	6	1836890	1836895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_020566	TGT	2	6	1836897	1836902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_020566	TTC	2	6	1836924	1836929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_020566	T	6	6	1839001	1839006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_020566	TTG	2	6	1839019	1839024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_020566	GTT	2	6	1839030	1839035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_020566	TCC	2	6	1839057	1839062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10021	NC_020566	TAT	2	6	1839102	1839107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_020566	TGG	3	9	1839146	1839154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_020566	TGT	2	6	1839204	1839209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_020566	ATG	2	6	1839246	1839251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_020566	GTT	2	6	1839259	1839264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_020566	CATA	2	8	1839269	1839276	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10027	NC_020566	CAA	2	6	1839289	1839294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_020566	AATC	2	8	1839308	1839315	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10029	NC_020566	AAT	2	6	1839340	1839345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_020566	AT	3	6	1839349	1839354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_020566	TAA	2	6	1839355	1839360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_020566	GTTA	2	8	1839363	1839370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_020566	ATT	2	6	1839411	1839416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_020566	GA	3	6	1839453	1839458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_020566	TTA	2	6	1839497	1839502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_020566	AAT	2	6	1839571	1839576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_020566	ATA	2	6	1839609	1839614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_020566	TTC	2	6	1839764	1839769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_020566	TCT	2	6	1839789	1839794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_020566	CCA	2	6	1839834	1839839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_020566	TTA	2	6	1839843	1839848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_020566	TCA	2	6	1839876	1839881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_020566	CCAT	2	8	1839958	1839965	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10044	NC_020566	ATTTGT	2	12	1839989	1840000	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_020566	TGTT	2	8	1840031	1840038	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_020566	TTG	2	6	1840054	1840059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_020566	TGC	2	6	1840094	1840099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_020566	TGA	2	6	1840108	1840113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_020566	CTC	2	6	1840137	1840142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10050	NC_020566	AGGTT	2	10	1840163	1840172	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_020566	T	6	6	1840185	1840190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_020566	AATA	2	8	1840202	1840209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_020566	TTG	2	6	1840231	1840236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_020566	TGT	2	6	1840241	1840246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_020566	ATGG	2	8	1840274	1840281	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_020566	T	7	7	1841050	1841056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_020566	ATT	2	6	1841088	1841093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_020566	A	6	6	1842718	1842723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_020566	GAAT	2	8	1842734	1842741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_020566	TGA	2	6	1842742	1842747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_020566	CCT	2	6	1843465	1843470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10062	NC_020566	ATTT	2	8	1843476	1843483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_020566	TA	3	6	1843515	1843520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_020566	TAAA	2	8	1843526	1843533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_020566	ATTA	2	8	1843537	1843544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_020566	ATTA	2	8	1843548	1843555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_020566	TTA	2	6	1843561	1843566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_020566	TTA	2	6	1843572	1843577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_020566	AAT	2	6	1843578	1843583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_020566	ATTT	2	8	1843601	1843608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_020566	ATT	2	6	1843657	1843662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_020566	ATTA	2	8	1843675	1843682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_020566	AT	3	6	1843728	1843733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_020566	TAT	2	6	1843776	1843781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_020566	ATT	2	6	1843799	1843804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_020566	TAT	2	6	1843820	1843825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_020566	TCAA	2	8	1843842	1843849	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10078	NC_020566	ATGT	2	8	1843856	1843863	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_020566	ATT	2	6	1843897	1843902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_020566	GAT	2	6	1843906	1843911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_020566	T	7	7	1843924	1843930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_020566	AGT	2	6	1843980	1843985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_020566	GTT	2	6	1844026	1844031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_020566	ATA	2	6	1844035	1844040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_020566	T	6	6	1844074	1844079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_020566	ATT	2	6	1844142	1844147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_020566	ATTA	2	8	1844165	1844172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_020566	TCA	2	6	1844223	1844228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10091	NC_020566	T	6	6	1844306	1844311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_020566	ATAG	2	8	1844317	1844324	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_020566	A	7	7	1844361	1844367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_020566	A	7	7	1844398	1844404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_020566	TAA	2	6	1845034	1845039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_020566	ACC	2	6	1845057	1845062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10097	NC_020566	ATA	2	6	1845069	1845074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_020566	A	7	7	1845112	1845118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_020566	A	6	6	1845154	1845159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_020566	GCTT	2	8	1845181	1845188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10101	NC_020566	GAC	2	6	1845190	1845195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_020566	GTC	2	6	1845208	1845213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_020566	TA	3	6	1845227	1845232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_020566	ATTCAA	2	12	1845279	1845290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10105	NC_020566	TAAA	2	8	1845317	1845324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_020566	TTAA	2	8	1845333	1845340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_020566	CTG	2	6	1845370	1845375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_020566	ATT	2	6	1845388	1845393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_020566	TCC	2	6	1845420	1845425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10110	NC_020566	TTA	2	6	1845499	1845504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_020566	ATA	3	9	1845541	1845549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_020566	ACA	2	6	1845700	1845705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_020566	AT	3	6	1845731	1845736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_020566	ATT	2	6	1845752	1845757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_020566	AAT	2	6	1845758	1845763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_020566	TAAA	2	8	1845781	1845788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_020566	TAA	2	6	1845790	1845795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_020566	AAT	2	6	1845842	1845847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_020566	TAC	2	6	1845879	1845884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10120	NC_020566	ATA	2	6	1845896	1845901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_020566	ATT	2	6	1845976	1845981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_020566	ACA	2	6	1846015	1846020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_020566	TAACA	2	10	1846052	1846061	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10124	NC_020566	T	6	6	1846097	1846102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_020566	TAA	2	6	1846196	1846201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_020566	AT	3	6	1846228	1846233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_020566	AT	3	6	1846303	1846308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_020566	ATT	2	6	1846337	1846342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_020566	ATA	2	6	1846378	1846383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10131	NC_020566	ATA	2	6	1847241	1847246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10258	NC_020566	AT	3	6	1857375	1857380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10259	NC_020566	TAT	2	6	1858943	1858948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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