MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_020564	AT	3	6	2378715	2378720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_020564	AAAT	2	8	2379864	2379871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_020564	AC	3	6	2379921	2379926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14004	NC_020564	ACA	2	6	2379942	2379947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14005	NC_020564	T	6	6	2379972	2379977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_020564	TAT	2	6	2379989	2379994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_020564	T	6	6	2379994	2379999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_020564	TCA	2	6	2380007	2380012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_020564	CAA	2	6	2380054	2380059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_020564	TG	3	6	2380078	2380083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_020564	GAA	2	6	2380141	2380146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_020564	CAT	2	6	2380159	2380164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14013	NC_020564	TA	3	6	2380191	2380196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_020564	AGA	2	6	2380200	2380205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_020564	AGT	2	6	2380218	2380223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_020564	TAA	2	6	2380255	2380260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_020564	AAACAT	2	12	2380267	2380278	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14018	NC_020564	TG	4	8	2380295	2380302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_020564	TGT	2	6	2380318	2380323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_020564	CT	3	6	2380351	2380356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14021	NC_020564	TAAA	2	8	2380371	2380378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_020564	A	6	6	2380392	2380397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_020564	ATA	2	6	2380407	2380412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_020564	TCC	2	6	2380429	2380434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14025	NC_020564	TAT	2	6	2380464	2380469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_020564	A	6	6	2380479	2380484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_020564	AAATA	2	10	2380561	2380570	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_020564	CGCT	2	8	2380583	2380590	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14029	NC_020564	TAT	2	6	2380609	2380614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_020564	TATT	2	8	2380618	2380625	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_020564	ATTA	2	8	2381910	2381917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_020564	CCT	2	6	2381918	2381923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14033	NC_020564	TGT	2	6	2381952	2381957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_020564	TAT	2	6	2381959	2381964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_020564	TCA	2	6	2381998	2382003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_020564	AGG	2	6	2382050	2382055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_020564	ATTT	2	8	2382059	2382066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_020564	TA	3	6	2382728	2382733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_020564	CCT	2	6	2385216	2385221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14040	NC_020564	TAT	2	6	2385286	2385291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_020564	TA	3	6	2385297	2385302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_020564	CATT	2	8	2385328	2385335	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14043	NC_020564	CTATA	2	10	2385343	2385352	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14044	NC_020564	ATTA	2	8	2385368	2385375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_020564	TAG	2	6	2385801	2385806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_020564	ATCT	2	8	2385852	2385859	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14047	NC_020564	ATG	2	6	2385901	2385906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_020564	AGA	2	6	2385909	2385914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_020564	ATT	2	6	2385963	2385968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_020564	TTG	2	6	2386015	2386020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_020564	TAA	2	6	2386037	2386042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_020564	TAA	2	6	2386077	2386082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_020564	GAT	2	6	2386085	2386090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_020564	TAAT	2	8	2386104	2386111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_020564	AT	3	6	2386114	2386119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_020564	TGA	2	6	2386149	2386154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_020564	TGA	2	6	2386217	2386222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_020564	ATG	2	6	2386231	2386236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_020564	TAATA	2	10	2386238	2386247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_020564	TGT	2	6	2386297	2386302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_020564	GTT	2	6	2386327	2386332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_020564	TTC	2	6	2386392	2386397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14063	NC_020564	GCT	2	6	2386398	2386403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14064	NC_020564	ATG	2	6	2386450	2386455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_020564	TG	3	6	2386479	2386484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_020564	TTG	2	6	2386492	2386497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_020564	ATT	2	6	2386548	2386553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_020564	T	6	6	2386657	2386662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_020564	TTG	3	9	2386697	2386705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_020564	AAT	2	6	2386711	2386716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_020564	CTA	2	6	2386742	2386747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14072	NC_020564	AAG	2	6	2386762	2386767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_020564	TGA	2	6	2386797	2386802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_020564	AAT	2	6	2386825	2386830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_020564	T	6	6	2386865	2386870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_020564	T	7	7	2386900	2386906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_020564	AGTT	2	8	2386940	2386947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_020564	T	6	6	2386966	