MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_020564	ATTG	2	8	2237270	2237277	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_020564	ACATTC	2	12	2237347	2237358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_020564	CTTTTT	2	12	2237376	2237387	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13004	NC_020564	AAT	2	6	2237395	2237400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_020564	AGT	2	6	2237430	2237435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_020564	ATA	2	6	2237484	2237489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_020564	TAAA	2	8	2237542	2237549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_020564	TAAA	2	8	2237551	2237558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_020564	AGT	2	6	2237613	2237618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_020564	CTT	2	6	2237674	2237679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_020564	TGA	2	6	2237697	2237702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_020564	ACA	2	6	2237778	2237783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_020564	TAG	2	6	2237868	2237873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_020564	TAT	2	6	2237877	2237882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_020564	GAT	2	6	2237907	2237912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_020564	ATA	2	6	2237916	2237921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_020564	AAT	2	6	2237928	2237933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_020564	CTT	2	6	2237949	2237954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_020564	ATT	2	6	2237975	2237980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_020564	TTC	2	6	2237990	2237995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_020564	ATC	2	6	2237997	2238002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13022	NC_020564	TAA	2	6	2238088	2238093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_020564	TTG	2	6	2238130	2238135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_020564	ATT	2	6	2238202	2238207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_020564	A	7	7	2238252	2238258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_020564	GATA	2	8	2238276	2238283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_020564	TAAA	2	8	2238299	2238306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_020564	AGA	2	6	2238321	2238326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_020564	GAA	2	6	2238343	2238348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_020564	CATAC	2	10	2238395	2238404	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13031	NC_020564	TAG	2	6	2238406	2238411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_020564	TAT	2	6	2238529	2238534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_020564	CAA	2	6	2238547	2238552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_020564	AAG	2	6	2238557	2238562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_020564	GAC	2	6	2238593	2238598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13036	NC_020564	ATC	2	6	2238626	2238631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_020564	AGG	2	6	2238676	2238681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_020564	A	6	6	2239657	2239662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_020564	AAT	2	6	2239739	2239744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_020564	AC	3	6	2239751	2239756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13041	NC_020564	A	7	7	2239763	2239769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_020564	ATA	2	6	2239779	2239784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_020564	TA	3	6	2239798	2239803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_020564	ACG	2	6	2239839	2239844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_020564	GCT	2	6	2239846	2239851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_020564	T	6	6	2239863	2239868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_020564	AGTA	2	8	2239893	2239900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_020564	TAA	2	6	2239944	2239949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_020564	AGCTTG	2	12	2239974	2239985	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13050	NC_020564	ACC	3	9	2239995	2240003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13051	NC_020564	CAT	2	6	2240021	2240026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_020564	TGGT	2	8	2240055	2240062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_020564	TTA	2	6	2240113	2240118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_020564	ACG	2	6	2240172	2240177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_020564	TCC	2	6	2240215	2240220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13056	NC_020564	GTT	2	6	2240253	2240258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_020564	CCA	2	6	2240282	2240287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13058	NC_020564	T	6	6	2240299	2240304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_020564	TTC	2	6	2240379	2240384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_020564	CAG	2	6	2240394	2240399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_020564	TGAT	2	8	2240400	2240407	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_020564	ACC	2	6	2240413	2240418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13063	NC_020564	GAT	2	6	2240421	2240426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_020564	GTA	2	6	2240437	2240442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_020564	TAA	2	6	2240490	2240495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_020564	GTGTG	2	10	2240521	2240530	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_020564	AGAT	2	8	2240556	2240563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_020564	TGA	2	6	2240572	2240577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_020564	ATA	2	6	2240663	2240668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_020564	TCC	2	6	2240673	2240678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13071	NC_020564	A	6	6	2240680	2240685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_020564	GAT	2	6	2240729	2240734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_020564	ATTT	2	8	2240768	2240775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_020564	TGT	2	6	2240783	2240788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_020564	TA	3	6	2240800	2240805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_020564	TAA	2	6	2240864	2240869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_020564	CAT	2	6	2243293	2243298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13078	NC_020564	TC	4	8	2244178	2244185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13079	NC_020564	TATC	2	8	2244200	2244207	