MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_020564	TTA	2	6	2537130	2537135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_020564	TCAAAA	2	12	2537143	2537154	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15003	NC_020564	A	6	6	2537151	2537156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_020564	CTT	2	6	2537196	2537201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15005	NC_020564	TCC	2	6	2537812	2537817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15006	NC_020564	TA	3	6	2538798	2538803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_020564	TTG	2	6	2538912	2538917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_020564	TTTGAC	2	12	2538998	2539009	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15009	NC_020564	AT	3	6	2539030	2539035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_020564	ATC	2	6	2539044	2539049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15011	NC_020564	ACA	2	6	2539096	2539101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15012	NC_020564	TGC	2	6	2539109	2539114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15013	NC_020564	TAT	2	6	2539166	2539171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_020564	TCT	2	6	2539225	2539230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15015	NC_020564	ATTC	2	8	2539263	2539270	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15016	NC_020564	TTCG	2	8	2539294	2539301	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15017	NC_020564	ATC	2	6	2539308	2539313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15018	NC_020564	ATTT	2	8	2539326	2539333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_020564	TA	3	6	2539350	2539355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_020564	TAA	2	6	2539411	2539416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_020564	GTC	2	6	2539441	2539446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15022	NC_020564	AATAG	2	10	2539485	2539494	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_020564	TGA	3	9	2539580	2539588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_020564	AAT	2	6	2539590	2539595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_020564	ATA	2	6	2539627	2539632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_020564	TGA	2	6	2539664	2539669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_020564	TGG	2	6	2539673	2539678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_020564	A	6	6	2539692	2539697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_020564	GTT	2	6	2539710	2539715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_020564	ATT	2	6	2539743	2539748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_020564	AGA	2	6	2539784	2539789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_020564	TAAA	2	8	2539815	2539822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_020564	T	6	6	2539851	2539856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_020564	TTTTC	2	10	2539925	2539934	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15035	NC_020564	TTA	2	6	2540806	2540811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_020564	T	6	6	2540818	2540823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_020564	T	7	7	2540862	2540868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_020564	TA	3	6	2540888	2540893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_020564	AC	3	6	2541713	2541718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15040	NC_020564	AT	3	6	2541748	2541753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_020564	TTTAT	2	10	2542934	2542943	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_020564	ATT	2	6	2542985	2542990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_020564	AT	3	6	2543007	2543012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_020564	TGA	2	6	2543020	2543025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_020564	TGA	2	6	2543081	2543086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15046	NC_020564	AT	3	6	2544007	2544012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_020564	AT	3	6	2544084	2544089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_020564	A	6	6	2544149	2544154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_020564	TAA	2	6	2544182	2544187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_020564	A	6	6	2545593	2545598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_020564	TAT	2	6	2545625	2545630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_020564	CCA	2	6	2545646	2545651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15053	NC_020564	CGT	2	6	2545658	2545663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_020564	CAAA	2	8	2545680	2545687	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15055	NC_020564	A	7	7	2545685	2545691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_020564	AT	3	6	2545723	2545728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_020564	ATTA	2	8	2546428	2546435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_020564	TAT	2	6	2546463	2546468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_020564	AT	3	6	2546480	2546485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_020564	TAA	2	6	2546538	2546543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_020564	ATT	2	6	2546557	2546562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15062	NC_020564	ATA	2	6	2547070	2547075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_020564	TAACA	2	10	2547103	2547112	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15064	NC_020564	T	6	6	2547162	2547167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_020564	TAG	2	6	2547229	2547234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15066	NC_020564	ATA	2	6	2547275	2547280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15067	NC_020564	ATG	2	6	2547331	2547336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15068	NC_020564	GAT	2	6	2547348	2547353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_020564	ATC	2	6	2547369	2547374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15070	NC_020564	AAG	2	6	2547471	2547476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15071	NC_020564	ATCT	2	8	2547478	2547485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15072	NC_020564	CAGA	2	8	2547499	2547506	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15073	NC_020564	CTT	2	6	2547509	2547514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15074	NC_020564	T	6	6	2547513	2547518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_020564	CT	4	8	2550193	2550200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15076	NC_020564	TTTAT	2	10	2550204	2550213	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15077	NC_020564	ATCAA	2	10	2550270	2550279	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15078	NC_020564	ACT	2	6	2550338	2550343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15079	NC_020564	TGT	2	6	2550346	2550351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_020564	TG	3	6	2550397	2550402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_020564	T	6	6	2550407	2550412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_020564	T	6	6	2550419	2550424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_020564	TATT	2	8	2550487	2550494	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_020564	TTTTGT	2	12	2550495	2550506	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15085	NC_020564	TTA	2	6	2550546	2550551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_020564	AT	3	6	2550555	2550560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15087	NC_020564	ATT	2	6	2550587	2550592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_020564	ATG	2	6	2550611	2550616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_020564	T	7	7	2550641	2550647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_020564	TCTA	2	8	2550764	2550771	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15091	NC_020564	CTT	2	6	2550798	2550803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15092	