MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_020564	AAT	2	6	2459269	2459274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_020564	ATA	2	6	2459303	2459308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_020564	ATT	2	6	2459365	2459370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_020564	T	6	6	2459392	2459397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_020564	TCT	2	6	2459433	2459438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14506	NC_020564	CCT	2	6	2461088	2461093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14507	NC_020564	CCA	2	6	2461703	2461708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14508	NC_020564	CAT	2	6	2463061	2463066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14509	NC_020564	TATG	2	8	2463132	2463139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_020564	TTTG	2	8	2463159	2463166	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14511	NC_020564	ATG	2	6	2463207	2463212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_020564	TTA	2	6	2463213	2463218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_020564	ATT	3	9	2463222	2463230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_020564	T	6	6	2463262	2463267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14515	NC_020564	TAT	2	6	2463279	2463284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14516	NC_020564	GTT	2	6	2463295	2463300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14517	NC_020564	A	6	6	2463308	2463313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_020564	ATT	2	6	2463332	2463337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_020564	TAA	2	6	2463356	2463361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14520	NC_020564	TCA	2	6	2463438	2463443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14521	NC_020564	GACA	2	8	2463527	2463534	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14522	NC_020564	A	7	7	2463540	2463546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_020564	CAAC	2	8	2463547	2463554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14524	NC_020564	GTT	2	6	2463569	2463574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_020564	TGT	3	9	2463590	2463598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_020564	TAT	2	6	2464251	2464256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_020564	AT	3	6	2464255	2464260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_020564	A	6	6	2464272	2464277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_020564	A	6	6	2464308	2464313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_020564	TAT	3	9	2464324	2464332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_020564	ATT	2	6	2464355	2464360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_020564	T	6	6	2464359	2464364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14533	NC_020564	AT	3	6	2466052	2466057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_020564	AC	5	10	2466065	2466074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14535	NC_020564	AACC	2	8	2466078	2466085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14536	NC_020564	TTGG	2	8	2466101	2466108	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_020564	T	6	6	2466109	2466114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_020564	TAAC	2	8	2466136	2466143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14539	NC_020564	AGA	2	6	2466187	2466192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_020564	CAT	2	6	2466194	2466199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14541	NC_020564	ATC	2	6	2466284	2466289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14542	NC_020564	GAT	2	6	2466317	2466322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_020564	AGG	2	6	2466325	2466330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_020564	TAA	2	6	2466332	2466337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_020564	A	6	6	2467706	2467711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_020564	CAAA	2	8	2468956	2468963	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14547	NC_020564	A	6	6	2469002	2469007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14548	NC_020564	TG	3	6	2469008	2469013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14549	NC_020564	TA	4	8	2469025	2469032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14550	NC_020564	TAT	2	6	2469040	2469045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14551	NC_020564	ATA	2	6	2469046	2469051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14552	NC_020564	ATT	2	6	2469084	2469089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_020564	TAA	2	6	2469135	2469140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_020564	CAA	2	6	2469163	2469168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14555	NC_020564	A	6	6	2469176	2469181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_020564	GCAC	2	8	2469182	2469189	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14557	NC_020564	CTC	2	6	2470777	2470782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14558	NC_020564	AT	3	6	2470788	2470793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_020564	TAT	2	6	2470800	2470805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14560	NC_020564	T	7	7	2470811	2470817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14561	NC_020564	A	6	6	2470843	2470848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_020564	A	6	6	2470909	2470914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14563	NC_020564	AAC	2	6	2470970	2470975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14564	NC_020564	TAT	2	6	2470998	2471003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_020564	T	6	6	2472185	2472190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14566	NC_020564	TTA	2	6	2472271	2472276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_020564	TAT	2	6	2472328	2472333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_020564	AAC	2	6	2472355	2472360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14569	NC_020564	TTAA	2	8	2472404	2472411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14570	NC_020564	CTT	2	6	2472482	2472487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14575	NC_020564	CAA	2	6	2472617	2472622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14580	NC_020564	TAT	2	6	2472757	2472762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14581	NC_020564	TCTCTT	2	12	2472768	2472779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14583	NC_020564	TCT	2	6	2472837	2472842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14584	NC_020564	ATT	2	6	2472860	2472865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14585	NC_020564	ATT	2	6	2472872	2472877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14586	NC_020564	ATT	3	9	2472902	2472910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14587	NC_020564	T	6	6	2472915	2472920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14592	NC_020564	A	6	6	2473215	2473220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14593	NC_020564	A	8	8	2473232	2473239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14594	NC_020564	AAATTT	2	12	2473245	2473256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14595	NC_020564	CAT	2	6	2473265	2473270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14596	NC_020564	T	6	6	2473270	2473275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_020564	GACT	2	8	2473321	2473328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14598	NC_020564	TG	3	6	2473868	2473873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_020564	ACT	2	6	2473884	2473889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14601	NC_020564	GCT	2	6	2473923	2473928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14602	NC_020564	ATACA	2	10	2475663	2475672	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14603	NC_020564	TA	3	6	2475695	2475700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_020564	TAT	2	6	2476487	2476492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_020564	TTTA	2	8	2476558	2476565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14606	NC_020564	AG	3	6	2476597	2476602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_020564	AGT	2	6	2476649	2476654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_020564	T	6	6	2476685	2476690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_020564	GAC	2	6	2476718	2476723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14610	NC_020564	AAAT	2	8	2476725	2476732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_020564	CGA	2	6	2478729	2478734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14612	NC_020564	GTG	2	6	2480371	2480376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14613	NC_020564	ATA	2	6	2480398	2480403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14614	NC_020564	AAT	2	6	2480405	2480410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_020564	TAA	2	6	2480441	2480446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14616	NC_020564	ATT	2	6	2483062	2483067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14617	NC_020564	ATT	2	6	2483075	2483080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14618	NC_020564	AAT	2	6	2483114	2483119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14619	NC_020564	T	7	7	2483119	2483125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14620	NC_020564	TAT	2	6	2483127	2483132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14621	NC_020564	TAA	2	6	2484437	2484442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14622	NC_020564	AAGC	2	8	2486169	2486176	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14623	NC_020564	AGA	2	6	2486206	2486211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14625	NC_020564	GTT	2	6	2486411	2486416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14626	NC_020564	TCA	2	6	2486417	2486422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14627	NC_020564	CTT	2	6	2486453	2486458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14628	NC_020564	TTCA	2	8	2486493	2486500	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14629	NC_020564	A	6	6	2486540	2486545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14894	NC_020564	TTAAT	2	10	2514391	2514400	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14895	NC_020564	TCAT	2	8	2514420	2514427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14896	NC_020564	ATA	2	6	2514464	2514469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14897	NC_020564	TAA	2	6	2514485	2514490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14898	NC_020564	AT	3	6	2514497	2514502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14899	NC_020564	GCTA	2	8	2514515	2514522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14900	NC_020564	ATTTTG	2	12	2514549	2514560	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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