MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_020564	ATC	3	9	1543956	1543964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_020564	TTGTT	2	10	1543971	1543980	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_020564	TTCA	2	8	1543992	1543999	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8504	NC_020564	ATA	2	6	1544056	1544061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_020564	TAA	2	6	1544073	1544078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_020564	TAA	2	6	1544201	1544206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_020564	TTTA	2	8	1544331	1544338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_020564	TTTG	2	8	1544456	1544463	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_020564	TA	4	8	1544510	1544517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_020564	TCT	2	6	1544523	1544528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_020564	AAT	2	6	1544701	1544706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_020564	CCT	2	6	1544730	1544735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8513	NC_020564	GTTT	2	8	1546574	1546581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_020564	TTCAA	2	10	1546615	1546624	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8515	NC_020564	TAA	2	6	1546670	1546675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_020564	TTAAA	2	10	1546685	1546694	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_020564	TATT	2	8	1546705	1546712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_020564	TAT	2	6	1546792	1546797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_020564	CAA	2	6	1546808	1546813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8520	NC_020564	AT	3	6	1546826	1546831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_020564	T	6	6	1546851	1546856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_020564	ATT	2	6	1546893	1546898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_020564	TAAAAA	2	12	1546900	1546911	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_020564	TCC	2	6	1547594	1547599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8525	NC_020564	TTA	2	6	1548676	1548681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_020564	CCT	2	6	1548682	1548687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8527	NC_020564	ATA	2	6	1548725	1548730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_020564	ATA	2	6	1548733	1548738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_020564	A	6	6	1548744	1548749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_020564	TAATA	2	10	1549379	1549388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_020564	TTA	2	6	1549402	1549407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_020564	TGC	2	6	1549409	1549414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8533	NC_020564	T	6	6	1549447	1549452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_020564	TAT	2	6	1549493	1549498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_020564	TAT	2	6	1549509	1549514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_020564	TTC	2	6	1549515	1549520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_020564	AGA	2	6	1549581	1549586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_020564	A	7	7	1549595	1549601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_020564	T	6	6	1549640	1549645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_020564	TAAT	2	8	1550530	1550537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_020564	AAT	3	9	1550553	1550561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_020564	ATTAT	2	10	1550611	1550620	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_020564	GGA	2	6	1550632	1550637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_020564	AAT	2	6	1550667	1550672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_020564	ATT	2	6	1550686	1550691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_020564	CAA	2	6	1550707	1550712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8547	NC_020564	AG	3	6	1550794	1550799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_020564	TGACTA	2	12	1550805	1550816	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8549	NC_020564	GCTA	2	8	1550923	1550930	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8550	NC_020564	GGC	2	6	1550986	1550991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8551	NC_020564	A	6	6	1550995	1551000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_020564	A	6	6	1551022	1551027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_020564	TAA	2	6	1551055	1551060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_020564	ATC	2	6	1551078	1551083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8555	NC_020564	T	6	6	1551106	1551111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_020564	ATA	2	6	1551169	1551174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_020564	A	6	6	1551220	1551225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_020564	AAT	2	6	1551249	1551254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_020564	TTA	2	6	1551270	1551275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_020564	AAT	3	9	1551363	1551371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_020564	TAT	2	6	1555400	1555405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_020564	TAA	2	6	1555426	1555431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_020564	CTT	2	6	1556010	1556015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8564	NC_020564	AACAA	2	10	1556021	1556030	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8565	NC_020564	TTATAG	2	12	1556033	1556044	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_020564	TA	3	6	1556058	1556063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_020564	AAAT	2	8	1556114	1556121	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_020564	TA	3	6	1556166	1556171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_020564	TAA	2	6	1556181	1556186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8571	NC_020564	CTT	2	6	1556750	1556755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8572	NC_020564	TTC	2	6	1556759	1556764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8573	NC_020564	TTA	2	6	1556766	1556771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_020564	GTC	2	6	1556784	1556789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8579	NC_020564	TTC	2	6	1556954	1556959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8598	NC_020564	AT	3	6	1557668	1557673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_020564	CAA	2	6	1558652	1558657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8600	NC_020564	TTG	2	6	1558685	1558690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8602	NC_020564	CTT	2	6	1558709	1558714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8603	NC_020564	ATTA	2	8	1559670	1559677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_020564	A	7	7	1559698	1559704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8613	NC_020564	AT	3	6	1560636	1560641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8615	NC_020564	CAA	2	6	1560688	1560693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8628	NC_020564	AATTTA	2	12	1564068	1564079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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