MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_020566	C	6	6	1414042	1414047	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8002	NC_020566	TGA	2	6	1414058	1414063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_020566	TAA	2	6	1414194	1414199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_020566	GCTG	2	8	1414202	1414209	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8005	NC_020566	ATC	2	6	1414213	1414218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_020566	TTGTG	2	10	1414278	1414287	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_020566	GATATA	2	12	1414301	1414312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_020566	TCC	2	6	1414327	1414332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8009	NC_020566	TTTC	2	8	1414361	1414368	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8010	NC_020566	ATG	2	6	1414395	1414400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_020566	ATTG	2	8	1414448	1414455	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_020566	ATC	2	6	1414473	1414478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_020566	TTA	2	6	1414532	1414537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_020566	TGAA	2	8	1414622	1414629	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_020566	TTAT	2	8	1414712	1414719	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_020566	AGG	2	6	1414755	1414760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_020566	TAC	2	6	1415482	1415487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_020566	ATTT	2	8	1415538	1415545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_020566	CGT	2	6	1415546	1415551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_020566	TTG	2	6	1415600	1415605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_020566	ATT	2	6	1415627	1415632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_020566	A	6	6	1415683	1415688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_020566	ACT	2	6	1415719	1415724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_020566	GAT	2	6	1415776	1415781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_020566	T	7	7	1415781	1415787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_020566	TAC	2	6	1415804	1415809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_020566	ATC	2	6	1415820	1415825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_020566	T	6	6	1415877	1415882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_020566	TAT	2	6	1415954	1415959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_020566	AAAT	2	8	1415965	1415972	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_020566	TGC	2	6	1415978	1415983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_020566	AGA	2	6	1416029	1416034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_020566	AGC	2	6	1416037	1416042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_020566	TATACA	2	12	1416045	1416056	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8035	NC_020566	TAT	2	6	1416151	1416156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_020566	TAT	2	6	1416265	1416270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_020566	GA	3	6	1416287	1416292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_020566	ACAAA	2	10	1416293	1416302	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8039	NC_020566	ATTA	2	8	1416338	1416345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_020566	AATA	2	8	1416351	1416358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_020566	TGATG	2	10	1416373	1416382	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_020566	CTC	2	6	1416393	1416398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8043	NC_020566	TTG	2	6	1448314	1448319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_020566	TGT	2	6	1448329	1448334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_020566	CATTC	2	10	1448379	1448388	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8046	NC_020566	ATTT	2	8	1448479	1448486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_020566	ATA	2	6	1448499	1448504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_020566	AT	3	6	1448512	1448517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_020566	TAA	2	6	1448548	1448553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_020566	TAAA	2	8	1448557	1448564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_020566	TAA	2	6	1448579	1448584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_020566	A	6	6	1448583	1448588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_020566	AAT	2	6	1448610	1448615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_020566	ATT	2	6	1452717	1452722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_020566	ATT	2	6	1453881	1453886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_020566	ATTA	3	12	1453917	1453928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_020566	TAA	2	6	1453952	1453957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_020566	AT	3	6	1453965	1453970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_020566	TATTCT	2	12	1453971	1453982	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8060	NC_020566	TATT	2	8	1454010	1454017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_020566	TAAT	2	8	1454068	1454075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_020566	T	6	6	1454084	1454089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_020566	TAA	2	6	1454094	1454099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_020566	ATTT	2	8	1454133	1454140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_020566	TATC	2	8	1454185	1454192	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8066	NC_020566	TTAT	2	8	1454203	1454210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_020566	CTT	2	6	1455209	1455214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_020566	GTTC	2	8	1458674	1458681	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8069	NC_020566	TGCT	2	8	1458691	1458698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8070	NC_020566	TAT	2	6	1458764	1458769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_020566	GCT	2	6	1458787	1458792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_020566	AAT	2	6	1458807	1458812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_020566	TTC	2	6	1458818	1458823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_020566	ATC	2	6	1458865	1458870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_020566	AAAT	2	8	1458887	1458894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_020566	CA	3	6	1458911	1458916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8077	NC_020566	GGGA	2	8	1458950	1458957	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_020566	TC	3	6	1460347	1460352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8079	NC_020566	TAA	2	6	1460375	1460380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_020566	T	6	6	1460420	1460425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8082	NC_020566	AAG	2	6	1460459	1460464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_020566	CTT	2	6	1460474	1460479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_020566	T	6	6	1460500	1460505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_020566	TCA	2	6	1460533	1460538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_020566	TCA	2	6	1460556	1460561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8087	NC_020566	CAT	2	6	1460596	1460601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_020566	T	6	6	1460630	1460635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_020566	T	6	6	1460749	1460754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_020566	A	6	6	1460761	1460766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_020566	AAC	2	6	1460795	1460800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_020566	T	7	7	1460827	1460833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_020566	CTC	2	6	1460847	1460852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8094	NC_020566	TAT	2	6	1460870	1460875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_020566	ATT	2	6	1460888	1460893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_020566	T	6	6	1462112	1462117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_020566	CAA	2	6	1462127	1462132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_020566	A	6	6	1462232	1462237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_020566	CAT	2	6	1462244	1462249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8101	NC_020566	TGTTC	2	10	1462289	1462298	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8102	NC_020566	TCA	2	6	1462307	1462312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_020566	GT	3	6	1462376	1462381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_020566	TCA	2	6	1462575	1462580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_020566	ATC	2	6	1462596	1462601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_020566	TG	3	6	1462608	1462613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_020566	TA	3	6	1462630	1462635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_020566	ATT	2	6	1462682	1462687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_020566	ATT	2	6	1462718	1462723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_020566	ATT	2	6	1462773	1462778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_020566	TGT	3	9	1462791	1462799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_020566	ATT	2	6	1462800	1462805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_020566	GAA	2	6	1462807	1462812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_020566	TTC	2	6	1462860	1462865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_020566	T	6	6	1462872	1462877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_020566	TCT	2	6	1462891	1462896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8117	NC_020566	ATT	2	6	1462914	1462919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_020566	T	6	6	1462931	1462936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_020566	AAT	2	6	1462947	1462952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_020566	CTT	2	6	1462973	1462978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_020566	T	6	6	1463003	1463008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_020566	T	6	6	1463063	1463068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_020566	AT	3	6	1463668	1463673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8126	NC_020566	TTG	3	9	1463903	1463911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_020566	TGT	2	6	1463941	1463946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_020566	CAT	2	6	1463974	1463979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_020566	CCT	2	6	1463991	1463996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8130	NC_020566	T	6	6	1464000	1464005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_020566	TA	3	6	1464047	1464052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8401	NC_020566	GATT	2	8	1522663	1522670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8402	NC_020566	T	7	7	1522705	1522711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8424	NC_020566	CAT	2	6	1527336	1527341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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