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13080	NC_020564	TA	3	6	2244258	2244263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_020564	GTT	2	6	2244302	2244307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_020564	AAC	2	6	2244309	2244314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13083	NC_020564	CT	3	6	2244336	2244341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13084	NC_020564	TAA	2	6	2244361	2244366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_020564	GGT	2	6	2244390	2244395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_020564	ATA	2	6	2244412	2244417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_020564	TTCA	2	8	2244425	2244432	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13088	NC_020564	A	6	6	2244485	2244490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_020564	A	6	6	2244553	2244558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_020564	GC	3	6	2244559	2244564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13091	NC_020564	CAT	2	6	2244569	2244574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_020564	TTG	2	6	2244579	2244584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_020564	TTTA	2	8	2244602	2244609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_020564	TA	3	6	2244678	2244683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_020564	AGT	2	6	2244686	2244691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_020564	TA	3	6	2244701	2244706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_020564	CGA	2	6	2244752	2244757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_020564	ACC	2	6	2244784	2244789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13099	NC_020564	AAT	2	6	2244824	2244829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_020564	ACG	2	6	2244901	2244906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13101	NC_020564	T	6	6	2244922	2244927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_020564	CAA	2	6	2244948	2244953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_020564	CTT	2	6	2244963	2244968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_020564	TAA	3	9	2245002	2245010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_020564	CCT	2	6	2245088	2245093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13106	NC_020564	TCC	2	6	2246049	2246054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13107	NC_020564	TA	3	6	2246056	2246061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_020564	CAT	2	6	2246107	2246112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_020564	ACG	3	9	2246122	2246130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_020564	TGG	2	6	2246134	2246139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_020564	TGC	2	6	2246317	2246322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_020564	T	6	6	2246335	2246340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_020564	TGA	2	6	2246368	2246373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_020564	TCA	2	6	2246396	2246401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_020564	GTT	2	6	2246419	2246424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_020564	TG	3	6	2246439	2246444	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_020564	CCT	2	6	2246516	2246521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13118	NC_020564	TAT	2	6	2246527	2246532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_020564	T	6	6	2246532	2246537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_020564	CG	3	6	2246575	2246580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13121	NC_020564	T	6	6	2246591	2246596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_020564	ACG	2	6	2246616	2246621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_020564	ATG	2	6	2246639	2246644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_020564	AGTT	2	8	2246672	2246679	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_020564	ACG	2	6	2246682	2246687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13126	NC_020564	TCA	2	6	2246743	2246748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13127	NC_020564	CTT	2	6	2246786	2246791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13128	NC_020564	T	6	6	2246798	2246803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_020564	TA	4	8	2246827	2246834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_020564	CT	3	6	2246907	2246912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13131	NC_020564	TTA	2	6	2246914	2246919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13132	NC_020564	TTTG	2	8	2246928	2246935	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13133	NC_020564	CTTTAC	2	12	2246964	2246975	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13134	NC_020564	TAT	2	6	2247046	2247051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13135	NC_020564	ATT	2	6	2247061	2247066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13138	NC_020564	AATT	2	8	2247387	2247394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13139	NC_020564	ATCT	2	8	2247414	2247421	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13140	NC_020564	CCT	2	6	2248127	2248132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13148	NC_020564	ACC	2	6	2249735	2249740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13149	NC_020564	ATTTC	2	10	2249863	2249872	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13150	NC_020564	CCT	2	6	2249877	2249882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13151	NC_020564	ATT	2	6	2249885	2249890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13152	NC_020564	TCT	2	6	2249893	2249898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13173	NC_020564	TGTCAT	2	12	2251941	2251952	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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13187	NC_020564	T	6	6	2252806	2252811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13246	NC_020564	T	6	6	2255718	2255723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13247	NC_020564	CGA	2	6	2255738	2255743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13253	NC_020564	CTT	2	6	2256727	2256732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13254	NC_020564	TCT	2	6	2256752	2256757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13255	NC_020564	TTTG	2	8	2256758	2256765	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13256	NC_020564	T	6	6	2256791	2256796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13260	NC_020564	CTT	2	6	2257622	2257627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13261	NC_020564	CCT	2	6	2258302	2258307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13286	NC_020564	ATT	2	6	2259185	2259190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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