2386971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_020564	ATTA	2	8	2386996	2387003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_020564	TAATT	2	10	2387013	2387022	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_020564	AT	4	8	2387235	2387242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_020564	GA	4	8	2387250	2387257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_020564	CAT	2	6	2387282	2387287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14085	NC_020564	TAT	2	6	2387323	2387328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_020564	TAA	2	6	2387342	2387347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_020564	GAT	2	6	2389451	2389456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_020564	TAT	2	6	2389523	2389528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_020564	ATA	2	6	2389538	2389543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_020564	TAG	2	6	2389554	2389559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_020564	AT	3	6	2389560	2389565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_020564	ATG	2	6	2389577	2389582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_020564	TA	3	6	2389592	2389597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_020564	CAG	2	6	2389646	2389651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14095	NC_020564	AGT	2	6	2389719	2389724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14097	NC_020564	TGA	2	6	2389838	2389843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_020564	TA	4	8	2389892	2389899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_020564	AC	3	6	2390012	2390017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14100	NC_020564	GT	3	6	2390043	2390048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_020564	AATT	2	8	2390056	2390063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_020564	TGA	2	6	2390139	2390144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_020564	GAAAAA	2	12	2390150	2390161	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_020564	CAT	2	6	2390192	2390197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14105	NC_020564	TGTA	2	8	2390204	2390211	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_020564	ATG	3	9	2390226	2390234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_020564	GAAA	2	8	2390242	2390249	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_020564	ATAC	2	8	2390251	2390258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14109	NC_020564	ATA	2	6	2390275	2390280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_020564	CTA	2	6	2390281	2390286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14111	NC_020564	A	6	6	2390290	2390295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_020564	A	7	7	2390323	2390329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_020564	TTCAGA	2	12	2390342	2390353	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14114	NC_020564	GTTAAA	2	12	2390355	2390366	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_020564	A	6	6	2390364	2390369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_020564	GTTAAA	2	12	2390415	2390426	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_020564	A	6	6	2390424	2390429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_020564	ATG	2	6	2390437	2390442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14119	NC_020564	ATG	2	6	2390460	2390465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14120	NC_020564	AGA	2	6	2390529	2390534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_020564	AGC	2	6	2390542	2390547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14122	NC_020564	CTG	2	6	2390580	2390585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14123	NC_020564	GCAT	2	8	2390637	2390644	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14124	NC_020564	AAC	2	6	2390655	2390660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14125	NC_020564	GCAT	2	8	2390698	2390705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14126	NC_020564	AAC	2	6	2390716	2390721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14127	NC_020564	GCAT	2	8	2390759	2390766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14128	NC_020564	AAC	2	6	2390777	2390782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14129	NC_020564	A	6	6	2392161	2392166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14130	NC_020564	AAT	2	6	2392232	2392237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14242	NC_020564	TTTC	2	8	2413090	2413097	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14243	NC_020564	ACG	2	6	2413155	2413160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14252	NC_020564	A	6	6	2413426	2413431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14253	NC_020564	CAA	2	6	2413447	2413452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14254	NC_020564	A	6	6	2414051	2414056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14255	NC_020564	CCT	2	6	2415662	2415667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14257	NC_020564	ATA	2	6	2415736	2415741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14258	NC_020564	ATA	2	6	2415845	2415850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14259	NC_020564	A	7	7	2415855	2415861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14261	NC_020564	ATG	2	6	2415967	2415972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14262	NC_020564	TGAT	2	8	2416020	2416027	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14263	NC_020564	CTA	2	6	2416032	2416037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14264	NC_020564	TCT	2	6	2416129	2416134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14265	NC_020564	T	7	7	2416141	2416147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14266	NC_020564	CTG	2	6	2416154	2416159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14267	NC_020564	ATTG	2	8	2416265	2416272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14291	NC_020564	TAA	3	9	2417688	2417696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14292	NC_020564	CTA	2	6	2417732	2417737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14293	NC_020564	AACT	2	8	2417747	2417754	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14294	NC_020564	TAAT	2	8	2417762	2417769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14295	NC_020564	ACT	2	6	2417801	2417806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14297	NC_020564	ATAAA	2	10	2417905	2417914	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14379	NC_020564	A	7	7	2429261	2429267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14385	NC_020564	AGAA	2	8	2429353	2429360	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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