MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_020564	GT	3	6	1129905	1129910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_020564	TTA	2	6	1129920	1129925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_020564	GTAT	2	8	1129928	1129935	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_020564	ATT	2	6	1130033	1130038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_020564	ATG	2	6	1130047	1130052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_020564	AT	3	6	1130130	1130135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_020564	AAAC	2	8	1130138	1130145	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6508	NC_020564	A	6	6	1130179	1130184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_020564	ACT	2	6	1130223	1130228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_020564	AAG	2	6	1130267	1130272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_020564	AAT	2	6	1130273	1130278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_020564	A	6	6	1130296	1130301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_020564	T	7	7	1130325	1130331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_020564	AAT	2	6	1130405	1130410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_020564	ATA	3	9	1130411	1130419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_020564	TTAA	2	8	1130517	1130524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_020564	TG	3	6	1130558	1130563	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_020564	A	6	6	1130566	1130571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_020564	CAT	2	6	1130645	1130650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_020564	CAAAA	2	10	1130668	1130677	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6521	NC_020564	TTTG	2	8	1130702	1130709	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_020564	GGGA	2	8	1130742	1130749	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_020564	CCGA	2	8	1130759	1130766	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6524	NC_020564	AAC	2	6	1130816	1130821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_020564	ATT	2	6	1130828	1130833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_020564	TAAA	2	8	1130867	1130874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_020564	A	6	6	1130872	1130877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_020564	TAT	2	6	1130894	1130899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_020564	TTTCT	2	10	1130991	1131000	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6530	NC_020564	TGT	2	6	1131031	1131036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_020564	AAAC	2	8	1131043	1131050	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6532	NC_020564	ATTT	2	8	1131063	1131070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_020564	AAC	3	9	1131077	1131085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_020564	AAATTT	2	12	1131146	1131157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_020564	TTTA	2	8	1131181	1131188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_020564	GCA	2	6	1131212	1131217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_020564	TAA	2	6	1131220	1131225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_020564	TTA	2	6	1131281	1131286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_020564	ATT	2	6	1131292	1131297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_020564	GTAA	2	8	1131322	1131329	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_020564	TAT	2	6	1131334	1131339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_020564	GA	3	6	1131353	1131358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_020564	CAA	2	6	1131409	1131414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_020564	ATT	2	6	1131483	1131488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_020564	TAATA	2	10	1131496	1131505	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_020564	TTTAT	2	10	1131560	1131569	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_020564	AAT	2	6	1132322	1132327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_020564	ATT	2	6	1132417	1132422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_020564	CAT	2	6	1132446	1132451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_020564	ATG	2	6	1132489	1132494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_020564	ATCA	2	8	1132561	1132568	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6552	NC_020564	ATA	3	9	1132620	1132628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_020564	TA	3	6	1132627	1132632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_020564	TTC	2	6	1132657	1132662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_020564	T	7	7	1132672	1132678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_020564	ATCA	2	8	1132747	1132754	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6557	NC_020564	TTG	2	6	1132790	1132795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_020564	AAT	2	6	1132817	1132822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_020564	TAAT	2	8	1132835	1132842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_020564	TAC	2	6	1132889	1132894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_020564	TAT	3	9	1132895	1132903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_020564	A	6	6	1133054	1133059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_020564	T	7	7	1134720	1134726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_020564	T	6	6	1134728	1134733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_020564	AAAT	2	8	1134735	1134742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_020564	GTG	2	6	1134764	1134769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_020564	TA	4	8	1134793	1134800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_020564	AGGTG	2	10	1134801	1134810	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_020564	A	6	6	1134813	1134818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_020564	ATC	2	6	1134837	1134842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6571	NC_020564	TAT	2	6	1134907	1134912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_020564	A	7	7	1135000	1135006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_020564	TTC	2	6	1135031	1135036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6577	NC_020564	GGA	2	6	1135253	1135258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6580	NC_020564	CAA	2	6	1136274	1136279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_020564	AGA	2	6	1136299	1136304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_020564	TTC	2	6	1136513	1136518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6583	NC_020564	GTA	2	6	1136590	1136595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6585	NC_020564	TTGT	2	8	1138973	1138980	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6587	NC_020564	TTTA	2	8	1139053	1139060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_020564	ATA	2	6	1139073	1139078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_020564	A	6	6	1139090	1139095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_020564	AAG	2	6	1139105	1139110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6593	NC_020564	AGG	2	6	1144310	1144315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_020564	AT	4	8	1145504	1145511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_020564	AAT	2	6	1145517	1145522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6598	NC_020564	T	7	7	1145556	1145562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_020564	ATT	2	6	1145649	1145654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_020564	TTATA	2	10	1145685	1145694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_020564	ATT	2	6	1145697	1145702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_020564	AAATG	2	10	1145732	1145741	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_020564	AGG	2	6	1146551	1146556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_020564	GCTA	2	8	1147825	1147832	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6605	NC_020564	TGT	2	6	1147855	1147860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_020564	TAT	2	6	1147868	1147873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_020564	TA	3	6	1147885	1147890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_020564	AGGT	2	8	1147929	1147936	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_020564	T	6	6	1147939	1147944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_020564	AT	3	6	1147952	1147957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_020564	ATC	2	6	1148014	1148019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6612	NC_020564	TAT	2	6	1148043	1148048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_020564	AGG	2	6	1149001	1149006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_020564	TAAA	2	8	1149636	1149643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_020564	ATGT	2	8	1149711	1149718	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_020564	TAATG	2	10	1149746	1149755	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_020564	TAA	2	6	1149775	1149780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_020564	GGT	2	6	1149782	1149787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_020564	TTTAA	2	10	1149807	1149816	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_020564	T	6	6	1149824	1149829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_020564	GAT	2	6	1152632	1152637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_020564	CT	3	6	1152649	1152654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6623	NC_020564	TGT	2	6	1152664	1152669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_020564	ATG	2	6	1152683	1152688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_020564	AG	3	6	1152690	1152695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_020564	T	7	7	1152696	1152702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_020564	A	7	7	1152709	1152715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_020564	A	6	6	1152742	1152747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_020564	TAAAA	2	10	1152760	1152769	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_020564	ATT	2	6	1152770	1152775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6631	NC_020564	AAGTAA	2	12	1152851	1152862	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6632	NC_020564	GA	3	6	1152946	1152951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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