NC_020564	ATT	2	6	2550812	2550817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_020564	TA	3	6	2550819	2550824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15094	NC_020564	ATG	2	6	2550840	2550845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_020564	TCA	2	6	2550877	2550882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15096	NC_020564	CATT	2	8	2550954	2550961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15097	NC_020564	TATC	2	8	2550979	2550986	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15098	NC_020564	GAT	2	6	2551007	2551012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_020564	T	7	7	2551012	2551018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_020564	AAC	2	6	2552091	2552096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15101	NC_020564	T	6	6	2552124	2552129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_020564	GTC	2	6	2553104	2553109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15103	NC_020564	CTC	2	6	2553111	2553116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15104	NC_020564	TGA	2	6	2553119	2553124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_020564	CTA	2	6	2553128	2553133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15106	NC_020564	TTA	2	6	2553159	2553164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_020564	ATG	2	6	2553192	2553197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_020564	TCAT	2	8	2553265	2553272	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15109	NC_020564	GAT	2	6	2553281	2553286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_020564	AC	3	6	2553480	2553485	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15111	NC_020564	TGA	2	6	2553529	2553534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_020564	CTT	2	6	2553588	2553593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15113	NC_020564	ATT	2	6	2553619	2553624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_020564	TTG	2	6	2553625	2553630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_020564	TCT	2	6	2553667	2553672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15116	NC_020564	CTGT	2	8	2553697	2553704	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15117	NC_020564	CTTG	2	8	2553764	2553771	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15118	NC_020564	TTGA	2	8	2553866	2553873	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_020564	TTG	2	6	2553877	2553882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_020564	TAA	2	6	2553901	2553906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15121	NC_020564	TTTC	2	8	2553994	2554001	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15122	NC_020564	TGT	2	6	2554022	2554027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15123	NC_020564	ATTT	2	8	2554076	2554083	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_020564	TTA	2	6	2554084	2554089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_020564	TTA	2	6	2554121	2554126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15126	NC_020564	TTA	2	6	2554242	2554247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_020564	TCA	2	6	2554248	2554253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15128	NC_020564	AC	3	6	2554254	2554259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15129	NC_020564	CAT	2	6	2554268	2554273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15130	NC_020564	TTCA	2	8	2554375	2554382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15131	NC_020564	TAT	2	6	2556613	2556618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15132	NC_020564	CAA	2	6	2556640	2556645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15133	NC_020564	ATC	2	6	2556661	2556666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15134	NC_020564	ATAA	2	8	2556688	2556695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15135	NC_020564	TTG	2	6	2556716	2556721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15136	NC_020564	TTCAA	2	10	2556746	2556755	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15137	NC_020564	ATGTTT	2	12	2559276	2559287	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15138	NC_020564	T	6	6	2559296	2559301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15139	NC_020564	TAA	2	6	2559344	2559349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15140	NC_020564	TA	3	6	2559366	2559371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15141	NC_020564	ATA	2	6	2559400	2559405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15142	NC_020564	GAA	2	6	2559423	2559428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15143	NC_020564	TAA	2	6	2559444	2559449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15144	NC_020564	TCT	2	6	2559463	2559468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15145	NC_020564	TAAA	2	8	2559504	2559511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15146	NC_020564	CAA	2	6	2559524	2559529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15147	NC_020564	ATG	2	6	2559592	2559597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15149	NC_020564	ATT	2	6	2559622	2559627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15150	NC_020564	TAT	2	6	2559687	2559692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15151	NC_020564	T	7	7	2559723	2559729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15152	NC_020564	CT	3	6	2559761	2559766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15153	NC_020564	A	7	7	2559787	2559793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15160	NC_020564	GAGGT	2	10	2560891	2560900	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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15162	NC_020564	CAT	2	6	2561141	2561146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15164	NC_020564	CTTTT	2	10	2561246	2561255	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15165	NC_020564	AATT	2	8	2561324	2561331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15166	NC_020564	A	6	6	2561361	2561366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15171	NC_020564	A	7	7	2561485	2561491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15172	NC_020564	TTA	2	6	2561537	2561542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15237	NC_020564	GTT	2	6	2574045	2574050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15240	NC_020564	ATGG	2	8	2574189	2574196	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15241	NC_020564	CAT	2	6	2575820	2575825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15243	NC_020564	TAA	2	6	2576567	2576572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15244	NC_020564	AGT	2	6	2576696	2576701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15245	NC_020564	TAC	2	6	2576714	2576719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15246	NC_020564	CATT	2	8	2576725	2576732	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15247	NC_020564	T	6	6	2576731	2576736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15248	NC_020564	ATTA	2	8	2576797	2576804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15249	NC_020564	GTC	2	6	2576880	2576885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15250	NC_020564	ACA	2	6	2576895	2576900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15251	NC_020564	GAT	3	9	2576903	2576911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15252	NC_020564	CATC	2	8	2576917	2576924	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15253	NC_020564	TAA	2	6	2576926	2576931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15254	NC_020564	TCAT	2	8	2577026	2577033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15255	NC_020564	ATTA	2	8	2577046	2577053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15256	NC_020564	CTT	2	6	2577057	2577062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15257	NC_020564	TA	3	6	2577064	2577069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15258	NC_020564	AG	3	6	2577080	2577085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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